More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0014 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  53.98 
 
 		 666 aa  738    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  53.83 
 
 		 680 aa  731    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  50.38 
 
 		 663 aa  635    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  50.38 
 
 		 663 aa  635    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3401  transketolase  51.89 
 
 		 664 aa  685    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  50.15 
 
 		 666 aa  652    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  50.15 
 
 		 666 aa  652    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  48.7 
 
 		 660 aa  637    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  50.68 
 
 		 665 aa  656    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  51.26 
 
 		 662 aa  666    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  53.16 
 
 		 682 aa  699    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0510  transketolase  50.98 
 
 		 664 aa  647    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  51.89 
 
 		 664 aa  688    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  53.68 
 
 		 666 aa  732    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3413  transketolase  51.89 
 
 		 664 aa  688    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  51.5 
 
 		 661 aa  654    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1522  transketolase  47.22 
 
 		 676 aa  642    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.566213 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  50.15 
 
 		 664 aa  637    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  51.26 
 
 		 674 aa  682    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  53.68 
 
 		 666 aa  731    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  52.04 
 
 		 664 aa  689    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  53.83 
 
 		 666 aa  732    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1547  transketolase  53.25 
 
 		 659 aa  688    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.45317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  51.88 
 
 		 664 aa  688    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  53.83 
 
 		 666 aa  731    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03160  transketolase 1 (TK 1)  49.24 
 
 		 663 aa  648    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  50.15 
 
 		 664 aa  636    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  53.68 
 
 		 666 aa  733    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  49.25 
 
 		 668 aa  659    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2348  transketolase  50.66 
 
 		 703 aa  635    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0773739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  48.41 
 
 		 661 aa  635    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  50.15 
 
 		 664 aa  636    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  50 
 
 		 670 aa  659    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3341  transketolase  49.77 
 
 		 663 aa  638    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0470091 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1844  transketolase  51.58 
 
 		 664 aa  681    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.862582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  50.9 
 
 		 670 aa  638    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17351  transketolase  50.75 
 
 		 669 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.625161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  51.35 
 
 		 667 aa  657    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  50.23 
 
 		 663 aa  635    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  50.38 
 
 		 663 aa  635    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  49.25 
 
 		 684 aa  639    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  50.6 
 
 		 670 aa  645    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  49.7 
 
 		 669 aa  654    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1843  transketolase  47.22 
 
 		 676 aa  642    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  51.35 
 
 		 662 aa  659    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  51.26 
 
 		 674 aa  682    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  53.68 
 
 		 666 aa  731    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  50.6 
 
 		 670 aa  663    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  49.25 
 
 		 668 aa  638    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  52.11 
 
 		 668 aa  658    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  50.38 
 
 		 663 aa  635    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3703  transketolase  49.92 
 
 		 664 aa  635    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3367  transketolase  50.38 
 
 		 663 aa  637    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  48.3 
 
 		 666 aa  642    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  53.35 
 
 		 668 aa  728    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  48.95 
 
 		 668 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  47.57 
 
 		 688 aa  641    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  49.4 
 
 		 668 aa  642    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  52.1 
 
 		 668 aa  701    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0014  transketolase  100 
 
 		 660 aa  1368    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3879  transketolase  51.87 
 
 		 675 aa  671    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  50.6 
 
 		 665 aa  667    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  53.83 
 
 		 666 aa  731    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0715  transketolase  51.59 
 
 		 664 aa  637    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.582031 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  51.43 
 
 		 664 aa  682    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  53.68 
 
 		 680 aa  733    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  50.53 
 
 		 663 aa  650    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  49.77 
 
 		 665 aa  642    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  50.6 
 
 		 669 aa  643    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  50.76 
 
 		 671 aa  671    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  50.61 
 
 		 697 aa  679    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  50.6 
 
 		 667 aa  652    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  49.77 
 
 		 680 aa  639    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  49.34 
 
 		 691 aa  652    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  53.98 
 
 		 666 aa  721    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  50.22 
 
 		 662 aa  642    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  51.5 
 
 		 672 aa  644    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  50.3 
 
 		 664 aa  648    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02728  hypothetical protein  50.38 
 
 		 663 aa  635    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4237  transketolase  50.23 
 
 		 663 aa  635    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  51.35 
 
 		 662 aa  659    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  49.92 
 
 		 663 aa  638    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  49.55 
 
 		 668 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  49.92 
 
 		 694 aa  641    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  49.77 
 
 		 665 aa  635    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1734  transketolase  51.35 
 
 		 658 aa  666    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.901909  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  59.15 
 
 		 662 aa  814    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0349  transketolase  51.74 
 
 		 658 aa  676    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3765  transketolase  53.1 
 
 		 659 aa  685    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  49.34 
 
 		 691 aa  652    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  51.05 
 
 		 672 aa  653    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  49.7 
 
 		 666 aa  654    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0872  transketolase  50.68 
 
 		 664 aa  636    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  50.37 
 
 		 668 aa  673    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0745  transketolase  49.92 
 
 		 664 aa  635    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94211  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4511  transketolase  50.89 
 
 		 669 aa  646    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.545809  normal  0.774153 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  50.38 
 
 		 663 aa  635    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3238  transketolase  49.47 
 
 		 663 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3256  transketolase  49.47 
 
 		 663 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  46.56 
 
 		 711 aa  634  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>