More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2297 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2297  30S ribosomal protein S10  100 
 
 		 102 aa  206  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238807  hitchhiker  0.00325794 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2065  30S ribosomal protein S10  96.12 
 
 		 103 aa  197  3e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000262077  normal  0.381336 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0288  30S ribosomal protein S10  95.15 
 
 		 103 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.42125  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0179  30S ribosomal protein S10  94.17 
 
 		 103 aa  195  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000562136  normal  0.948551 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1852  30S ribosomal protein S10  94.17 
 
 		 103 aa  195  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00631354  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2230  30S ribosomal protein S10  94.17 
 
 		 103 aa  194  3e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000010339  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2424  30S ribosomal protein S10  94.17 
 
 		 103 aa  194  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0052526  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1146  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 103 aa  135  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00144145  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4342  30S ribosomal protein S10  66 
 
 		 101 aa  135  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0589307  normal  0.109776 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05710  30S ribosomal protein S10  67 
 
 		 101 aa  133  8e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.751469  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0841  ribosomal protein S10  68.37 
 
 		 102 aa  133  9e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5570  ribosomal protein S10  65 
 
 		 101 aa  132  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.966668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0476  ribosomal protein S10  62 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0124  30S ribosomal protein S10  65.66 
 
 		 101 aa  130  6e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3163  30S ribosomal protein S10  62 
 
 		 101 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.547346 
 
 
-
 
NC_002950  PG1939  30S ribosomal protein S10  65 
 
 		 101 aa  128  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1614  ribosomal protein S10  60.4 
 
 		 101 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0398  30S ribosomal protein S10  66 
 
 		 101 aa  128  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0598  ribosomal protein S10  61 
 
 		 101 aa  127  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1554  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 		 103 aa  126  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000633059  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01160  ribosomal protein S10  58.82 
 
 		 103 aa  125  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000349687  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  57.58 
 
 		 102 aa  125  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  58.59 
 
 		 102 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2461  30S ribosomal protein S10  55 
 
 		 102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.043315 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 		 102 aa  124  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3796  30S ribosomal protein S10  54.9 
 
 		 104 aa  124  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000453996  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0224  ribosomal protein S10  56.57 
 
 		 102 aa  123  7e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0193  SSU ribosomal protein S10P  57.84 
 
 		 103 aa  123  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000113928  normal  0.060255 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1484  30S ribosomal protein S10  61 
 
 		 102 aa  123  8.000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0305  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 		 102 aa  123  9e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170298 
 
 
-
 
NC_002620  TC0720  30S ribosomal protein S10  58 
 
 		 105 aa  122  1e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0939005  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2066  30S ribosomal protein S10  61.86 
 
 		 105 aa  122  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000145478  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2334  ribosomal protein S10  55.88 
 
 		 103 aa  122  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000521962  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  58 
 
 		 102 aa  122  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 		 101 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4916  30S ribosomal protein S10  53.92 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175164  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0202  30S ribosomal protein S10  53.92 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0078  30S ribosomal protein S10  60.82 
 
 		 105 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0955651 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1363  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 		 102 aa  122  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.562313 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1933  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 		 101 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 		 101 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2294  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 		 102 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3668  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 		 102 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3449  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 		 102 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.852431 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0255  30S ribosomal protein S10  53.92 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000004332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3185  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 		 102 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1544  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 		 102 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5071  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 		 102 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.755306 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 		 101 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0707  ribosomal protein S10  60 
 
 		 101 aa  121  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00179336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0707  30S ribosomal protein S10  57.58 
 
 		 105 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1947  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 		 102 aa  121  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2965  30S ribosomal protein S10  57.58 
 
 		 102 aa  121  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0048  30S ribosomal protein S10  57.58 
 
 		 105 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2819  30S ribosomal protein S10  56.12 
 
 		 103 aa  121  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.662958 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3444  30S ribosomal protein S10  54.55 
 
 		 103 aa  121  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000018475  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3747  30S ribosomal protein S10  54.55 
 
 		 103 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016598  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2633  30S ribosomal protein S10  54.55 
 
