133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0059 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0059  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  100 
 
 
278 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1258  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  39.13 
 
 
280 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4273  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  23.19 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1525  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  23.76 
 
 
278 aa  67  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2413  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  25.75 
 
 
276 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0920  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  23.08 
 
 
288 aa  65.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.815419  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0777  xanthine dehydrogenase, FAD-binding protein, putative  23.08 
 
 
288 aa  65.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2224  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  26.33 
 
 
289 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.844941  hitchhiker  0.000850669 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4157  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  21.72 
 
 
292 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.533292 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4663  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  21.51 
 
 
276 aa  63.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3000  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  21.72 
 
 
292 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02700  xanthine dehydrogenase, FAD-binding subunit  21.35 
 
 
292 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0825  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  21.35 
 
 
292 aa  62  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02662  hypothetical protein  21.35 
 
 
292 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3027  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  21.35 
 
 
292 aa  62  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0841  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  21.35 
 
 
292 aa  62  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0739  4-hydroxybenzoyl-CoA reductase, beta subunit  24.65 
 
 
327 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2836  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding protein  22.73 
 
 
289 aa  60.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0853655  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3041  xanthine dehydrogenase, small subunit  25 
 
 
515 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0266852 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0530  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  27.01 
 
 
289 aa  60.1  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2698  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  23.94 
 
 
275 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0195145  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2699  xanthine dehydrogenase small subunit  24.23 
 
 
499 aa  59.3  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0889  glyceraldehyde oxidoreductase medium chain  25.71 
 
 
271 aa  58.9  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3192  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  20.97 
 
 
292 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0950  xanthine dehydrogenase, subunit A  25.85 
 
 
543 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2232  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  25.21 
 
 
288 aa  58.9  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.894157  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0448  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  25.78 
 
 
282 aa  58.5  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.221209  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4104  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  22.01 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3968  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  22.63 
 
 
284 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0415  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  21.22 
 
 
284 aa  57  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1871  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding protein  23.48 
 
 
287 aa  56.6  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00397526  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4499  xanthine dehydrogenase small subunit  25.44 
 
 
496 aa  56.2  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.999061  normal  0.0980927 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22290  xanthine dehydrogenase, small subunit  24.63 
 
 
496 aa  55.8  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1733  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  25.48 
 
 
292 aa  55.5  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4923  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  22.88 
 
 
285 aa  55.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2603  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  22.76 
 
 
468 aa  55.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2704  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  20.38 
 
 
487 aa  55.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1562  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  23.18 
 
 
289 aa  55.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.915322 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1819  medium FAD-binding subunit of molybdenum enzyme  24.1 
 
 
280 aa  55.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3660  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  24.29 
 
 
484 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807153  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1013  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  22.09 
 
 
327 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.815839 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13130  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  24.28 
 
 
284 aa  53.9  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3595  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  22.61 
 
 
288 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232061  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2176  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  22.02 
 
 
275 aa  53.1  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3389  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  23.05 
 
 
286 aa  53.1  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0609  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  25.19 
 
 
278 aa  52.8  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.515011  normal  0.94537 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1747  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  27.59 
 
 
287 aa  52.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.795465  normal  0.613894 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0713  xanthine dehydrogenase, small subunit  23.91 
 
 
512 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1590  xanthine dehydrogenase, small subunit  24.55 
 
 
484 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.597851 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2020  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  24.57 
 
 
292 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2764  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  27.1 
 
 
291 aa  52.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000220689  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3842  xanthine dehydrogenase, small subunit  24.55 
 
 
484 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.977655  normal  0.775119 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0238  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  24.18 
 
 
278 aa  51.6  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4278  xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  24.55 
 
 
484 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.513605  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4236  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  22.22 
 
 
285 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2635  carbon monoxide dehydrogenase medium subunit  23.92 
 
 
300 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3604  xanthine dehydrogenase, small subunit  25 
 
 
484 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.703198  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0093  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  22 
 
 
265 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.398559  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02515  putative xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  27.51 
 
 
480 aa  52  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3074  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  21.64 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1766  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  25.19 
 
 
282 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4317  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  22.22 
 
 
286 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1453  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  20.85 
 
 
461 aa  50.4  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0594  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  22.46 
 
 
283 aa  50.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0836  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  21.78 
 
 
304 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2539  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  24.04 
 
 
287 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0444448  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3809  xanthine dehydrogenase  23.98 
 
 
484 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2153  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  22.27 
 
 
292 aa  50.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.891805 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1788  xanthine dehydrogenase, small subunit  24.51 
 
 
467 aa  49.7  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.350368  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1210  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  21.72 
 
 
284 aa  49.7  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0358548  normal  0.452165 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0473  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  22.57 
 
 
276 aa  49.3  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1035  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  23.91 
 
 
506 aa  49.3  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.22588  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3133  xanthine dehydrogenase, small subunit  21.79 
 
 
488 aa  48.9  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207802  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2010  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  23.47 
 
 
284 aa  48.9  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2837  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  22.11 
 
 
288 aa  48.9  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0029  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  21.91 
 
 
288 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.275591 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0607  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  21.77 
 
 
295 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0433  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  23.21 
 
 
450 aa  48.5  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.649108  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0728  xanthine dehydrogenase, small subunit  21.58 
 
 
527 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2774  xanthine dehydrogenase, FAD-binding protein, putative  23.84 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1360  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  22.1 
 
 
291 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277831  normal  0.0179575 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0348  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  21.79 
 
 
528 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0658875  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0832  2Fe-2S ferredoxin, iron-sulfur binding site  21.79 
 
 
528 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0804  xanthine dehydrogenase, small subunit  21.43 
 
 
523 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5443  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  24.65 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465683  normal  0.297557 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0711  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  21.58 
 
 
520 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2511  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  22.6 
 
 
325 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2751  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  23.26 
 
 
479 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433722  normal  0.51663 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1738  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  23.55 
 
 
305 aa  47  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3720  xanthine dehydrogenase, small subunit  22.32 
 
 
493 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1523  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  21.71 
 
 
328 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.783688  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0193  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  25.74 
 
 
273 aa  46.6  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0647  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  28.78 
 
 
287 aa  46.6  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0669  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  22.22 
 
 
272 aa  46.6  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.230541  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0974  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  23.05 
 
 
286 aa  46.6  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00101197  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0552  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  22.03 
 
 
288 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0728  FAD-binding protein, putative  26.12 
 
 
281 aa  45.8  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254128  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1130  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  22.81 
 
 
507 aa  46.2  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.16283  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2833  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  23.48 
 
 
492 aa  45.8  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0202  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  21.53 
 
 
332 aa  45.8  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.955618  hitchhiker  0.00748025 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>