More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2281 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2281  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 179 aa  363  1e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000308698  hitchhiker  0.00356938 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  81.56 
 
 		 180 aa  315  2e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  72.07 
 
 		 179 aa  270  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0304  50S ribosomal protein L6  73.74 
 
 		 179 aa  270  9e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.361286  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  71.51 
 
 		 179 aa  267  5e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0196  50S ribosomal protein L6  69.83 
 
 		 179 aa  263  1e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1836  50S ribosomal protein L6  69.27 
 
 		 179 aa  260  6e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532668  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  54.05 
 
 		 184 aa  197  7e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  195  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  190  9e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 178 aa  189  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  187  7e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1630  ribosomal protein L6  51.09 
 
 		 184 aa  183  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0504  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl138  50S ribosomal protein L6  47.22 
 
 		 180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  48.59 
 
 		 178 aa  179  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1926  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 		 180 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459918 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 179 aa  179  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  52.54 
 
 		 181 aa  179  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 182 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1931  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 		 180 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1923  50S ribosomal protein L6  45.36 
 
 		 183 aa  178  2.9999999999999997e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 178 aa  178  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  49.72 
 
 		 178 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2033  50S ribosomal protein L6  47.19 
 
 		 180 aa  177  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.693671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1948  50S ribosomal protein L6  47.19 
 
 		 180 aa  177  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  50 
 
 		 183 aa  177  8e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000853841  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  49.16 
 
 		 177 aa  177  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  48.31 
 
 		 179 aa  175  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 178 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3147  50S ribosomal protein L6  47.57 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042273  normal  0.594052 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 180 aa  174  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  50 
 
 		 179 aa  174  5e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  48.33 
 
 		 181 aa  174  7e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 179 aa  174  8e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 179 aa  174  9e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  173  9e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  46.33 
 
 		 178 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0617  ribosomal protein L6  48.91 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1559  ribosomal protein L6  47.75 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000979408  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  48.88 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  47.49 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  48.89 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5772  ribosomal protein L6  48.37 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245176  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0182  50S ribosomal protein L6  48.37 
 
 		 184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.280256 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1730  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00717993  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 178 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0376  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.667963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  46.37 
 
 		 178 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  48.82 
 
 		 182 aa  171  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  47.75 
 
 		 179 aa  171  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0210  50S ribosomal protein L6  46.89 
 
 		 178 aa  171  5e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0240  ribosomal protein L6  46.89 
 
 		 181 aa  171  5.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.358397  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 179 aa  171  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3053  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 176 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000512294  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  170  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0338  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  170  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  170  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1307  50S ribosomal protein L6  46.74 
 
 		 184 aa  170  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236844  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  46.93 
 
 		 178 aa  169  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1379  50S ribosomal protein L6  46.74 
 
 		 184 aa  170  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 179 aa  169  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  44.13 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0073  50S ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  47.49 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2604  50S ribosomal protein L6  46.93 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000953175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1923  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591582  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  47.19 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0211  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 		 178 aa  169  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  47.95 
 
 		 182 aa  168  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  48.33 
 
 		 180 aa  169  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  168  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3761  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 176 aa  168  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0024508  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3731  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 176 aa  168  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000218121  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1939  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 176 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0207492  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  46.93 
 
 		 179 aa  168  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>