 		 103 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000272648  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3329  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 		 102 aa  120  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000189761 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3777  30S ribosomal protein S10  54.55 
 
 		 103 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000424797  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0275  30S ribosomal protein S10  54.55 
 
 		 103 aa  120  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000312385  normal  0.114579 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3446  30S ribosomal protein S10  54.55 
 
 		 103 aa  120  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122515  normal  0.0314834 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2689  30S ribosomal protein S10  57.14 
 
 		 102 aa  120  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.283235  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3069  30S ribosomal protein S10  54.55 
 
 		 103 aa  120  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998747  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16250  SSU ribosomal protein S10P  57 
 
 		 107 aa  120  5e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00216069  hitchhiker  0.00000702102 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1839  30S ribosomal protein S10  57.14 
 
 		 102 aa  120  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.051766  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0326  30S ribosomal protein S10  54.55 
 
 		 103 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00113902  normal  0.0302801 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2760  30S ribosomal protein S10  54.55 
 
 		 103 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000915461  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3477  30S ribosomal protein S10  54.55 
 
 		 103 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000483294  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3805  30S ribosomal protein S10  54.55 
 
 		 103 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00677019  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0985  30S ribosomal protein S10  57.14 
 
 		 102 aa  120  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547253  normal  0.0405609 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3170  30S ribosomal protein S10  54.55 
 
 		 103 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357931  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0266  30S ribosomal protein S10  54.55 
 
 		 103 aa  120  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00303963  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0932  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 		 102 aa  120  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0025936  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0248  30S ribosomal protein S10  54.55 
 
 		 103 aa  120  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127153  normal  0.202124 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0347  30S ribosomal protein S10  54.55 
 
 		 103 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0012099  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1923  30S ribosomal protein S10  54.55 
 
 		 103 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000013045  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3020  30S ribosomal protein S10  53.92 
 
 		 104 aa  120  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000044729  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3181  30S ribosomal protein S10  54.55 
 
 		 102 aa  120  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000486821  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1419  ribosomal protein S10  57 
 
 		 117 aa  120  6e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2258  30S ribosomal protein S10  59.79 
 
 		 105 aa  120  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000323057  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3323  30S ribosomal protein S10  54.55 
 
 		 102 aa  120  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1766  30S ribosomal protein S10  59.79 
 
 		 105 aa  120  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000557802  normal  0.938375 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1197  30S ribosomal protein S10  57.14 
 
 		 102 aa  120  7e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.56445  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1234  30S ribosomal protein S10  57.14 
 
 		 102 aa  120  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159706  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0272  30S ribosomal protein S10  54.55 
 
 		 103 aa  120  7e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.0000000000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0700  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 		 102 aa  120  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000505972  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0390  30S ribosomal protein S10  54.55 
 
 		 103 aa  120  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000705562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0337  30S ribosomal protein S10  54.55 
 
 		 103 aa  120  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012954  decreased coverage  0.000295628 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1955  30S ribosomal protein S10  57.14 
 
 		 102 aa  120  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158653  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0277  30S ribosomal protein S10  54.55 
 
 		 103 aa  120  7e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000127009  decreased coverage  0.000000000926134 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1678  30S ribosomal protein S10  57.14 
 
 		 102 aa  120  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.196634  hitchhiker  0.0000449756 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0290  30S ribosomal protein S10  58.82 
 
 		 102 aa  120  7e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153979  unclonable  7.221610000000001e-29 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0679  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 		 102 aa  120  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330255  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2858  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 		 102 aa  120  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800784  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4006  ribosomal protein S10  57.14 
 
 		 102 aa  120  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0232097  normal  0.70609 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1163  ribosomal protein S10  57.14 
 
 		 102 aa  120  8e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000940072  hitchhiker  0.000000509949 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1331  30S ribosomal protein S10  56.12 
 
 		 102 aa  120  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104333  normal  0.0980723 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1429  30S ribosomal protein S10  56.12 
 
 		 102 aa  120  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0117668  normal  0.0108914 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0846  SSU ribosomal protein S10P  57.84 
 
 		 103 aa  120  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264723  decreased coverage  0.00000947215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>