More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2476 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2476  putative translaldolase  100 
 
 		 223 aa  455  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2230  putative translaldolase  76.13 
 
 		 223 aa  362  2e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0911781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2875  putative translaldolase  77.03 
 
 		 222 aa  362  3e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2479  putative translaldolase  76.13 
 
 		 222 aa  360  1e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.426562  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2698  putative translaldolase  75.68 
 
 		 226 aa  356  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2088  putative translaldolase  76.13 
 
 		 222 aa  332  2e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0074  putative translaldolase  68.78 
 
 		 222 aa  318  5e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0473  transaldolase  56.95 
 
 		 223 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0705  putative translaldolase  59.26 
 
 		 214 aa  268  5e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.931259  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2486  putative transaldolase  57.87 
 
 		 214 aa  264  8.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0636  putative translaldolase  56.94 
 
 		 218 aa  263  1e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2977  putative translaldolase  58.8 
 
 		 214 aa  263  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.324896  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0051  putative transaldolase  58.11 
 
 		 221 aa  262  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3027  transaldolase  59.45 
 
 		 221 aa  261  4.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.32955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0617  putative translaldolase  55.56 
 
 		 218 aa  261  6.999999999999999e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000452349  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10763  transaldolase  58.53 
 
 		 217 aa  260  8.999999999999999e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0373  putative translaldolase  56.48 
 
 		 214 aa  259  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0230  putative translaldolase  57.59 
 
 		 220 aa  258  5.0000000000000005e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0497  putative translaldolase  57.41 
 
 		 214 aa  256  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0624  putative translaldolase  56.94 
 
 		 214 aa  256  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.04318e-35 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0010  transaldolase  57.66 
 
 		 214 aa  255  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.896491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0294  putative translaldolase  56.48 
 
 		 214 aa  255  5e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4186  putative translaldolase  58.8 
 
 		 217 aa  254  8e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0610  putative translaldolase  56.02 
 
 		 214 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0278  putative translaldolase  54.95 
 
 		 216 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.415561  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0285  putative translaldolase  55.56 
 
 		 215 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4211  putative translaldolase  58.33 
 
 		 217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4063  putative translaldolase  58.33 
 
 		 217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.379343  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1229  putative translaldolase  54.63 
 
 		 217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1619  putative translaldolase  54.26 
 
 		 216 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0553  putative translaldolase  55.09 
 
 		 215 aa  252  3e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0499  putative translaldolase  56.88 
 
 		 217 aa  252  3e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000254528  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5045  putative translaldolase  56.68 
 
 		 218 aa  251  7e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1110  putative translaldolase  53.7 
 
 		 216 aa  249  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1777  transaldolase  55.86 
 
 		 218 aa  248  4e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2002  putative translaldolase  56.42 
 
 		 218 aa  248  6e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0565  putative translaldolase  55.86 
 
 		 215 aa  248  7e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000239698  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2410  transaldolase  56.02 
 
 		 213 aa  248  7e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00815052  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0815  putative translaldolase  56.94 
 
 		 217 aa  246  2e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2130  putative translaldolase  56.88 
 
 		 219 aa  246  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.116151 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0618  putative translaldolase  54.63 
 
 		 215 aa  246  2e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.911017  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03280  putative transaldolase  53.81 
 
 		 216 aa  246  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0309181  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1679  putative translaldolase  56.22 
 
 		 216 aa  246  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2529  putative translaldolase  57.34 
 
 		 218 aa  245  4e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0348  transaldolase  56.42 
 
 		 219 aa  244  6e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0799  putative translaldolase  55.86 
 
 		 215 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000767356  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0013  transaldolase  55.96 
 
 		 217 aa  243  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0683  putative translaldolase  53.7 
 
 		 215 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1366  putative translaldolase  54.17 
 
 		 215 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.705012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0702  putative translaldolase  55.86 
 
 		 215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0727  putative translaldolase  55.86 
 
