93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0024 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0024  putative aminopeptidase 2  100 
 
 
431 aa  894    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3381  Aspartyl aminopeptidase  48.83 
 
 
431 aa  427  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000123916  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0384  Aspartyl aminopeptidase  46.37 
 
 
445 aa  404  1e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0588  putative aminopeptidase 2  45.79 
 
 
431 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.617064  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0577  putative aminopeptidase 2  45.33 
 
 
431 aa  393  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.743598  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0829  putative aminopeptidase 2  41.31 
 
 
430 aa  337  2.9999999999999997e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75911  aspartyl aminopeptidase  38.36 
 
 
489 aa  316  5e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.742072  normal  0.941207 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1231  putative aminopeptidase 2  38.75 
 
 
429 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492379  normal  0.319124 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1590  putative aminopeptidase 2  36.38 
 
 
434 aa  302  6.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35150  putative aminopeptidase 2  37.62 
 
 
429 aa  296  7e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04970  putative aminopeptidase 2  38.44 
 
 
442 aa  293  5e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21990  putative aminopeptidase 2  36.3 
 
 
429 aa  293  5e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000107017 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1878  putative aminopeptidase 2  36.07 
 
 
429 aa  292  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1280  putative aminopeptidase 2  36.89 
 
 
429 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166488  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0961  putative aminopeptidase 2  37.26 
 
 
452 aa  290  4e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0978242  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1609  putative aminopeptidase 2  35.6 
 
 
429 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.4132  normal  0.725509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1730  putative aminopeptidase 2  36.49 
 
 
429 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0540022 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1690  putative aminopeptidase 2  35.73 
 
 
429 aa  286  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.705107  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3989  putative aminopeptidase 2  36.49 
 
 
429 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.269888  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3876  aspartyl aminopeptidase  35.96 
 
 
429 aa  286  5e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.761396  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1322  putative aminopeptidase 2  36.26 
 
 
429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4174  putative aminopeptidase 2  35.58 
 
 
437 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.290723  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1042  putative aminopeptidase 2  35.63 
 
 
429 aa  282  7.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0439  putative aminopeptidase 2  35.12 
 
 
433 aa  276  5e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.773817  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15270  putative aminopeptidase 2  36.18 
 
 
442 aa  275  8e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.242124  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0385  putative aminopeptidase 2  35.03 
 
 
424 aa  266  7e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000394298  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1636  putative aminopeptidase 2  33.95 
 
 
421 aa  265  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0271553 
 
 
-
 
NC_006686  CND02950  aminopeptidase, putative  32.64 
 
 
502 aa  261  1e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.176961  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4128  putative aminopeptidase 2  34.47 
 
 
447 aa  261  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10351  aspartyl aminopeptidase (AFU_orthologue; AFUA_3G08290)  32.99 
 
 
497 aa  261  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.459837  normal  0.55908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0307  putative aminopeptidase 2  35.1 
 
 
431 aa  260  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26700  putative aminopeptidase 2  34.55 
 
 
456 aa  259  7e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2884  putative aminopeptidase 2  34.83 
 
 
432 aa  257  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000479949  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27563  predicted protein  33.19 
 
 
512 aa  258  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0657659 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0506  putative aminopeptidase 2  35.39 
 
 
452 aa  256  7e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0233423  normal  0.547995 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3910  putative aminopeptidase 2  33.02 
 
 
435 aa  252  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1777  putative aminopeptidase 2  35.33 
 
 
419 aa  251  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.238694  normal  0.291525 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23270  putative aminopeptidase 2  32.02 
 
 
495 aa  249  7e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13136  predicted protein  34.14 
 
 
465 aa  249  9e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.768968 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37690  aspartyl aminopeptidase  32.93 
 
 
424 aa  245  9e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0697  Aspartyl aminopeptidase  34.35 
 
 
426 aa  245  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2231  putative aminopeptidase 2  33.65 
 
 
432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512559  hitchhiker  0.000110487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4550  putative aminopeptidase 2  34.29 
 
 
419 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52751  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4933  putative aminopeptidase 2  34.29 
 
 
419 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978626  normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4638  putative aminopeptidase 2  34.29 
 
 
419 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0913  putative aminopeptidase 2  33.8 
 
 
419 aa  242  1e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.250805  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20708  predicted protein  33.8 
 
