216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0094 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0094  DegV family protein  100 
 
 
288 aa  594  1e-169  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0951  degV family protein  38.99 
 
 
284 aa  215  5e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000125463 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  29.71 
 
 
281 aa  119  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  29.71 
 
 
281 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  27.37 
 
 
287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  26.69 
 
 
280 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  26.69 
 
 
280 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  26.69 
 
 
287 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  26.69 
 
 
287 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  26.86 
 
 
282 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  26.86 
 
 
282 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  26.69 
 
 
280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  27.37 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  27.4 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  27.01 
 
 
280 aa  109  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  25.98 
 
 
280 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  26.62 
 
 
280 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  26.62 
 
 
280 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  27.01 
 
 
280 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  26.28 
 
 
280 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  27.3 
 
 
280 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  26.64 
 
 
280 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  26.64 
 
 
280 aa  105  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  26.64 
 
 
280 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  28.52 
 
 
279 aa  105  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  28.52 
 
 
279 aa  105  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  26.64 
 
 
280 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  26.64 
 
 
280 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  26.64 
 
 
280 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  28.32 
 
 
279 aa  103  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  26.35 
 
 
282 aa  101  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  31.34 
 
 
280 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  26.64 
 
 
284 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1014  hypothetical protein  28.93 
 
 
282 aa  99.8  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1267  degV family protein  25.36 
 
 
311 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  24.74 
 
 
286 aa  96.7  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2064  hypothetical protein  25.86 
 
 
289 aa  95.9  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0791292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  25.18 
 
 
281 aa  95.9  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  30.65 
 
 
312 aa  95.9  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  25 
 
 
310 aa  95.9  7e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  25.72 
 
 
280 aa  95.5  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1009  hypothetical protein  26.04 
 
 
295 aa  94.7  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000831785  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  25 
 
 
311 aa  94  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  26.16 
 
 
279 aa  92.4  7e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  26.71 
 
 
280 aa  92.4  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  26.16 
 
 
279 aa  91.7  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  26.52 
 
 
279 aa  92  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0772  degV family protein  26.71 
 
 
280 aa  89.4  6e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  24.3 
 
 
285 aa  89.4  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1362  degV family protein  27.27 
 
 
288 aa  89  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0445178  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  24.24 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0933  degV family protein  26.42 
 
 
292 aa  88.2  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  24.56 
 
 
293 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  25 
 
 
285 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0362  degV family protein  27.76 
 
 
288 aa  87  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1324  degV family protein  27.27 
 
 
288 aa  87.4  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165489  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0910  hypothetical protein  25.45 
 
 
285 aa  86.7  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104198 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  23.94 
 
 
292 aa  86.7  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  24.82 
 
 
281 aa  86.7  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3275  degV family protein  25.62 
 
 
292 aa  86.3  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632597  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0521  hypothetical protein  25 
 
 
278 aa  85.5  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  25 
 
 
287 aa  85.5  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  29.28 
 
 
279 aa  85.5  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1266  degV family protein  24.52 
 
 
276 aa  85.5  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  26.47 
 
 
281 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  27.24 
 
 
281 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  25.18 
 
 
277 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  26.09 
 
 
282 aa  84.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1342  DegV family protein  24.47 
 
 
282 aa  84  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  26.38 
 
 
283 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  25 
 
 
279 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  25.18 
 
 
281 aa  83.6  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  21.86 
 
 
280 aa  83.2  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1430  degV family protein  25.73 
 
 
827 aa  82.4  0.000000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  25.88 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  25.36 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0758  hypothetical protein  26.79 
 
 
284 aa  82  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.642534  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0773  degV family protein  26.46 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0790  degV family protein  26.46 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0678582  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2628  degV family protein  25.7 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.108949  decreased coverage  0.000000230039 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  23.57 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  24.47 
 
 
281 aa  81.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0171  DegV family protein  22.3 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  24.83 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1346  degV family protein  24.56 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000423289  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1056  degV family protein  24.38 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1656  hypothetical protein  25 
 
 
281 aa  79.7  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  26.09 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  22.86 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  25.29 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  22.7 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  22.7 
 
 
279 aa  79  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2726  degV family protein  25 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.131746  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2472  degV family protein  25 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00728292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2436  hypothetical protein  25 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2398  hypothetical protein  25 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.419302  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2653  degV family protein  25 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3343  degV family protein  24.74 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000215363  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2671  degV family protein  25 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000678486 
 
 
-
 
NC_002936  DET1032  degV family protein  23.67 
 
 
284 aa  78.2  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.185654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>