More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2287 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2287  30S ribosomal protein S17  100 
 
 		 89 aa  178  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000132809  hitchhiker  0.00277508 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2055  30S ribosomal protein S17  79.78 
 
 		 99 aa  154  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000336499  normal  0.395653 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0190  30S ribosomal protein S17  83.53 
 
 		 94 aa  153  8e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00542058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1842  30S ribosomal protein S17  80.9 
 
 		 89 aa  152  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0587769  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2414  30S ribosomal protein S17  80.46 
 
 		 101 aa  152  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000854587  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0298  30S ribosomal protein S17  77.53 
 
 		 94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2220  30S ribosomal protein S17  77.01 
 
 		 99 aa  125  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000577786  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  61.18 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  61.18 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  64.1 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  67.57 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 101 aa  107  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03162  30S ribosomal protein S17  67.12 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0016617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  67.12 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3742  30S ribosomal protein S17  67.12 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000425306  hitchhiker  0.00355064 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  67.12 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  67.12 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  67.12 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  67.12 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  67.12 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  67.12 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  67.12 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  67.12 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3798  30S ribosomal protein S17  65.75 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0301634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3627  30S ribosomal protein S17  65.75 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000562694  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3700  30S ribosomal protein S17  65.75 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000665408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4535  30S ribosomal protein S17  64.38 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011061  hitchhiker  0.0016313 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3735  30S ribosomal protein S17  65.75 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000974473  normal  0.0213342 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3627  30S ribosomal protein S17  65.75 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00167821  normal  0.881176 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  61.54 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3813  30S ribosomal protein S17  65.75 
 
 		 84 aa  104  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000352623  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0292  30S ribosomal protein S17  64.38 
 
 		 84 aa  103  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000607542  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0332  ribosomal protein S17  65.75 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000873863  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3153  30S ribosomal protein S17  60.24 
 
 		 87 aa  102  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0414  ribosomal protein S17  64.38 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0217362  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0068  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 84 aa  100  5e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 82 aa  100  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 82 aa  100  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000115651  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  58.9 
 
 		 89 aa  100  1e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  56.1 
 
 		 85 aa  99.8  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0167  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 82 aa  98.6  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350413  hitchhiker  0.000281031 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0157  ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 82 aa  98.6  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000117396  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4161  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 82 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038185  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0205  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 82 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000179685  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4047  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 82 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100461  unclonable  0.00000000000380928 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3750  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 82 aa  98.2  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000077178  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0209  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 82 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000139872  unclonable  0.00000794162 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0179  ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 82 aa  98.2  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000265086  n/a   
 
 
 
NC_010506  Swoo_4681  30S ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 82 aa  98.6  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000864007  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4352  30S ribosomal protein S17  56.47 
 
 		 87 aa  98.6  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186006  normal  0.0710567 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  61.33 
 
 		 85 aa  98.2  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  58.23 
 
 		 86 aa  97.8  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  55.95 
 
 		 88 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  52.38 
 
 		 88 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  55.95 
 
 		 88 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0968  30S ribosomal protein S17  55.95 
 
 		 88 aa  97.4  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132893  hitchhiker  0.000000938527 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  52.38 
 
 		 88 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  54.88 
 
 		 120 aa  97.4  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 82 aa  97.1  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0208  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 82 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000014726  unclonable  0.0000000000149425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0203  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 82 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 82 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000159917  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  55.95 
 
 		 88 aa  96.7  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  55.95 
 
 		 88 aa  96.7  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2315  30S ribosomal protein S17  54.55 
 
 		 87 aa  96.7  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0524873  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00454  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 85 aa  96.3  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.301377  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 85 aa  96.3  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1022  SSU ribosomal protein S17P  54.02 
 
 		 99 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0401706  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3906  ribosomal protein s17  62.69 
 
 		 88 aa  96.3  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000281241  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 84 aa  96.7  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 84 aa  96.7  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4267  ribosomal protein S17  60.27 
 
 		 86 aa  96.3  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000045276  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1039  SSU ribosomal protein S17P  54.02 
 
 		 99 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0891213  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3515  ribosomal protein S17  56.41 
 
 		 83 aa  96.3  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000390975  hitchhiker  0.000000987028 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  52.38 
 
 		 88 aa  96.7  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  55 
 
 		 91 aa  95.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  0.000000000246265 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2363  ribosomal protein S17  53.16 
 
 		 86 aa  95.5  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.577527  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3749  30S ribosomal protein S17  53.41 
 
 		 94 aa  95.9  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1049  SSU ribosomal protein S17P  56.1 
 
 		 99 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 85 aa  95.5  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  55 
 
 		 91 aa  95.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  52.33 
 
 		 96 aa  95.1  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  53.57 
 
 		 88 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  54.65 
 
 		 98 aa  95.1  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  52.38 
 
 		 88 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  52.38 
 
 		 88 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  52.38 
 
 		 88 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  54.88 
 
 		 90 aa  94  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  54.88 
 
 		 100 aa  94  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  55.29 
 
 		 89 aa  93.6  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2678  ribosomal protein S17  53.49 
 
 		 101 aa  94  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0849  30S ribosomal protein S17  54.79 
 
 		 86 aa  93.6  9e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1314  ribosomal protein S17  56.1 
 
 		 98 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.959285  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0332  30S ribosomal protein S17  56.76 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000351608  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0478  30S ribosomal protein S17  56.16 
 
 		 83 aa  93.2  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.112019  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0222  30S ribosomal subunit protein S17  58.9 
 
 		 82 aa  93.2  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000618059  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  52.33 
 
 		 91 aa  92  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2315  ribosomal protein S17  54.67 
 
 		 86 aa  92  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000099877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>