More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0098 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0098  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
279 aa  570  1.0000000000000001e-162  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000252188  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3623  MerR family transcriptional regulator  28.73 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  30.57 
 
 
272 aa  112  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  26.91 
 
 
272 aa  106  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  27.86 
 
 
276 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  27.86 
 
 
276 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
276 aa  96.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
276 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  27.5 
 
 
276 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0705  transcriptional regulator, MerR family  22.86 
 
 
278 aa  89.7  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
276 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  26.64 
 
 
276 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  26.28 
 
 
276 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  26.07 
 
 
276 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 
276 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  28.52 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1361  transcriptional regulator, MerR family  27.72 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000180624  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1410  MerR family transcriptional regulator  24.38 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  21.32 
 
 
264 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  29.68 
 
 
267 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  27.45 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  29.22 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  23.75 
 
 
258 aa  60.1  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
270 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  40.96 
 
 
280 aa  59.7  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
261 aa  59.7  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
269 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
281 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  29.87 
 
 
148 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  29.87 
 
 
148 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  29.13 
 
 
269 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
269 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
343 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3291  MerR family transcriptional regulator  23.4 
 
 
289 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  35.85 
 
 
247 aa  57.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  22.93 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  30.71 
 
 
269 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  29.13 
 
 
269 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0082  MerR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
118 aa  57  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
267 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
267 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0088  MerR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
118 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
343 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
237 aa  57  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  37.68 
 
 
361 aa  56.6  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 
254 aa  56.2  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0082  MerR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
118 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2659  transcriptional regulator, MerR family  32 
 
 
246 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.587322  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  30.19 
 
 
342 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2794  MerR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
181 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 
141 aa  55.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
280 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
342 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0088  MerR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
118 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  21.72 
 
 
276 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
269 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  27.19 
 
 
274 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
257 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
269 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0085  transcriptional regulator, MerR family  32.61 
 
 
118 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  30.77 
 
 
278 aa  54.7  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
245 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  44.26 
 
 
243 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
267 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
241 aa  53.9  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  29.17 
 
 
271 aa  53.9  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
253 aa  53.9  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  44.26 
 
 
244 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  40.79 
 
 
253 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4267  MerR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
118 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
251 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  44.26 
 
 
244 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
251 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  33.75 
 
 
252 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  45 
 
 
243 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  30.39 
 
 
314 aa  53.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  28.35 
 
 
269 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  29.13 
 
 
334 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3105  transcriptional regulator, MerR family  28.93 
 
 
255 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154295  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  31.53 
 
 
154 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  34.29 
 
 
270 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 
272 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
343 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  29.73 
 
 
275 aa  53.1  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  44.26 
 
 
243 aa  52.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  44.26 
 
 
243 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  32.47 
 
 
259 aa  52.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0275  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 
107 aa  52.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.524855  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  36.23 
 
 
286 aa  52.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
343 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  35.63 
 
 
293 aa  52.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2797  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 
255 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0226  transcriptional regulator, MerR family  32.04 
 
 
276 aa  52.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814651  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  26.27 
 
 
290 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3106  regulator of pmrA, putative  29.17 
 
 
257 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
288 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1657  transcriptional regulator, MerR family  33.68 
 
 
272 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>