More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2458 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2458  Biotin synthase  100 
 
 		 339 aa  695    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2190  Biotin synthase  69.63 
 
 		 337 aa  477  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2839  Biotin synthase  65.86 
 
 		 337 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2430  Biotin synthase  65.26 
 
 		 336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0112  biotin synthase  61.93 
 
 		 337 aa  427  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2070  biotin synthase  59.09 
 
 		 340 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0078  Elongator protein 3/MiaB/NifB  59.09 
 
 		 330 aa  412  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  40.45 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  40.13 
 
 		 328 aa  225  7e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  39.74 
 
 		 328 aa  215  7e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  39.56 
 
 		 320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1908  Biotin synthase  41.11 
 
 		 370 aa  211  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  37.9 
 
 		 328 aa  210  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  36.22 
 
 		 329 aa  209  8e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  34.81 
 
 		 338 aa  206  3e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  36.5 
 
 		 329 aa  206  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  37.22 
 
 		 299 aa  202  6e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  39.66 
 
 		 325 aa  198  9e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  36.14 
 
 		 322 aa  197  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  37.82 
 
 		 329 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2296  biotin synthase  38.67 
 
 		 375 aa  195  7e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.966157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  36.12 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  36.01 
 
 		 321 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  36.59 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  35.94 
 
 		 364 aa  194  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  35.06 
 
 		 326 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0542557 
 
 
-
 
NC_002950  PG2081  biotin synthetase  36.76 
 
 		 330 aa  189  8e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  33.33 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  35.05 
 
 		 361 aa  186  5e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1753  biotin synthase  34.1 
 
 		 333 aa  186  7e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.65668  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  36.14 
 
 		 327 aa  182  7e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2541  biotin synthase  32.22 
 
 		 337 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00179392  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  34.07 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  34.17 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  35.03 
 
 		 388 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  34.95 
 
 		 368 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  37.36 
 
 		 368 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  35.64 
 
 		 332 aa  176  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  35.29 
 
 		 359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  36 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  35.64 
 
 		 332 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  33.02 
 
 		 333 aa  173  5e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  35.33 
 
 		 344 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  31.67 
 
 		 331 aa  172  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  35.27 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  34.91 
 
 		 332 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  34.91 
 
 		 332 aa  169  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  34.91 
 
 		 332 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  34.91 
 
 		 332 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  34.91 
 
 		 332 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  32.57 
 
 		 321 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  34.91 
 
 		 332 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  34.91 
 
 		 332 aa  169  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1435  biotin synthase  34.66 
 
 		 327 aa  169  8e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183377  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2890  biotin synthase  35.42 
 
 		 338 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0353  biotin synthase  35.02 
 
 		 327 aa  166  4e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  34.16 
 
 		 320 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  33.65 
 
 		 334 aa  165  9e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  35.87 
 
 		 368 aa  165  9e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  32.82 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  32.57 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  35.12 
 
 		 331 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  33.33 
 
 		 321 aa  162  7e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  34.55 
 
 		 361 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5738  biotin synthase  32.29 
 
 		 347 aa  162  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  33.33 
 
 		 321 aa  162  7e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  33.65 
 
 		 345 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0657  biotin synthase  32.39 
 
 		 324 aa  161  2e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  32.44 
 
 		 336 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  36.43 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  29.62 
 
 		 326 aa  160  3e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  34.67 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  32.54 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  31.79 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1428  biotin synthase  32.27 
 
 		 315 aa  160  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1556  biotin synthase  32.27 
 
 		 315 aa  160  4e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  32.44 
 
 		 339 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  32.54 
 
 		 339 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  32.54 
 
 		 339 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  32.54 
 
 		 339 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1222  biotin synthase  33.1 
 
 		 329 aa  159  5e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.213831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0484  biotin synthase  32.45 
 
 		 327 aa  159  5e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.631061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  32.54 
 
 		 336 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  34.33 
 
 		 361 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  32.17 
 
 		 321 aa  159  8e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  32.54 
 
 		 322 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  32.7 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  32.7 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10790  biotin synthase  31.64 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  32.78 
 
 		 359 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  34.27 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  35.64 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  32.31 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1569  biotin synthase  33.33 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0371  biotin synthase  32.88 
 
 		 339 aa  155  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.478786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  32.19 
 
 		 341 aa  155  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4625  biotin synthase  32.87 
 
 		 340 aa  155  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.970025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8311  Biotin synthase  32.62 
 
 		 332 aa  155  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2793  biotin synthase  34.81 
 
 		 331 aa  155  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.883098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0719  biotin synthase  34.46 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>