More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2502 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2502  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 		 338 aa  664    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  66.09 
 
 		 342 aa  441  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2247  F0F1 ATP synthase subunit A  83.64 
 
 		 324 aa  426  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.608191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2885  F0F1 ATP synthase subunit A  65.38 
 
 		 340 aa  422  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677372  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2098  F0F1 ATP synthase subunit A  66.76 
 
 		 341 aa  420  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0064  F0F1 ATP synthase subunit A  63.98 
 
 		 345 aa  414  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4487  F0F1 ATP synthase subunit A  43.27 
 
 		 406 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.553444  normal  0.0963007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  42.39 
 
 		 364 aa  212  9e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4495  F0F1 ATP synthase subunit A  48.44 
 
 		 384 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  50 
 
 		 373 aa  199  6e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4476  F0F1 ATP synthase subunit A  47.5 
 
 		 384 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4340  F0F1 ATP synthase subunit A  46.83 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.35318  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  38.15 
 
 		 373 aa  186  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1055  ATP synthase F0, A subunit  46.32 
 
 		 391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0179  ATP synthase, subunit A (H(+)-transporting two-sector ATPase)  38.27 
 
 		 376 aa  170  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.412196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0061  ATP synthase F0 subunit A  44.68 
 
 		 339 aa  168  1e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1718  ATP synthase F0, A subunit  46.15 
 
 		 355 aa  164  3e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0314608  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03040  putative ATP synthase A chain  46.81 
 
 		 361 aa  160  4e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0311  ATP synthase F0, A subunit  44.3 
 
 		 400 aa  156  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00150281  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  41.25 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  34.86 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1515  ATP synthase F0, A subunit  34.85 
 
 		 248 aa  132  9e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000105454 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1229  ATP synthase F0, A subunit  41.8 
 
 		 380 aa  126  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.896245 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  33.61 
 
 		 261 aa  122  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  32.8 
 
 		 268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  31.02 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  34.57 
 
 		 284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  34.68 
 
 		 243 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  34.58 
 
 		 243 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  30 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  30 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1129  F0F1 ATP synthase subunit A  29.44 
 
 		 270 aa  106  5e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  29.62 
 
 		 251 aa  106  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2454  ATP synthase F0, A subunit  31.87 
 
 		 272 aa  105  9e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  30.89 
 
 		 251 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  30.35 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  32.64 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  33.86 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1801  ATP synthase F0, A subunit  35.27 
 
 		 257 aa  102  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  31.95 
 
 		 247 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  35.18 
 
 		 234 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1304  ATP synthase F0, A subunit  34.15 
 
 		 266 aa  101  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000065102  normal  0.293813 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  36.82 
 
 		 229 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  33.78 
 
 		 234 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  30.42 
 
 		 247 aa  100  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  32.89 
 
 		 233 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6142  ATP synthase F0, A subunit  30.16 
 
 		 283 aa  99.8  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  30.83 
 
 		 281 aa  99.8  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  29.77 
 
 		 250 aa  99.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1299  ATP synthase F0, A subunit  34.5 
 
 		 245 aa  99  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  29 
 
 		 251 aa  99  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  31.58 
 
 		 295 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  32 
 
 		 207 aa  97.8  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  30.54 
 
 		 263 aa  97.4  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0894  ATP synthase F0 subunit A  34.45 
 
 		 263 aa  97.4  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  32.74 
 
 		 229 aa  97.1  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  37.31 
 
 		 230 aa  97.1  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  33.18 
 
 		 229 aa  96.7  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  29.24 
 
 		 216 aa  96.7  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  36.79 
 
 		 229 aa  96.7  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  29.23 
 
 		 248 aa  96.3  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3922  ATP synthase F0, A subunit  31.58 
 
 		 267 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  35.86 
 
 		 234 aa  94.7  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  31.33 
 
 		 250 aa  95.1  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  35.82 
 
 		 229 aa  94.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  27.45 
 
 		 260 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3736  F0F1 ATP synthase subunit A  33.91 
 
 		 267 aa  94.4  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.584992  normal  0.794372 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  29.2 
 
 		 267 aa  93.2  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  32.63 
 
 		 251 aa  93.2  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  31.72 
 
 		 233 aa  92.4  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09970  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  30.04 
 
 		 294 aa  92.4  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  29.57 
 
 		 252 aa  92  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  30.92 
 
 		 248 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  26.56 
 
 		 247 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  28.27 
 
 		 283 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1066  ATP synthase F0, A subunit  30.52 
 
 		 261 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  29.73 
 
 		 253 aa  91.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0142  ATP synthase F0, A subunit  27.24 
 
 		 284 aa  90.9  3e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  27.73 
 
 		 249 aa  90.5  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  29.08 
 
 		 260 aa  90.5  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  29.62 
 
 		 249 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  34.48 
 
 		 229 aa  89.7  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  32.44 
 
 		 233 aa  89.7  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  34.48 
 
 		 229 aa  89.7  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3156  ATP synthase F0, A subunit  29.69 
 
 		 262 aa  89.7  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06110  F0F1 ATP synthase subunit A  29.36 
 
 		 255 aa  89.4  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0170  ATP synthase F0, A subunit  37.28 
 
 		 339 aa  89.4  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.222204  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1665  F0F1 ATP synthase subunit A  30.3 
 
 		 263 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  31.7 
 
 		 241 aa  88.2  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4468  F0F1 ATP synthase subunit A  31.67 
 
 		 282 aa  88.2  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000195299  hitchhiker  0.00000000198513 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  29.07 
 
 		 249 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2087  ATP synthase F0, A subunit  32.37 
 
 		 226 aa  87.8  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000656805  normal  0.938168 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  29.17 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  30.96 
 
 		 246 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  31.4 
 
 		 241 aa  87  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  28.68 
 
 		 249 aa  87  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1893  F0F1 ATP synthase subunit A  33.2 
 
 		 249 aa  87  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0190421 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0512  F0F1 ATP synthase subunit A  30.38 
 
 		 250 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4613  F0F1 ATP synthase subunit A  32.38 
 
 		 272 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4246  F0F1 ATP synthase subunit A  32.93 
 
 		 276 aa  86.3  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000111234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>