14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2491 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2491  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  300  5.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.548043  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2242  hypothetical protein  81.33 
 
 
148 aa  247  4e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.85099  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2487  hypothetical protein  53.46 
 
 
160 aa  165  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274795  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1334  hypothetical protein  68.03 
 
 
160 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.355353  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1002  hypothetical protein  60.77 
 
 
154 aa  159  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0683  hypothetical protein  55.19 
 
 
159 aa  159  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00218027  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1149  hypothetical protein  55.65 
 
 
178 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000392175  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00099  hypothetical protein  48.74 
 
 
148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1418  hypothetical protein  42.52 
 
 
145 aa  106  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.6107  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2148  hypothetical protein  44.53 
 
 
144 aa  105  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.511349  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1846  hypothetical protein  41.32 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.325818 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0375  hypothetical protein  37.59 
 
 
153 aa  91.7  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1462  hypothetical protein  34.65 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0573227 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1055  hypothetical protein  26.36 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.310869 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>