205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2336 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  100 
 
 
324 aa  668    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  82.1 
 
 
324 aa  558  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  61.37 
 
 
321 aa  403  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  61.06 
 
 
321 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  60.19 
 
 
321 aa  395  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  60.5 
 
 
321 aa  394  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  58.57 
 
 
321 aa  390  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  55.76 
 
 
325 aa  384  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  58.6 
 
 
321 aa  379  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  59.24 
 
 
321 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  59.24 
 
 
321 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  59.24 
 
 
321 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  59.56 
 
 
319 aa  377  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  53.44 
 
 
325 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  58.65 
 
 
327 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  58.92 
 
 
321 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  54.18 
 
 
506 aa  374  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  54.21 
 
 
321 aa  365  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  52.16 
 
 
336 aa  366  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  55.73 
 
 
327 aa  364  1e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2454  protein of unknown function DUF1568  54.43 
 
 
321 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257297  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  53.87 
 
 
325 aa  355  6.999999999999999e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  51.25 
 
 
323 aa  350  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  50.61 
 
 
320 aa  343  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  52.88 
 
 
295 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1578  hypothetical protein  53.58 
 
 
316 aa  331  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000706252  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  49.38 
 
 
333 aa  323  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0255  hypothetical protein  52.11 
 
 
288 aa  291  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0724188  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  45.03 
 
 
340 aa  276  4e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  42.9 
 
 
335 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  44.38 
 
 
335 aa  266  4e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  42.99 
 
 
338 aa  264  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2205  hypothetical protein  68.87 
 
 
160 aa  233  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  42.36 
 
 
323 aa  222  7e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  41.19 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  40.76 
 
 
326 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  37.38 
 
 
323 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  47.67 
 
 
180 aa  172  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  29.01 
 
 
316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  33.6 
 
 
318 aa  149  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  33.73 
 
 
319 aa  150  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2224  hypothetical protein  65.66 
 
 
112 aa  146  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00479916  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  33.19 
 
 
321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  37.44 
 
 
313 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0922  protein of unknown function DUF1568  42.53 
 
 
176 aa  139  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  33.82 
 
 
282 aa  132  7.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  33.09 
 
 
305 aa  129  8.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  46.15 
 
 
241 aa  126  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  29.38 
 
 
312 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2247  hypothetical protein  61.96 
 
 
101 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  34.31 
 
 
314 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  33.52 
 
 
253 aa  123  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  35.29 
 
 
312 aa  122  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  33.52 
 
 
253 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  34.64 
 
 
251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0167  hypothetical protein  55.45 
 
 
101 aa  119  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  27.19 
 
 
316 aa  119  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  27.6 
 
 
315 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  27.81 
 
 
316 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0741  protein of unknown function DUF1568  63.1 
 
 
97 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117883  normal  0.0672697 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  38.46 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  32.84 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01210  transposase  35.39 
 
 
245 aa  115  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  41.38 
 
 
231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  37.16 
 
 
288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  32.29 
 
 
287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  37.16 
 
 
288 aa  113  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2050  protein of unknown function DUF1568  37.61 
 
 
336 aa  112  7.000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.633564  normal  0.705399 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  36.61 
 
 
288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  34.48 
 
 
321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  36.24 
 
 
252 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  35.75 
 
 
239 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  41.1 
 
 
234 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  36.9 
 
 
277 aa  109  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  38.46 
 
 
226 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  36.81 
 
 
236 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2207  hypothetical protein  61.54 
 
 
81 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  29.88 
 
 
322 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  32.8 
 
 
241 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  41.26 
 
 
236 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  36.2 
 
 
236 aa  107  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  33.33 
 
 
232 aa  107  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  32.72 
 
 
250 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  32.26 
 
 
323 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  32.45 
 
 
289 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2216  hypothetical protein  67.61 
 
 
72 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.136455  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  27.58 
 
 
289 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  37.76 
 
 
235 aa  103  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  39.16 
 
 
234 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  26.03 
 
 
304 aa  100  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  36.36 
 
 
165 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  25.37 
 
 
287 aa  99.4  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  36.11 
 
 
231 aa  99  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  32.07 
 
 
230 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  36.81 
 
 
232 aa  95.1  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  32.61 
 
 
230 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  32.07 
 
 
230 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  29.73 
 
 
216 aa  95.1  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  33.15 
 
 
236 aa  94  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1785  hypothetical protein  27.62 
 
 
264 aa  93.2  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>