293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2240 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 230 aa  474  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  50.44 
 
 		 230 aa  224  7e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  42.11 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  42.27 
 
 		 231 aa  190  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0336  phosphoribosyltransferase  44.49 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  37.78 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0226  competence protein  40.39 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  32.02 
 
 		 226 aa  128  9.000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1381  phosphoribosyltransferase protein-like protein  32.74 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.431166  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  32.9 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  34.73 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  35.11 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  29.03 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  31.43 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  30.97 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  32.56 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.74 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  28.45 
 
 		 239 aa  99  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  31.28 
 
 		 251 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  31.19 
 
 		 259 aa  94.7  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  30.37 
 
 		 247 aa  94.4  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  35.95 
 
 		 236 aa  92.4  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0541  phosphoribosyltransferase  30.57 
 
 		 269 aa  92.4  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  31.25 
 
 		 262 aa  92.4  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.25 
 
 		 215 aa  92  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  33.18 
 
 		 262 aa  92  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  27.35 
 
 		 236 aa  92  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 223 aa  91.7  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  30.37 
 
 		 229 aa  91.7  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  29.72 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  29.46 
 
 		 220 aa  90.9  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  32.17 
 
 		 279 aa  90.1  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  30.26 
 
 		 220 aa  89.4  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1405  competence protein F  33.63 
 
 		 256 aa  89  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.509153  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  29.34 
 
 		 237 aa  89  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  36.65 
 
 		 215 aa  89  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  25.21 
 
 		 226 aa  88.6  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0661  phosphoribosyltransferase  34.5 
 
 		 222 aa  88.6  8e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  37.5 
 
 		 270 aa  88.2  9e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  34.39 
 
 		 255 aa  88.2  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 		 258 aa  87.8  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  29.18 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  32.14 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  29.79 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  29.06 
 
 		 217 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  29.06 
 
 		 217 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  32.34 
 
 		 262 aa  86.7  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  29.95 
 
 		 255 aa  86.7  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  34.84 
 
 		 271 aa  85.9  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  28.99 
 
 		 255 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  32.03 
 
 		 232 aa  85.9  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  27.09 
 
 		 245 aa  85.5  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  35.19 
 
 		 213 aa  85.5  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  32.68 
 
 		 235 aa  85.1  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  29.2 
 
 		 229 aa  85.5  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  30.71 
 
 		 269 aa  85.5  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  29.32 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  29.96 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  32.17 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0367  comF family protein  30.67 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  29.24 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  34.19 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  28.39 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  34.15 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1047  amidophosphoribosyltransferase family protein  32.26 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  31.91 
 
 		 246 aa  81.6  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  28.22 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2510  phosphoribosyltransferase  33.61 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3805  competence protein ComF  29.15 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.274004 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3881  competence protein ComF  29.15 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  29.09 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  28.21 
 
 		 204 aa  81.6  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  29.21 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  29.02 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  29.61 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  30.04 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.21 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4330  competence protein ComF  34.9 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  29.49 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  34.85 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  29.96 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4198  competence protein ComF  34.9 
 
 		 263 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  27.57 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4009  competence protein ComF  34.9 
 
 		 262 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0141  competence protein ComF  34.9 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  28.14 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4126  competence protein ComF  34.9 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  26.75 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  28.1 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2633  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.25 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  31.91 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4625  competence protein ComF  33.56 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  34.62 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  26.51 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  38.05 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  37.72 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0998  hypothetical protein  30.7 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.338338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 242 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>