More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2296 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2296  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 209 aa  419  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00600066  hitchhiker  0.00331239 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2064  50S ribosomal protein L3  80.86 
 
 		 209 aa  353  1e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000717701  normal  0.401636 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2423  50S ribosomal protein L3  67.46 
 
 		 209 aa  306  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00498434  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2229  50S ribosomal protein L3  70.33 
 
 		 209 aa  305  2.0000000000000002e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000790762  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0289  50S ribosomal protein L3  69.86 
 
 		 209 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0180  50S ribosomal protein L3  68.9 
 
 		 209 aa  298  5e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00021825  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1851  50S ribosomal protein L3  67.46 
 
 		 209 aa  292  3e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.132189  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05715  50S ribosomal protein L3  57 
 
 		 205 aa  233  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0397  50S ribosomal protein L3  58.05 
 
 		 205 aa  233  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0602  ribosomal protein L3  58.13 
 
 		 205 aa  230  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4343  50S ribosomal protein L3  56.31 
 
 		 206 aa  229  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239943  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3162  50S ribosomal protein L3  55.12 
 
 		 206 aa  226  3e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5787  50S ribosomal protein L3  54.37 
 
 		 220 aa  222  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0786499 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1147  50S ribosomal protein L3  53.4 
 
 		 205 aa  221  4.9999999999999996e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000530687  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  55.61 
 
 		 205 aa  221  6e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0197  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 210 aa  211  4.9999999999999996e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.555383 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1615  ribosomal protein L3  54.63 
 
 		 205 aa  211  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  50.75 
 
 		 210 aa  206  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  48.04 
 
 		 210 aa  204  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  49.06 
 
 		 212 aa  204  7e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0842  ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 210 aa  202  4e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  47.55 
 
 		 210 aa  201  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  51.47 
 
 		 212 aa  200  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 209 aa  198  5e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  51.03 
 
 		 214 aa  195  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  51.46 
 
 		 209 aa  194  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  50.73 
 
 		 204 aa  192  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 212 aa  191  5e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  52.33 
 
 		 211 aa  190  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0458  50S ribosomal protein L3P  49.5 
 
 		 218 aa  190  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3923  50S ribosomal protein L3  48.26 
 
 		 219 aa  189  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  48.76 
 
 		 208 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 210 aa  188  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  45.63 
 
 		 222 aa  188  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 210 aa  188  5e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  51.46 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  48.58 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  51.46 
 
 		 208 aa  186  3e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  51.47 
 
 		 209 aa  186  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 208 aa  186  3e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  46.89 
 
 		 213 aa  185  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  44.5 
 
 		 219 aa  184  6e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4315  50S ribosomal protein L3  46.77 
 
 		 219 aa  184  7e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  47.76 
 
 		 209 aa  184  8e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3317  50S ribosomal protein L3  43.96 
 
 		 214 aa  184  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000449005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2619  50S ribosomal protein L3  47.37 
 
 		 214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0132285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3447  50S ribosomal protein L3  44.93 
 
 		 217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000108395  normal  0.0130308 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  45.15 
 
 		 216 aa  183  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  47.78 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0582  50S ribosomal protein L3  47.09 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  48.02 
 
 		 211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3524  ribosomal protein L3  46.53 
 
 		 212 aa  182  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000015584  hitchhiker  0.00000758128 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1340  50S ribosomal protein L3  47.06 
 
 		 205 aa  182  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3909  50S ribosomal protein L3  48.7 
 
 		 209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.031884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  48.7 
 
 		 214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  45.15 
 
 		 219 aa  182  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2759  50S ribosomal protein L3  44.44 
 
 		 217 aa  181  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000332087  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0348  50S ribosomal protein L3  44.44 
 
 		 217 aa  181  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000116037  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3179  50S ribosomal protein L3  43 
 
 		 216 aa  181  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000128128  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0327  50S ribosomal protein L3  44.44 
 
 		 216 aa  181  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000900525  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  44.17 
 
 		 215 aa  181  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2324  ribosomal protein L3  45.64 
 
 		 215 aa  181  8.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000235705  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  45.15 
 
 		 216 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3297  50S ribosomal protein L3  43 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000538385  hitchhiker  0.0000807722 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00445  50S ribosomal protein L3  45.88 
 
 		 212 aa  180  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000559916  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0454  50S ribosomal protein L3  48.19 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00952841  unclonable  0.000000209689 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  47.52 
 
 		 206 aa  180  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2950  50S ribosomal protein L3  43 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000276942  decreased coverage  0.000000134206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0484  50S ribosomal protein L3  48.19 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000200613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0487  50S ribosomal protein L3  48.19 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000838631  normal  0.0709669 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4548  50S ribosomal protein L3  47.67 
 
 		 211 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00256892  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2840  50S ribosomal protein L3  43.48 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000111519  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  50.75 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  44.02 
 
 		 226 aa  179  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0276  50S ribosomal protein L3  43.96 
 
 		 216 aa  179  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000762346  normal  0.121842 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0469  50S ribosomal protein L3  46.91 
 
 		 212 aa  179  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000509154  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0267  50S ribosomal protein L3  43.96 
 
 		 217 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000416166  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0291  50S ribosomal protein L3  46.83 
 
 		 226 aa  179  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0279726  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  44.98 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  45.63 
 
 		 216 aa  178  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  47.52 
 
 		 206 aa  178  4.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  50.75 
 
 		 210 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  48.54 
 
 		 209 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  43.2 
 
 		 218 aa  178  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  45.45 
 
 		 219 aa  178  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  50.75 
 
 		 210 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4749  50S ribosomal protein L3  47.15 
 
 		 211 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000212363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3644  50S ribosomal protein L3  43.48 
 
 		 219 aa  177  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000185363  hitchhiker  0.0000000000200291 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3019  50S ribosomal protein L3  42.57 
 
 		 220 aa  177  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000216849  hitchhiker  0.0059333 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0314  50S ribosomal protein L3  43.48 
 
 		 219 aa  177  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000138197  hitchhiker  0.00855725 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2632  50S ribosomal protein L3  43 
 
 		 219 aa  177  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.000000000488611  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3776  50S ribosomal protein L3  43 
 
 		 219 aa  177  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000325408  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3169  50S ribosomal protein L3  43 
 
 		 219 aa  177  8e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000263976  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0279  50S ribosomal protein L3  43.96 
 
 		 214 aa  177  8e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000003338  unclonable  0.000000102958 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1924  50S ribosomal protein L3  43 
 
 		 219 aa  177  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000132844  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3478  50S ribosomal protein L3  43 
 
 		 219 aa  177  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.00000000879138  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3746  50S ribosomal protein L3  43 
 
 		 219 aa  177  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000021686  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0626  ribosomal protein L3  47.15 
 
 		 211 aa  177  9e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000165351  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3068  50S ribosomal protein L3  43 
 
 		 219 aa  177  9e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000718216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>