More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0015 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3055  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.27 
 
 		 227 aa  271  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.703147  hitchhiker  0.000223036 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1056  DNA-binding response regulator  59.91 
 
 		 226 aa  268  7e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.775205  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.11 
 
 		 226 aa  258  7e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.02 
 
 		 223 aa  244  6e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.65 
 
 		 224 aa  244  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  55.31 
 
 		 224 aa  241  9e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  53.78 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  52.42 
 
 		 224 aa  240  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  52.86 
 
 		 224 aa  239  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  52.65 
 
 		 228 aa  238  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  54.87 
 
 		 224 aa  239  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.33 
 
 		 224 aa  238  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.12 
 
 		 224 aa  237  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1044  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.36 
 
 		 234 aa  235  5.0000000000000005e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  52.65 
 
 		 230 aa  235  5.0000000000000005e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  51.98 
 
 		 224 aa  234  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00280  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  55.13 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000064956 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1228  two component transcriptional regulator  53.74 
 
 		 228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000325236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  54.02 
 
 		 227 aa  232  5e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  54.02 
 
 		 227 aa  232  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  54.02 
 
 		 227 aa  232  5e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0737  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.12 
 
 		 224 aa  231  6e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1625  DNA-binding response regulator CsrR  52.65 
 
 		 229 aa  230  1e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  54.02 
 
 		 227 aa  230  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1732  DNA-binding response regulator  51.75 
 
 		 229 aa  227  1e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.019008  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1398  DNA-binding response regulator  50.43 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000136334  hitchhiker  8.832960000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  48.46 
 
 		 236 aa  225  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.1 
 
 		 225 aa  225  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0354  DNA-binding response regulator  52.44 
 
 		 229 aa  225  4e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000041064  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  51.56 
 
 		 240 aa  223  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  51.11 
 
 		 219 aa  222  4e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  51.11 
 
 		 219 aa  222  4e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0990  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 222 aa  218  5e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  48.9 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  48.9 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  48.9 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  48.9 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  48.9 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1212  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 232 aa  217  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0899901  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  48.9 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  48.9 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.88 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  48.9 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  48.9 
 
 		 235 aa  215  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  48.9 
 
 		 235 aa  215  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  49.34 
 
 		 235 aa  215  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  48 
 
 		 222 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 		 226 aa  212  4.9999999999999996e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0989  DNA-binding response regulator ArlR  52.44 
 
 		 219 aa  210  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110636  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0440  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 		 225 aa  210  1e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.747409  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48.43 
 
 		 226 aa  208  4e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.14 
 
 		 227 aa  208  7e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1205  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 		 222 aa  207  8e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 		 233 aa  207  9e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  48.46 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  45.33 
 
 		 229 aa  206  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  48.67 
 
 		 224 aa  205  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 230 aa  205  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.37 
 
 		 225 aa  205  5e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 236 aa  205  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  45.61 
 
 		 237 aa  203  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0488  DNA-binding response regulator  49.78 
 
 		 228 aa  203  1e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  42.48 
 
 		 224 aa  203  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.77 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  42.48 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 226 aa  202  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.2 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  42.04 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  46.88 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  45.09 
 
 		 227 aa  202  4e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.74 
 
 		 223 aa  202  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.46 
 
 		 224 aa  201  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  44.89 
 
 		 223 aa  200  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  46.64 
 
 		 221 aa  200  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.74 
 
 		 238 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  46.96 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2268  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.09 
 
 		 221 aa  199  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2714  putative two-component response regulator  47.3 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.02 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 222 aa  199  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31960  putative two-component response regulator  47.3 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.029957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0984  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.85 
 
 		 246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0723779 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  41.15 
 
 		 224 aa  198  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  41.15 
 
 		 224 aa  198  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  46.72 
 
 		 230 aa  198  6e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 228 aa  198  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 228 aa  198  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 228 aa  198  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4693  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.84 
 
 		 220 aa  198  7e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  49.33 
 
 		 229 aa  197  7.999999999999999e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>