129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2158 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2158  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 		 594 aa  1227    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1419  CRISPR-associated helicase Cas3  96.1 
 
 		 860 aa  1150    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.144597 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2670  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  54.01 
 
 		 837 aa  596  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0912  CRISPR-associated helicase Cas3  52.6 
 
 		 871 aa  551  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  39.8 
 
 		 854 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0922  CRISPR-associated helicase Cas3  38.3 
 
 		 860 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.226971  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  36.5 
 
 		 899 aa  243  7.999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  35.01 
 
 		 905 aa  237  5.0000000000000005e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17170  CRISPR-associated helicase Cas3, core  36.06 
 
 		 901 aa  236  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.908442  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2438  CRISPR-associated helicase Cas3  35.24 
 
 		 908 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  36.38 
 
 		 885 aa  223  8e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1895  CRISPR-associated helicase Cas3  36.42 
 
 		 944 aa  223  9e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000246489  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2824  CRISPR-associated helicase Cas3  35.93 
 
 		 854 aa  220  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0989  CRISPR-associated helicase Cas3  37.02 
 
 		 922 aa  220  5e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4095  CRISPR-associated helicase Cas3  34.56 
 
 		 887 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2343  CRISPR-associated helicase Cas3  34.04 
 
 		 879 aa  212  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1593  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  34.96 
 
 		 944 aa  206  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0156673  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  33.08 
 
 		 929 aa  203  9e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0651  CRISPR-associated helicase Cas3  34.88 
 
 		 927 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.522649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2889  CRISPR-associated helicase Cas3  33.02 
 
 		 899 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0793506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3063  CRISPR-associated helicase Cas3  33.96 
 
 		 885 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.949207  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3072  crispr-associated helicase Cas3  32.89 
 
 		 887 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  31.9 
 
 		 883 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0224  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  32.06 
 
 		 897 aa  196  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249114  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3138  crispr-associated helicase Cas3  32.52 
 
 		 887 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4014  CRISPR-associated helicase Cas3  33.4 
 
 		 899 aa  195  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.317175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2480  CRISPR-associated helicase Cas3  31.91 
 
 		 906 aa  193  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0175  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  31.98 
 
 		 920 aa  193  9e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2983  CRISPR-associated helicase Cas3  34.92 
 
 		 899 aa  192  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0927  CRISPR-associated helicase Cas3  31.83 
 
 		 888 aa  191  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.732097  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2679  CRISPR-associated helicase Cas3  31.85 
 
 		 965 aa  190  7e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000878559  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3591  CRISPR-associated helicase Cas3  32.1 
 
 		 912 aa  189  8e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.355005  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3314  CRISPR-associated helicase Cas3  33.55 
 
 		 892 aa  189  9e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.036255  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0865  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  33.12 
 
 		 892 aa  189  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2629  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  35.5 
 
 		 971 aa  189  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.174712  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1586  hypothetical protein  34.87 
 
 		 823 aa  189  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271584  normal  0.677902 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  31.45 
 
 		 888 aa  189  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.324 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5415  CRISPR-associated helicase Cas3  33.97 
 
 		 897 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0428  CRISPR-associated helicase Cas3  33.63 
 
 		 897 aa  188  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00752021  normal  0.154756 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1536  CRISPR-associated helicase Cas3  33.05 
 
 		 968 aa  187  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  31.84 
 
 		 948 aa  186  9e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1814  CRISPR-associated helicase Cas3  32.62 
 
 		 701 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2901  hypothetical protein  30.65 
 
 		 888 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3548  CRISPR-associated helicase Cas3  31.04 
 
 		 908 aa  184  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.18776 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0941  CRISPR-associated helicase Cas3  32.27 
 
 		 933 aa  183  9.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156849  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1608  CRISPR-associated helicase Cas3  30.14 
 
 		 912 aa  182  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152444  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0397  CRISPR-associated helicase Cas3  32.26 
 
 		 907 aa  179  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0215688  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1601  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  32.14 
 
 		 970 aa  178  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0436721  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00865  CRISPR-associated helicase Cas3  30.22 
 
 		 915 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.798987  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0593  CRISPR-associated helicase Cas3  30.56 
 
 		 921 aa  177  6e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.834864  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17130  CRISPR-associated helicase Cas3  34.43 
 
 		 919 aa  175  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.390014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  32.18 
 
 		 1540 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0956  putative helicase  31.5 
 
 		 904 aa  171  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.38721  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3055  CRISPR-associated helicase Cas3  31.41 
 
 		 918 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107976  hitchhiker  0.000610459 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17360  CRISPR-associated helicase Cas3  32.57 
 
 		 943 aa  168  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0955  CRISPR-associated helicase Cas3  32.03 
 
 		 871 aa  162  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3214  cas3: CRISPR-associated helicase Cas3  32.89 
 
 		 857 aa  162  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2228  CRISPR-associated helicase Cas3  33.26 
 
 		 876 aa  160  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229037  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0778  CRISPR-associated helicase Cas3  32.09 
 
 		 887 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0017  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  34.73 
 
 		 962 aa  158  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2572  CRISPR-associated helicase Cas3  33.25 
 
 		 986 aa  154  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0936  CRISPR-associated helicase Cas3  31.83 
 
 		 881 aa  153  7e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0340  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  34.01 
 
 		 885 aa  151  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0480  CRISPR-associated helicase Cas3  31.88 
 
 		 868 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227979  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13860  CRISPR-associated helicase Cas3  30.61 
 
 		 832 aa  140  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234704  normal  0.222328 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0778  CRISPR-associated helicase Cas3  29.35 
 
 		 888 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0604  hypothetical protein  33.55 
 
 		 456 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  30.23 
 
 		 737 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  34.69 
 
 		 729 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  28.49 
 
 		 741 aa  117  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2016  CRISPR-associated helicase Cas3  28.37 
 
 		 778 aa  110  8.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  25.94 
 
 		 750 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  27.19 
 
 		 763 aa  104  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  29.01 
 
 		 795 aa  103  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  28.12 
 
 		 750 aa  100  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  28.25 
 
 		 917 aa  98.6  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  28.9 
 
 		 744 aa  96.7  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  27.99 
 
 		 781 aa  95.1  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  27.68 
 
 		 762 aa  94.7  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  27.45 
 
 		 779 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  27.4 
 
 		 736 aa  91.7  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  30.55 
 
 		 804 aa  92  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  25.71 
 
 		 764 aa  88.6  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  26.01 
 
 		 726 aa  88.6  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  26.98 
 
 		 775 aa  88.2  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  24.17 
 
 		 729 aa  87.8  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  27.3 
 
 		 783 aa  83.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  29.55 
 
 		 1027 aa  82  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  29.09 
 
 		 801 aa  76.6  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1354  CRISPR-associated helicase Cas3  27.07 
 
 		 566 aa  73.2  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.245938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  32.3 
 
 		 811 aa  72  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5524  CRISPR-associated helicase Cas3  25.48 
 
 		 827 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.262681 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  24.49 
 
 		 741 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3341  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.59 
 
 		 751 aa  62.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127091  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3123  hypothetical protein  25.78 
 
 		 843 aa  58.9  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.44073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0267  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.42 
 
 		 821 aa  57.8  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1525  CRISPR-associated helicase Cas3  20.21 
 
 		 582 aa  57  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2872  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  28 
 
 		 1209 aa  57  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286079  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  26.94 
 
 		 799 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0233  CRISPR-associated helicase Cas3  20.8 
 
 		 765 aa  54.7  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>