More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2500 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 		 175 aa  350  5e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  76 
 
 		 175 aa  277  6e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  73.14 
 
 		 175 aa  261  4.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  69.71 
 
 		 175 aa  256  2e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  70.29 
 
 		 175 aa  253  7e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  66.86 
 
 		 175 aa  245  3e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  71.43 
 
 		 175 aa  241  5e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  37.36 
 
 		 179 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  38.15 
 
 		 175 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  36.21 
 
 		 179 aa  131  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  36.78 
 
 		 179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  40.24 
 
 		 171 aa  121  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  36.02 
 
 		 165 aa  117  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  36.88 
 
 		 164 aa  117  7e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  37.89 
 
 		 167 aa  111  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  38.36 
 
 		 164 aa  106  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  35.9 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  30.23 
 
 		 178 aa  98.6  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  38.16 
 
 		 165 aa  98.2  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  35.62 
 
 		 156 aa  97.4  8e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  35.19 
 
 		 206 aa  97.1  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  32.34 
 
 		 171 aa  96.3  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  34.62 
 
 		 168 aa  95.5  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  29.75 
 
 		 162 aa  94.4  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  34.62 
 
 		 168 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  32.43 
 
 		 164 aa  94  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  33.97 
 
 		 168 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  33.97 
 
 		 168 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  33.97 
 
 		 168 aa  92.8  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5023  ATP synthase F0, B subunit  39.2 
 
 		 151 aa  92.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.203888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  33.97 
 
 		 168 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  30.77 
 
 		 173 aa  92  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  30.77 
 
 		 173 aa  92  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  33.97 
 
 		 168 aa  91.7  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  33.97 
 
 		 168 aa  91.7  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  33.97 
 
 		 168 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  33.97 
 
 		 168 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  33.97 
 
 		 168 aa  91.7  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  36.31 
 
 		 156 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  33.77 
 
 		 166 aa  90.9  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  30.64 
 
 		 172 aa  90.5  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  35.67 
 
 		 156 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  33.54 
 
 		 181 aa  89.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 		 156 aa  89.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  34.39 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  35.53 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  34.39 
 
 		 156 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  35.53 
 
 		 181 aa  89.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  35.03 
 
 		 156 aa  89  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  37.32 
 
 		 163 aa  89.4  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  28.32 
 
 		 238 aa  87.8  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  29.33 
 
 		 156 aa  87.8  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  34.36 
 
 		 203 aa  87.4  8e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  32.24 
 
 		 163 aa  87.8  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  36.31 
 
 		 156 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  36.31 
 
 		 156 aa  87.4  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  32.91 
 
 		 159 aa  87  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  36 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  32.91 
 
 		 159 aa  87  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  37.24 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  35.06 
 
 		 156 aa  87  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  35.67 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  35.33 
 
 		 156 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  35.33 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  35.33 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0063  ATP synthase F0 subunit B  33.73 
 
 		 164 aa  86.7  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4049  F0F1 ATP synthase subunit B  34.42 
 
 		 156 aa  86.7  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  32.28 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  35.67 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1057  F0F1 ATP synthase subunit B  33.77 
 
 		 166 aa  85.9  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  30.63 
 
 		 174 aa  85.5  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  34.67 
 
 		 156 aa  85.9  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  34.67 
 
 		 156 aa  85.9  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  34.67 
 
 		 156 aa  85.1  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  34.67 
 
 		 156 aa  85.1  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  34.67 
 
 		 156 aa  85.1  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  36 
 
 		 156 aa  85.1  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  36 
 
 		 156 aa  85.1  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  36 
 
 		 156 aa  85.1  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  36 
 
 		 156 aa  85.1  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  36 
 
 		 156 aa  85.1  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  36 
 
 		 156 aa  85.1  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  36 
 
 		 156 aa  85.1  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  36 
 
 		 156 aa  85.1  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  33.77 
 
 		 156 aa  84.7  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0008  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 		 157 aa  84.3  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.320711  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  35.33 
 
 		 156 aa  84.3  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  35.33 
 
 		 156 aa  84.3  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3031  F0F1 ATP synthase subunit B  35.33 
 
 		 156 aa  84.3  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  32.67 
 
 		 156 aa  84.3  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  31.85 
 
 		 168 aa  84.3  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  31.33 
 
 		 152 aa  84  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  35.33 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1517  ATP synthase F0, B subunit  34.38 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  35.33 
 
 		 156 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  35.33 
 
 		 156 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  35.33 
 
 		 156 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  37.5 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  33.77 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>