 
475 aa  241  2e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.558415  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1520  putative aminopeptidase 2  31.83 
 
 
432 aa  240  4e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00169382  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0849  Aspartyl aminopeptidase  33.01 
 
 
425 aa  239  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.631873  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27719  predicted protein  32.24 
 
 
506 aa  230  3e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.113003  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1628  putative aminopeptidase 2  33.58 
 
 
419 aa  229  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3612  Aspartyl aminopeptidase  35.04 
 
 
417 aa  227  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0333  Aspartyl aminopeptidase  31.26 
 
 
462 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0647  putative aminopeptidase 2  34.68 
 
 
423 aa  221  3e-56  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.428879  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5121  putative aminopeptidase 2  33.5 
 
 
420 aa  219  7e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.674809 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10815  putative aminopeptidase 2  33.33 
 
 
433 aa  211  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11070  vacuolar aspartyl aminopeptidase Lap4, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03990)  30.21 
 
 
519 aa  203  4e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.775985 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36090  predicted protein  28.06 
 
 
508 aa  170  4e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47494  predicted protein  26.61 
 
 
475 aa  125  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0555555 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06730  aspartyl aminopeptidase  25.52 
 
 
470 aa  110  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0717904  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4129  peptidase M18 aminopeptidase I  24.21 
 
 
458 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0269  putative aminopeptidase 1  26.11 
 
 
450 aa  105  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0402  peptidase M18 aminopeptidase I  25.7 
 
 
460 aa  103  5e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.057981  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1300  peptidase M18 aminopeptidase I  25.28 
 
 
471 aa  102  9e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.044452  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0567  putative aminopeptidase 1  25.06 
 
 
451 aa  100  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0613764  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18140  putative aminopeptidase 1  26.44 
 
 
464 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000477052  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0553  putative aminopeptidase 1  25 
 
 
451 aa  100  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000071726  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0481  putative aminopeptidase 1  25.69 
 
 
467 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0643862  hitchhiker  0.00126414 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0394  peptidase M18 aminopeptidase I  24.26 
 
 
473 aa  98.6  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0726  putative aminopeptidase 1  24 
 
 
500 aa  96.7  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1754  putative aminopeptidase 1  27.76 
 
 
475 aa  95.9  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1530  putative aminopeptidase 1  24.45 
 
 
446 aa  94  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0908242  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1926  putative aminopeptidase 1  26.17 
 
 
476 aa  94  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.568897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1076  putative aminopeptidase 1  25.56 
 
 
468 aa  93.6  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1263  putative aminopeptidase 1  25.13 
 
 
468 aa  92.8  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116209  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3061  putative aminopeptidase 1  24.21 
 
 
464 aa  92  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.756669  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3311  putative aminopeptidase 1  24.71 
 
 
476 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.219105  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2543  putative aminopeptidase 1  23.93 
 
 
463 aa  90.9  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0378709  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3039  putative aminopeptidase 1  22.93 
 
 
468 aa  90.5  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0109252  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1741  putative aminopeptidase 1  25.4 
 
 
461 aa  90.5  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0368  putative aminopeptidase 1  25.29 
 
 
458 aa  90.1  6e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2226  putative aminopeptidase 1  26.38 
 
 
475 aa  88.6  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0761  putative aminopeptidase 1  24.78 
 
 
461 aa  88.6  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.328835  normal  0.996362 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2041  putative aminopeptidase 1  23.82 
 
 
467 aa  88.2  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0510  peptidase M18 aminopeptidase I  24.93 
 
 
445 aa  85.5  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000291545  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01800  aspartyl aminopeptidase  22.65 
 
 
475 aa  84  0.000000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000552066 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4357  putative aminopeptidase 1  25.31 
 
 
465 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0741  putative aminopeptidase 1  24.24 
 
 
472 aa  82.4  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2020  putative aminopeptidase 1  25.53 
 
 
453 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000190862  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0123  putative aminopeptidase 1  22.56 
 
 
476 aa  79.7  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.870895 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2589  putative aminopeptidase 1  22.35 
 
 
468 aa  73.6  0.000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.817656  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1314  putative aminopeptidase 1  22.81 
 
 
483 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000570668 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0400  peptidase M18 aminopeptidase I  24.58 
 
 
520 aa  62  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384737  normal  0.631826 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>