More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0012 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  100 
 
 		 245 aa  511  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1872  NAD-dependent deacetylase  61.67 
 
 		 244 aa  325  5e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.747627  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  63.64 
 
 		 243 aa  321  5e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  61.67 
 
 		 241 aa  305  5.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2158  Silent information regulator protein Sir2  56.56 
 
 		 237 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  54.32 
 
 		 246 aa  277  1e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  49.8 
 
 		 248 aa  255  4e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26850  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  52.61 
 
 		 245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2228  NAD-dependent deacetylase  46.69 
 
 		 243 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2267  NAD-dependent deacetylase  46.69 
 
 		 243 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0295  Silent information regulator protein Sir2  41.4 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.216345 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1797  NAD-dependent deacetylase  47.35 
 
 		 246 aa  218  7.999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  44.98 
 
 		 244 aa  189  5e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  44.98 
 
 		 244 aa  189  5e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  40.83 
 
 		 251 aa  185  7e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  43.04 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  41.52 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0627  silent information regulator protein Sir2  43.15 
 
 		 245 aa  177  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208993  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  39.34 
 
 		 254 aa  176  4e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1913  silent information regulator protein Sir2  42.15 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1359  silent information regulator protein Sir2  37.7 
 
 		 256 aa  171  6.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  38.21 
 
 		 252 aa  171  7.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  40.17 
 
 		 257 aa  171  9e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  39.66 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  38.59 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  41.42 
 
 		 247 aa  169  4e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  40.82 
 
 		 245 aa  169  4e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  37.55 
 
 		 251 aa  169  4e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1033  Sir2 family regulatory protein  35.71 
 
 		 253 aa  168  6e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  38.03 
 
 		 269 aa  168  8e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  40.26 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  38.63 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2154  NAD-dependent deacetylase  38.37 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2804  NAD-dependent deacetylase  38.46 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3095  NAD-dependent deacetylase  39.26 
 
 		 241 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2866  NAD-dependent deacetylase  39.66 
 
 		 241 aa  159  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0601022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2874  NAD-dependent deacetylase  38.06 
 
 		 245 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.84237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3089  NAD-dependent deacetylase  38.06 
 
 		 245 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3114  NAD-dependent deacetylase  37.55 
 
 		 242 aa  158  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0364073  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  36.99 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3115  NAD-dependent deacetylase  37.55 
 
 		 242 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  35.77 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3082  NAD-dependent deacetylase  37.14 
 
 		 242 aa  156  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  37.8 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1398  Silent information regulator protein Sir2  37.04 
 
 		 243 aa  155  7e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00225806  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2055  NAD-dependent deacetylase  37.92 
 
 		 238 aa  154  9e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0387901  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2843  NAD-dependent deacetylase  37.25 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2800  Silent information regulator protein Sir2  35.97 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2493  NAD-dependent deacetylase  37.75 
 
 		 247 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  37.45 
 
 		 243 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2277  Sir2 family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.256222  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0747  silent information regulator protein Sir2  39.52 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00199209  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  37.15 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  39.3 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  35.27 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  35.86 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0098  silent information regulator protein Sir2  36.33 
 
 		 249 aa  150  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  35.12 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  38.63 
 
 		 236 aa  148  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  36.67 
 
 		 248 aa  148  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2792  silent information regulator protein Sir2  35.48 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.867535  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2529  silent information regulator protein Sir2  35.89 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2137  Silent information regulator protein Sir2  35.17 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268071  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1781  NAD-dependent deacetylase  36.73 
 
 		 250 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  35.43 
 
 		 256 aa  145  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0208  NAD-dependent deacetylase  38.86 
 
 		 232 aa  145  6e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  36.71 
 
 		 248 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  34.78 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  36.8 
 
 		 242 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  35.54 
 
 		 242 aa  141  9e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2939  silent information regulator protein Sir2  35.48 
 
 		 253 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  36.12 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4037  putative transciptional regulatory Sir2-family protein  37.14 
 
 		 253 aa  139  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.185162 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1653  Silent information regulator protein Sir2  30.43 
 
 		 291 aa  139  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.24521  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  33.19 
 
 		 233 aa  139  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0362  Silent information regulator protein Sir2  37.16 
 
 		 246 aa  139  6e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  34.87 
 
 		 244 aa  138  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0631  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  35.27 
 
 		 278 aa  138  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2614  Silent information regulator protein Sir2  32.53 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.727744  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  32.22 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  38.21 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1797  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  38.61 
 
 		 233 aa  135  4e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  34.96 
 
 		 244 aa  135  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1553  silent information regulator protein Sir2  34.71 
 
 		 253 aa  135  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.469137  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1331  transcriptional regulator, Sir2 family  33.33 
 
 		 257 aa  135  7.000000000000001e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  35.8 
 
 		 245 aa  135  8e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  33.33 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0501  NAD-dependent deacetylase  32.46 
 
 		 308 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3344  silent information regulator protein Sir2  36.25 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  34.54 
 
 		 256 aa  132  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  34.57 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  34.25 
 
 		 241 aa  133  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1499  NAD-dependent protein deacetylase  32.93 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0552  Silent information regulator protein Sir2  31.95 
 
 		 251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  33.19 
 
 		 249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  36.13 
 
 		 247 aa  132  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0957  silent information regulator protein Sir2  36.24 
 
 		 253 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.925274  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  31.33 
 
 		 262 aa  131  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  34.67 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>