More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2213 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  100 
 
 		 457 aa  947    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  58.04 
 
 		 460 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  49.04 
 
 		 453 aa  426  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0247  M24/M37 family peptidase  45.98 
 
 		 449 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  36.78 
 
 		 479 aa  223  8e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  34.55 
 
 		 472 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  35.33 
 
 		 475 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  35.33 
 
 		 473 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  35.05 
 
 		 473 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  34.05 
 
 		 503 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  34.15 
 
 		 447 aa  212  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  34.15 
 
 		 468 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  32.99 
 
 		 490 aa  209  6e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  36.24 
 
 		 470 aa  209  9e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  36.75 
 
 		 465 aa  208  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  33.15 
 
 		 490 aa  204  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  32.61 
 
 		 474 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  31.97 
 
 		 533 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  32.99 
 
 		 569 aa  200  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  33.06 
 
 		 475 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  33.24 
 
 		 437 aa  199  9e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  32.49 
 
 		 517 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  33.1 
 
 		 439 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  37.84 
 
 		 429 aa  198  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  35.22 
 
 		 741 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.75 
 
 		 441 aa  196  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  33.75 
 
 		 475 aa  196  9e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  34.37 
 
 		 429 aa  193  7e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  32.69 
 
 		 480 aa  192  9e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  33.61 
 
 		 441 aa  188  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  32.08 
 
 		 513 aa  187  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  35.53 
 
 		 523 aa  187  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  30.66 
 
 		 472 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  32.96 
 
 		 440 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  32.96 
 
 		 437 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  32.96 
 
 		 440 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  30.46 
 
 		 448 aa  180  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  34.77 
 
 		 491 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  29.25 
 
 		 471 aa  179  8e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  36.62 
 
 		 435 aa  178  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  29.48 
 
 		 471 aa  178  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  30.98 
 
 		 417 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  30.87 
 
 		 460 aa  177  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  33.06 
 
 		 477 aa  176  6e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1368  peptidase M23  33.69 
 
 		 434 aa  176  9e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  35.71 
 
 		 490 aa  176  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  32.21 
 
 		 503 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  34.59 
 
 		 498 aa  174  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  42.21 
 
 		 312 aa  174  3.9999999999999995e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  32.51 
 
 		 477 aa  173  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  30.32 
 
 		 470 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  34.67 
 
 		 512 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  31.72 
 
 		 438 aa  173  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  34.51 
 
 		 475 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  30.84 
 
 		 439 aa  169  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  30.94 
 
 		 459 aa  169  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  33.23 
 
 		 470 aa  169  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  33.33 
 
 		 468 aa  169  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  31.98 
 
 		 475 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  32.54 
 
 		 491 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  32.25 
 
 		 466 aa  168  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  33.02 
 
 		 468 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  31.99 
 
 		 462 aa  166  9e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  31.73 
 
 		 468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  31.73 
 
 		 468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  31.73 
 
 		 468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  31.66 
 
 		 466 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0732  peptidase M23B  33.84 
 
 		 406 aa  164  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  31.87 
 
 		 482 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  29.8 
 
 		 433 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  29.8 
 
 		 433 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  29.8 
 
 		 433 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  29.8 
 
 		 433 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2450  peptidase M23B  32.78 
 
 		 428 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1433  peptidase M23B  32.26 
 
 		 380 aa  161  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.484783  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  38.38 
 
 		 386 aa  160  4e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  31.91 
 
 		 431 aa  160  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  29.71 
 
 		 430 aa  159  8e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  28.33 
 
 		 464 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0270  M23 peptidase domain-containing protein  30.22 
 
 		 423 aa  159  1e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00486213  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  33.43 
 
 		 385 aa  157  3e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  38.03 
 
 		 386 aa  157  4e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1920  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  30.22 
 
 		 452 aa  157  4e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0283385  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  38.03 
 
 		 386 aa  157  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  38.11 
 
 		 465 aa  157  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  32.04 
 
 		 434 aa  156  6e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  29.16 
 
 		 491 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  31 
 
 		 431 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  31 
 
 		 431 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  32.75 
 
 		 472 aa  155  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  31 
 
 		 431 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  29.26 
 
 		 464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  30.49 
 
 		 430 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  33.13 
 
 		 429 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  32.31 
 
 		 419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3955  peptidase M23B  30.28 
 
 		 457 aa  154  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053083  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3617  peptidase M23B  30.28 
 
 		 457 aa  154  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0923859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  36.94 
 
 		 460 aa  153  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  31.72 
 
 		 353 aa  154  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  33.13 
 
 		 389 aa  153  5.9999999999999996e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>