More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2557 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2331  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  80.87 
 
 
393 aa  669    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.659291 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1707  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  80.67 
 
 
399 aa  660    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0749454  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2557  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  100 
 
 
392 aa  808    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1891  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  80.62 
 
 
389 aa  648    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216866  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1742  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  69.45 
 
 
385 aa  562  1.0000000000000001e-159  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2051  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  69.53 
 
 
387 aa  537  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0962295  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1906  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  69.01 
 
 
387 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.526896  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1827  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  69.01 
 
 
387 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3022  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  62.34 
 
 
391 aa  492  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.289298  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0975  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  60.41 
 
 
389 aa  491  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0588  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  61.22 
 
 
391 aa  453  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0195423  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1053  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  58.49 
 
 
393 aa  448  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000113017  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2314  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  56.88 
 
 
398 aa  436  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4380  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  58.92 
 
 
395 aa  434  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11841  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  55.32 
 
 
392 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.703197  normal  0.0751246 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0160  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  56.51 
 
 
392 aa  423  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000791072  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0143  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.03 
 
 
392 aa  422  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2688  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  59.28 
 
 
392 aa  424  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3193  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  56.43 
 
 
392 aa  423  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478447  hitchhiker  1.55264e-21 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1578  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  56.43 
 
 
392 aa  421  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0302  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  56.51 
 
 
392 aa  420  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000751651  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2767  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  55.87 
 
 
393 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0503  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.89 
 
 
387 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.333912  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0558  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  56.71 
 
 
391 aa  403  1e-111  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12301  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.62 
 
 
387 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.795061  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0081  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  55.12 
 
 
415 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.338109 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  55.5 
 
 
393 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.251731 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2478  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  54.31 
 
 
400 aa  402  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00049074  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1390  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  54.86 
 
 
394 aa  403  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.833755  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39610  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  54.31 
 
 
393 aa  399  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10891  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.3 
 
 
390 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.402968  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1966  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  56.27 
 
 
393 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2756  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  57.38 
 
 
393 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.966815 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2132  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.85 
 
 
393 aa  398  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000381873  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0097  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.52 
 
 
394 aa  398  1e-109  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10931  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50 
 
 
391 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.673369  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1277  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.33 
 
 
393 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05935  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1014  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  49.48 
 
 
391 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10931  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.26 
 
 
391 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.224699  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1468  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.33 
 
 
393 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2242  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.91 
 
 
393 aa  388  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1014  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.81 
 
 
393 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0434  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  54.81 
 
 
394 aa  388  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.298565  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.91 
 
 
391 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.497623  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3406  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.48 
 
 
393 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630931  normal  0.629093 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0549  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.02 
 
 
393 aa  386  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2807  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.44 
 
 
392 aa  386  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1834  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  54.38 
 
 
392 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.272244  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1122  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.58 
 
 
388 aa  384  1e-105  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1929  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  54.82 
 
 
403 aa  383  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.268202  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2246  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  55.25 
 
 
393 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02115  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  49.48 
 
 
391 aa  381  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0850  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.91 
 
 
393 aa  379  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148242  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1128  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.94 
 
 
388 aa  379  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.55377  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2087  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.65 
 
 
404 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1092  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.39 
 
 
391 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.630998 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2118  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.66 
 
 
392 aa  378  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3300  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.39 
 
 
391 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0989  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.39 
 
 
391 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2130  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  54.55 
 
 
392 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15890  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  54.04 
 
 
393 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.17999 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1555  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.29 
 
 
388 aa  377  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0871  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  49.61 
 
 
391 aa  378  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000494924  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4264  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.52 
 
 
393 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1792  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.47 
 
 
392 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00174349  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1457  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.78 
 
 
393 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.164878 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3613  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50 
 
 
378 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1001  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.91 
 
 
391 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0829  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.98 
 
 
388 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1062  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.78 
 
 
393 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1059  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.13 
 
 
391 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1686  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  49.61 
 
 
391 aa  373  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.10474  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2124  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.47 
 
 
392 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3101  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  49.35 
 
 
391 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1367  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.76 
 
 
393 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0973  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  49.74 
 
 
391 aa  373  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000246757  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1338  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.47 
 
 
392 aa  371  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01820  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.47 
 
 
392 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1941  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.47 
 
 
392 aa  371  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2079  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.47 
 
 
392 aa  371  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3552  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.42 
 
 
399 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229559  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1783  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.47 
 
 
392 aa  371  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.163487 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01808  hypothetical protein  52.47 
 
 
392 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2042  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.91 
 
 
392 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.489284 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4162  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.49 
 
 
393 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2097  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.06 
 
 
392 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.310007  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3291  Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase  53.97 
 
 
399 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1241  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.06 
 
 
392 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3020  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  49.35 
 
 
391 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.190979 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3070  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  49.22 
 
 
396 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.636645  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1366  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.91 
 
 
392 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000213864 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2584  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.47 
 
 
392 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.303586  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  49.35 
 
 
391 aa  371  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.862074 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2234  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.13 
 
 
396 aa  368  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.331336 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2474  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.7 
 
 
401 aa  365  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530276  normal  0.239211 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1107  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.75 
 
 
395 aa  368  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.881865  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2418  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.96 
 
 
392 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2037  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.65 
 
 
392 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3301  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.26 
 
 
404 aa  364  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225182  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1188  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.28 
 
 
404 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>