89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2164 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2164  CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 
291 aa  607  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0192086  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1413  CRISPR-associated protein Cas1  95.88 
 
 
291 aa  587  1e-167  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0233391  normal  0.0713718 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0906  CRISPR-associated protein Cas1  71.12 
 
 
291 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16838  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2676  CRISPR-associated protein Cas1  68.59 
 
 
291 aa  433  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3013  CRISPR-associated protein Cas1  39.85 
 
 
320 aa  209  5e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00425226  decreased coverage  0.00852288 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1236  CRISPR-associated protein Cas1  39.85 
 
 
337 aa  206  5e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00257289  normal  0.15537 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17300  CRISPR-associated protein, Cas1 family  40.45 
 
 
342 aa  202  7e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2636  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.33 
 
 
316 aa  201  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.34834  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1901  CRISPR-associated protein Cas1  40.6 
 
 
324 aa  200  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0023  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.33 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408897  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0645  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.58 
 
 
315 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.354682  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0599  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.64 
 
 
303 aa  195  9e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000773136  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0765  CRISPR-associated endonuclease Cas1, ECOLI subtype  34.83 
 
 
313 aa  194  1e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2337  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.7 
 
 
307 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00747033  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2989  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.11 
 
 
309 aa  193  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.786147  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1392  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.02 
 
 
306 aa  193  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2685  CRISPR-associated protein Cas1  38.29 
 
 
315 aa  192  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000995939  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2474  CRISPR-associated protein Cas1  38.31 
 
 
307 aa  192  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2444  CRISPR-associated protein Cas1  37.69 
 
 
303 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68429 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1602  CRISPR-associated protein Cas1  38.4 
 
 
303 aa  191  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.19087  normal  0.843574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4088  CRISPR-associated protein Cas1  38.81 
 
 
303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0463414  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1530  CRISPR-associated protein Cas1  37.17 
 
 
327 aa  188  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00231307  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0964  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.9 
 
 
306 aa  188  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0169  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.31 
 
 
313 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2830  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.88 
 
 
306 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3541  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.83 
 
 
307 aa  186  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.608984  normal  0.0531608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3904  CRISPR-associated protein Cas1  37.04 
 
 
323 aa  185  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242948  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1808  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.01 
 
 
320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0835  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.78 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3320  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.01 
 
 
320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.118981  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00872  CRISPR-associated protein Cas1  35.61 
 
 
306 aa  183  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0983  CRISPR-associated protein Cas1  34.03 
 
 
314 aa  182  6e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0232  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.36 
 
 
306 aa  180  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3755  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.36 
 
 
304 aa  180  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3049  CRISPR-associated protein Cas1  36.3 
 
 
318 aa  180  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000891408  hitchhiker  0.000905677 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0403  CRISPR-associated protein Cas1  35.74 
 
 
305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0402524  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2894  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.36 
 
 
305 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0928  CRISPR-associated protein Cas1  36.2 
 
 
303 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0957  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.36 
 
 
305 aa  178  9e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0933  CRISPR-associated protein Cas1  35.36 
 
 
305 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5409  CRISPR-associated protein Cas1  38.66 
 
 
314 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.031752  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3585  CRISPR-associated protein Cas1  36.12 
 
 
307 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1375  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.88 
 
 
299 aa  177  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00127759  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0858  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.33 
 
 
255 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.41465  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3092  crispr-associated protein Cas1  36.09 
 
 
305 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2883  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.36 
 
 
307 aa  176  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921772  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3057  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.98 
 
 
306 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3148  CRISPR-associated protein Cas1  35.71 
 
 
305 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1592  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.71 
 
 
305 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.328898 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3132  CRISPR-associated protein Cas1  34.22 
 
 
306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3066  CRISPR-associated protein Cas1  34.22 
 
 
306 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3249  crispr-associated protein Cas1  34.22 
 
 
306 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222064  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4008  CRISPR-associated protein Cas1  34.6 
 
 
307 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1286  CRISPR-associated protein Cas1  36.33 
 
 
327 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1977  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.71 
 
 
320 aa  170  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147845  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2578  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.56 
 
 
322 aa  169  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0729404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0422  CRISPR-associated protein Cas1  34.42 
 
 
319 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0368078  normal  0.0376622 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0946  CRISPR-associated protein Cas1  33.68 
 
 
324 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.291315  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17190  CRISPR-associated protein, Cas1 family  33.68 
 
 
328 aa  155  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.866435  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1587  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.71 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0375026  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0347  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.24 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4348  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.79 
 
 
277 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0486  CRISPR-associated protein Cas1  33.33 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0583925  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0784  CRISPR-associated protein Cas1  31.56 
 
 
294 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0784  CRISPR-associated protein Cas1  32.38 
 
 
294 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00721188  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0949  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.47 
 
 
298 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0628062  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2234  CRISPR-associated protein Cas1  32 
 
 
297 aa  119  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3220  cas1: CRISPR-associated protein Cas1  31.74 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.615148  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0930  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.14 
 
 
296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.264886  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2719  hypothetical protein  34.62 
 
 
130 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2751  hypothetical protein  24.9 
 
 
295 aa  60.1  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00117385  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1401  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.24 
 
 
325 aa  52.8  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612871  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0052  hypothetical protein  24.8 
 
 
322 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.553204  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2837  hypothetical protein  24.8 
 
 
322 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33350  hypothetical protein  23.11 
 
 
324 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.142175 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0734  CRISPR-associated protein Cas1  21.95 
 
 
333 aa  49.3  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1209  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.72 
 
 
337 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1819  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.94 
 
 
325 aa  45.8  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0696  CRISPR-associated protein Cas1  20.56 
 
 
333 aa  45.4  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101778  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0937  CRISPR-associated protein Cas1  22.09 
 
 
326 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3241  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.58 
 
 
325 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3377  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.58 
 
 
325 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000538903 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  24.81 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0489  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.51 
 
 
334 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.121384 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1535  CRISPR-associated protein Cas1  21.6 
 
 
326 aa  43.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1728  hypothetical protein  21.6 
 
 
326 aa  43.1  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00792911  hitchhiker  0.000413169 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1644  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.6 
 
 
326 aa  43.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0746674  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  26.61 
 
 
330 aa  42.7  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3659  CRISPR-associated protein Cas1  20.91 
 
 
326 aa  42.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.208917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>