125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0033 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0033  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  100 
 
 		 247 aa  497  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1338  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  37.2 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0504  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  33.75 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  22.4 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  24.61 
 
 		 325 aa  78.6  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  26.92 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  26.7 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  24.08 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  25.96 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  26.37 
 
 		 309 aa  75.5  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  25.75 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  25.24 
 
 		 323 aa  72.4  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  25.27 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  25.27 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  25.27 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  25.81 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  21.43 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  23.08 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  24.73 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  24.06 
 
 		 310 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  24.88 
 
 		 327 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1814  type II secretion system protein  21.78 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0127821  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  22.68 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  24.73 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  25.61 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  24.44 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  24.05 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  23.01 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  24.19 
 
 		 325 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  22.7 
 
 		 310 aa  65.5  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  24.73 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  23.89 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0881  type II secretion system protein  25.36 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  24.86 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  24.3 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  21.88 
 
 		 660 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  21.68 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  24.75 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  23.89 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  26.43 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  23.08 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  24.39 
 
 		 279 aa  62  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  24.87 
 
 		 321 aa  62  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  21.76 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  22.58 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  24.7 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  19.89 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  22.63 
 
 		 328 aa  58.9  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  22.27 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0645  type II secretion system protein  18.69 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  20.55 
 
 		 317 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  20.73 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1755  type II secretion system protein  23.6 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0468876  normal  0.156837 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  22 
 
 		 323 aa  55.5  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  23.2 
 
 		 332 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  22.87 
 
 		 321 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  21.31 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  19.88 
 
 		 325 aa  53.5  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  21.68 
 
 		 337 aa  53.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  22.16 
 
 		 338 aa  53.1  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  21.79 
 
 		 329 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  20.99 
 
 		 315 aa  52.4  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1656  type II secretion system protein  21.46 
 
 		 342 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0773  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  23.58 
 
 		 285 aa  51.2  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.544997  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0310  type II secretion system protein  26.05 
 
 		 329 aa  52  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.873631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  22.97 
 
 		 328 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2020  type II secretion system protein  25.32 
 
 		 325 aa  51.6  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243296  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  20.61 
 
 		 321 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  21.86 
 
 		 324 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0845  type II secretion system protein  20 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  22.66 
 
 		 326 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  20.31 
 
 		 535 aa  50.4  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  20.51 
 
 		 283 aa  50.1  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  23.56 
 
 		 310 aa  49.7  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0538  type II secretion system protein  21.46 
 
 		 322 aa  49.3  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2324  type II secretion system protein  22.1 
 
 		 318 aa  48.5  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  24.77 
 
 		 321 aa  48.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  20.9 
 
 		 334 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0781  Type II secretion system F domain protein  23.81 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00253796  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  17.73 
 
 		 321 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2046  type II secretion system protein  20.83 
 
 		 325 aa  47.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0673516  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  25.87 
 
 		 323 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2795  putative tight adherence TadB related transmembrane protein  21.18 
 
 		 359 aa  46.2  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136079  normal  0.229715 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2017  type II secretion system protein  21.18 
 
 		 319 aa  45.8  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  20.44 
 
 		 325 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4361  type II secretion system protein  21.39 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.395481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1044  type II secretion system protein  19.19 
 
 		 326 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1524  type II secretion system protein  19.19 
 
 		 326 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.437925  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1033  type II secretion system protein  26.52 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  17.17 
 
 		 323 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  22.94 
 
 		 320 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4251  type II secretion system protein  21.39 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.474366  normal  0.45717 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2695  type II secretion system protein  19.58 
 
 		 289 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0973564  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  21.93 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1723  type II secretion system protein  23.78 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1639  type II secretion system protein  20.47 
 
 		 303 aa  44.3  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.473605  normal  0.315413 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  26.83 
 
 		 329 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  20.93 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  16.57 
 
 		 335 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1500  type II secretion system protein  19.19 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000537712 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>