172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2191 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2191  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 
126 aa  265  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1956  dihydroneopterin aldolase  69.11 
 
 
129 aa  184  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2568  dihydroneopterin aldolase  61.02 
 
 
125 aa  155  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2140  dihydroneopterin aldolase  58.2 
 
 
125 aa  152  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2294  dihydroneopterin aldolase  56.3 
 
 
125 aa  149  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.779597  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0269  dihydroneopterin aldolase family protein  58.47 
 
 
125 aa  147  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1513  dihydroneopterin aldolase  51.26 
 
 
138 aa  131  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0233  dihydroneopterin aldolase family protein  43.65 
 
 
126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2247  dihydroneopterin aldolase  43.12 
 
 
122 aa  96.3  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1970  dihydroneopterin aldolase  43.12 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.380484 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2182  dihydroneopterin aldolase  42.2 
 
 
121 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441535  normal  0.0141714 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2116  dihydroneopterin aldolase  39.09 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2582  dihydroneopterin aldolase  38.83 
 
 
122 aa  85.9  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3225  dihydroneopterin aldolase family protein  40.19 
 
 
121 aa  84.3  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0073  dihydroneopterin aldolase  41.75 
 
 
126 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1030  dihydroneopterin aldolase  36.7 
 
 
119 aa  83.2  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.235973  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0996  dihydroneopterin aldolase  36.7 
 
 
119 aa  83.2  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1533  dihydroneopterin aldolase  37.61 
 
 
123 aa  83.6  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42318 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0965  dihydroneopterin aldolase  37.86 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.877647  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1413  dihydroneopterin aldolase  40.37 
 
 
119 aa  81.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0311  dihydroneopterin aldolase  37.61 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5834  dihydroneopterin aldolase  36.94 
 
 
116 aa  80.1  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.384012  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0236  dihydroneopterin aldolase  38.83 
 
 
121 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.965704 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1499  dihydroneopterin aldolase  35.42 
 
 
119 aa  78.6  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0071  dihydroneopterin aldolase  34.34 
 
 
120 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2889  dihydroneopterin aldolase  34.55 
 
 
116 aa  77.4  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0080  dihydroneopterin aldolase  34.34 
 
 
120 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.884777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0084  dihydroneopterin aldolase  34.34 
 
 
120 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.940735  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1114  dihydroneopterin aldolase  34.38 
 
 
120 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0152  dihydroneopterin aldolase  36.11 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.011872  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0072  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0068  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0068  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0072  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0081  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000108398 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5236  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000922875 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0068  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0407  dihydroneopterin aldolase  34.23 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  decreased coverage  0.00598583 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2579  dihydroneopterin aldolase  34.4 
 
 
126 aa  74.7  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1765  dihydroneopterin aldolase  33.65 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0803324  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1813  dihydroneopterin aldolase  33.65 
 
 
130 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.968446 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0155  dihydroneopterin aldolase  31.25 
 
 
131 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5982  dihydroneopterin aldolase  34.31 
 
 
122 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102976  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2091  dihydroneopterin aldolase  39.81 
 
 
117 aa  72  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.951918 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0068  dihydroneopterin aldolase  32.32 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2149  dihydroneopterin aldolase  32.69 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0512  dihydroneopterin aldolase  28.21 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0070  dihydroneopterin aldolase  42.42 
 
 
126 aa  70.1  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1072  dihydroneopterin aldolase  33.65 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000958516 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1280  dihydroneopterin aldolase  33.65 
 
 
111 aa  69.3  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000396962  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3529  dihydroneopterin aldolase  36.27 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0826  dihydroneopterin aldolase  35.92 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03415  FolB  36.45 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0154  dihydroneopterin aldolase  37.86 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1331  dihydroneopterin aldolase  33.93 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.951458  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0921  dihydroneopterin aldolase  32.67 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.294269  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0537  dihydroneopterin aldolase  28.3 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0923688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0550  dihydroneopterin aldolase  28.3 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2194  dihydroneopterin aldolase  32.41 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343507  normal  0.0385809 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0154  dihydroneopterin aldolase  31.43 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.867161  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1880  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  30.1 
 
 
276 aa  65.1  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00242746  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1882  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  30.1 
 
 
292 aa  65.1  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.586042  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1230  dihydroneopterin aldolase  31.37 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0761  dihydroneopterin aldolase  31.78 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.811624  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0397  dihydroneopterin aldolase  32.08 
 
 
124 aa  62  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.294634  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27090  dihydroneopterin aldolase  32.04 
 
 
119 aa  61.2  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0317  dihydroneopterin aldolase  35.64 
 
 
135 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3025  dihydroneopterin aldolase (DHNA)  28.57 
 
 
122 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1428  dihydroneopterin aldolase  27.72 
 
 
120 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10591  dihydroneopterin aldolase  27.68 
 
 
127 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.279574  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3534  dihydroneopterin aldolase  27.59 
 
 
125 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0920565  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1274  dihydroneopterin aldolase  34.86 
 
 
116 aa  60.1  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.436023  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1014  dihydroneopterin aldolase  32.11 
 
 
119 aa  60.5  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2634  dihydroneopterin aldolase  27.45 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0808161  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01270  dihydroneopterin aldolase  32.48 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2101  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  31.9 
 
 
841 aa  58.9  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0591  dihydroneopterin aldolase  28.3 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.503596  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1931  dihydroneopterin aldolase  25.86 
 
 
125 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190594  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1032  dihydroneopterin aldolase  31.78 
 
 
121 aa  57.8  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0687  dihydroneopterin aldolase  28.71 
 
 
120 aa  57.8  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35620  dihydroneopterin aldolase  31.68 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.192701  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5757  dihydroneopterin aldolase  31.37 
 
 
126 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.608732 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2234  dihydroneopterin aldolase  28.43 
 
 
121 aa  57  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2043  dihydroneopterin aldolase  24.79 
 
 
121 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33546  predicted protein  31.31 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183878  hitchhiker  0.00808853 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1764  dihydroneopterin aldolase  24.11 
 
 
126 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06171  dihydroneopterin aldolase  26.42 
 
 
120 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32060  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  30.56 
 
 
1211 aa  55.1  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0098  dihydroneopterin aldolase; RBL03201  31.07 
 
 
123 aa  54.3  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.473342  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0040  dihydroneopterin aldolase dihydroneopterin aldolase  25.81 
 
 
125 aa  53.9  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0096  dihydroneopterin aldolase  33.01 
 
 
123 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06471  dihydroneopterin aldolase  26.42 
 
 
120 aa  53.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06561  dihydroneopterin aldolase  24.27 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4974  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  31.18 
 
 
310 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2328  dihydroneopterin aldolase  29.7 
 
 
124 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00313661  normal  0.014777 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4785  dihydroneopterin aldolase  26.32 
 
 
144 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0888028  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13639  dihydroneopterin aldolase folB  27.72 
 
 
133 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  hitchhiker  0.00236264 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2349  dihydroneopterin aldolase  29.29 
 
 
125 aa  51.2  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0828441  normal  0.0512574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6235  dihydroneopterin aldolase  28.42 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.353905  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1675  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 
143 aa  50.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0522559 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>