277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2542 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  100 
 
 
242 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  44.64 
 
 
238 aa  221  8e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  38.84 
 
 
242 aa  193  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  34.68 
 
 
254 aa  160  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  38.14 
 
 
222 aa  155  4e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  34.98 
 
 
270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  39.07 
 
 
221 aa  149  5e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  34.18 
 
 
258 aa  145  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  36.62 
 
 
219 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1164  hypothetical protein  48.87 
 
 
141 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  33.91 
 
 
242 aa  135  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  32.59 
 
 
238 aa  135  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  33.02 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  33.18 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  32.89 
 
 
241 aa  133  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  34.98 
 
 
244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1819  hypothetical protein  33.49 
 
 
222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  31.94 
 
 
242 aa  126  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  33.04 
 
 
237 aa  124  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4201  protein of unknown function DUF45  28.57 
 
 
245 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  32.9 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  34.3 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  29.3 
 
 
244 aa  116  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  33.66 
 
 
226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  31.86 
 
 
224 aa  112  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  34.33 
 
 
238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  30.94 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  30.67 
 
 
246 aa  109  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  32.2 
 
 
223 aa  110  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  30.67 
 
 
246 aa  109  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  26.99 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  32.09 
 
 
227 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  32.09 
 
 
227 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  33.81 
 
 
237 aa  107  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  31.17 
 
 
245 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  34.48 
 
 
235 aa  105  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  29.67 
 
 
224 aa  104  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  28.89 
 
 
235 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  30.62 
 
 
224 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  28.03 
 
 
243 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0505  hypothetical protein  28.9 
 
 
233 aa  99.4  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.722938 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  27.8 
 
 
237 aa  99.4  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  30.56 
 
 
242 aa  98.2  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  28.84 
 
 
226 aa  98.2  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  27.93 
 
 
234 aa  96.3  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2166  hypothetical protein  28.45 
 
 
310 aa  95.5  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2675  hypothetical protein  26.64 
 
 
243 aa  94.4  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1774  zinc metalloprotease  26.61 
 
 
238 aa  94.4  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  30.73 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2198  hypothetical protein  29.73 
 
 
247 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0406  hypothetical protein  24.17 
 
 
257 aa  93.6  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.317112  normal  0.0115722 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  28.71 
 
 
227 aa  93.2  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  29.46 
 
 
308 aa  92.4  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4173  hypothetical protein  26.75 
 
 
303 aa  92  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0947  hypothetical protein  28.7 
 
 
245 aa  91.7  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000214537 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  25.63 
 
 
254 aa  91.7  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  27.43 
 
 
218 aa  90.5  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  32.79 
 
 
241 aa  90.9  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  28.57 
 
 
235 aa  90.1  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  27.39 
 
 
300 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0365  hypothetical protein  29.28 
 
 
232 aa  89  6e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0669057  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  27.39 
 
 
300 aa  89  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  28.46 
 
 
261 aa  88.6  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0760  hypothetical protein  27.91 
 
 
244 aa  88.6  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0906  protein of unknown function DUF45  27.91 
 
 
244 aa  88.6  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.876537  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  26.14 
 
 
240 aa  88.6  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0459  hypothetical protein  27.27 
 
 
235 aa  88.2  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  26.67 
 
 
288 aa  86.7  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  24.89 
 
 
240 aa  85.9  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  27.8 
 
 
223 aa  85.5  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  24.51 
 
 
231 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  26.89 
 
 
285 aa  85.1  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  28 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  24.35 
 
 
235 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  25.75 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  26.01 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  25.32 
 
 
235 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  25.33 
 
 
240 aa  81.6  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  24.35 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  26.56 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  24.78 
 
 
235 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  26.45 
 
 
251 aa  80.9  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  24.35 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0977  protein of unknown function DUF45  28.64 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4010  hypothetical protein  23.38 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  28.07 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  24.35 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3377  hypothetical protein  27.31 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  26.41 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  24.35 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  24.38 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0431  hypothetical protein  23.81 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  26.79 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0531  hypothetical protein  25.51 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.10161 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0244  hypothetical protein  26.87 
 
 
253 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  24.38 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0306  zinc metalloprotease  23.38 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0555  zinc metalloprotease  27.41 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0652798  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0431  protein of unknown function DUF45  27.36 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  25.73 
 
 
239 aa  79  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>