 		 215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.53489e-39 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0738  putative translaldolase  55.86 
 
 		 215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0637  putative translaldolase  55.86 
 
 		 215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0581  putative translaldolase  55.86 
 
 		 215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0580  putative translaldolase  55.86 
 
 		 215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0670  putative translaldolase  55.86 
 
 		 215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0907799  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2403  putative translaldolase  54.95 
 
 		 215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1161  putative translaldolase  51.58 
 
 		 221 aa  243  1.9999999999999999e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0485  transaldolase  51.85 
 
 		 214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0684  putative translaldolase  53.24 
 
 		 215 aa  242  3e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4615  putative transaldolase  54.71 
 
 		 217 aa  242  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.463616 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4567  putative translaldolase  55.3 
 
 		 218 aa  241  7.999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0244923  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0584  putative translaldolase  54.95 
 
 		 215 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1070  putative translaldolase  52.7 
 
 		 215 aa  240  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.144646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4636  putative translaldolase  54.5 
 
 		 215 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0957059  unclonable  2.60878e-26 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0417  putative transaldolase  53.36 
 
 		 217 aa  239  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.67449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0364  putative translaldolase  56.02 
 
 		 215 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0396985  normal  0.678872 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4411  putative transaldolase  53.24 
 
 		 221 aa  236  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3332  putative translaldolase  53.7 
 
 		 213 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1927  putative translaldolase  53.24 
 
 		 217 aa  234  7e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0834254  hitchhiker  0.00000000106475 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2877  transaldolase  54.63 
 
 		 215 aa  234  8e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000016267  hitchhiker  0.00000329415 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3442  putative translaldolase  53.24 
 
 		 213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1864  transaldolase  51.39 
 
 		 226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1032  putative translaldolase  52.25 
 
 		 217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1459  putative transaldolase  52.91 
 
 		 218 aa  231  5e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0248  putative translaldolase  55.16 
 
 		 215 aa  231  5e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3175  putative transaldolase  52.31 
 
 		 216 aa  230  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000196987  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1087  transaldolase  52 
 
 		 220 aa  230  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000179872  hitchhiker  0.0000000000000152073 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1361  transaldolase  53.7 
 
 		 216 aa  229  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0166838  normal  0.338675 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2379  putative translaldolase  50.93 
 
 		 217 aa  230  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3212  putative translaldolase  50.9 
 
 		 217 aa  229  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2928  putative translaldolase  51.8 
 
 		 217 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1350  transaldolase  51.82 
 
 		 217 aa  228  5e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23680  transaldolase  49.35 
 
 		 226 aa  228  5e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00402875  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1147  putative transaldolase  51.39 
 
 		 217 aa  228  5e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.143358  normal  0.104107 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1099  putative translaldolase  50.45 
 
 		 217 aa  227  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2783  transaldolase  52.7 
 
 		 215 aa  226  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21800  putative transaldolase  51.39 
 
 		 213 aa  227  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0301  putative transaldolase  51.35 
 
 		 222 aa  227  1e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.103898 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1738  putative translaldolase  50.45 
 
 		 217 aa  226  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1805  putative translaldolase  50.45 
 
 		 217 aa  226  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.110565  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1253  transaldolase  51.85 
 
 		 218 aa  226  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0294047  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0058  transaldolase  53.24 
 
 		 219 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0401075  hitchhiker  0.00104949 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1102  putative translaldolase  53.7 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.150753  hitchhiker  0.00417913 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1479  transaldolase  55.05 
 
 		 217 aa  225  4e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4838  transaldolase  50.93 
 
 		 213 aa  225  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000777517  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1617  putative translaldolase  46.85 
 
 		 215 aa  224  6e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.68497  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2037  transaldolase  54.17 
 
 		 219 aa  224  9e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000238451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1489  putative translaldolase  54.84 
 
 		 217 aa  223  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0636  transaldolase  50.69 
 
 		 217 aa  222  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>