More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0064 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0064  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 266 aa  537  9.999999999999999e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0275  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1130  flagellar biosynthesis protein FlhA  28.44 
 
 		 679 aa  65.5  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  24.55 
 
 		 692 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2022  flagellar biosynthesis protein FlhA  28.25 
 
 		 681 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  25.75 
 
 		 689 aa  61.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  49.18 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  49.15 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  37.21 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  35.9 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  32.69 
 
 		 364 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  33.03 
 
 		 374 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 374 aa  59.3  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  24.37 
 
 		 696 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1516  flagellar biosynthesis protein FlhA  24.39 
 
 		 700 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  33.03 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  33.03 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  33.03 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  33.03 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 183 aa  58.5  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  42.03 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  33.03 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1410  flagellar biosynthesis protein FlhA  24.54 
 
 		 682 aa  57.4  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2158  flagellar biosynthesis protein FlhA  24.39 
 
 		 690 aa  58.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0761  flagellar biosynthesis protein FlhA  26.51 
 
 		 696 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417775  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  38.82 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  47.69 
 
 		 293 aa  57  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1638  flagellar biosynthesis protein FlhA  25.62 
 
 		 692 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.885636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  57  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  28.8 
 
 		 361 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  48.44 
 
 		 436 aa  57  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1162  flagellar biosynthesis protein FlhA  23.5 
 
 		 694 aa  56.2  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0159  flagellar biosynthesis protein FlhA  25.42 
 
 		 676 aa  55.8  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.533108  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  36.71 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  23.58 
 
 		 690 aa  56.2  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2153  flagellar biosynthesis protein FlhA  25.45 
 
 		 678 aa  55.8  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  31.86 
 
 		 374 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1451  flagellar biosynthesis protein FlhA  25.5 
 
 		 699 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2031  flagellar biosynthesis protein FlhA  24.66 
 
 		 674 aa  55.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0790  flagellar biosynthesis protein FlhA  24.53 
 
 		 690 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000500888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3054  flagellar biosynthesis protein FlhA  25.5 
 
 		 699 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.921062  normal  0.080885 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2922  flagellar biosynthesis protein FlhA  25.5 
 
 		 699 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.268541  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  25.5 
 
 		 699 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  25.5 
 
 		 699 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2562  flagellar biosynthesis protein FlhA  25.5 
 
 		 699 aa  55.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 118 aa  55.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  25.67 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  25.5 
 
 		 699 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2912  flagellar biosynthesis protein FlhA  25.5 
 
 		 699 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0055  flagellar biosynthesis protein FlhA  22.83 
 
 		 698 aa  53.9  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  39.19 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  24.76 
 
 		 694 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1310  flagellar biosynthesis protein FlhA  27.09 
 
 		 692 aa  54.3  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.933985  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1340  flagellar biosynthesis protein FlhA  25 
 
 		 699 aa  53.9  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 348 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3040  flagellar biosynthesis protein FlhA  25.37 
 
 		 708 aa  54.3  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  38.89 
 
 		 327 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 380 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  43.33 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3213  flagellar biosynthesis protein FlhA  25 
 
 		 699 aa  53.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  45.76 
 
 		 328 aa  53.5  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2283  flagellar biosynthesis protein FlhA  25.5 
 
 		 699 aa  53.9  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  35.29 
 
 		 92 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0034  flagellar biosynthesis protein, FlhA  21.29 
 
 		 704 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  35.29 
 
 		 149 aa  52.8  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1916  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 128 aa  52.8  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0812721  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 163 aa  53.1  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 200 aa  53.1  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1618  flagellar biosynthesis protein FlhA  20.79 
 
 		 702 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0469489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  35.29 
 
 		 149 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.66 
 
 		 690 aa  52.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 149 aa  52.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  35.29 
 
 		 149 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  38.24 
 
 		 143 aa  52  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 142 aa  52.4  0.000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2733  helix-turn-helix domain-containing protein  40.32 
 
 		 115 aa  52  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000416248  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  35.29 
 
 		 149 aa  52  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0156  flagellar biosynthesis protein FlhA  40 
 
 		 703 aa  52  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.391831 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4413  flagellar biosynthesis protein FlhA  24.08 
 
 		 693 aa  52.4  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1172  transcriptional regulator, XRE family  31.19 
 
 		 372 aa  52  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.38155 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 198 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06250  predicted transcriptional regulator  42.37 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 145 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  45.61 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  22.69 
 
 		 698 aa  51.6  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 115 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1196  flagellar biosynthesis protein FlhA  24.5 
 
 		 699 aa  51.6  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  23.68 
 
 		 686 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3093  flagellar biosynthesis protein FlhA  22.44 
 
 		 694 aa  51.6  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.753258  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3820  flagellar biosynthesis protein FlhA  22.44 
 
 		 694 aa  51.6  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.136206 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  35.29 
 
 		 149 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 146 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 206 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 185 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0599  flagellar biosynthesis protein FlhA  22.44 
 
 		 699 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  21.76 
 
 		 695 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>