More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2108 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2108  Ion transport 2 domain protein  100 
 
 
380 aa  785    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.64507  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0534  extracellular solute-binding protein  54.05 
 
 
378 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000119937  normal  0.231064 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0243  extracellular solute-binding protein  51.65 
 
 
352 aa  319  5e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.461233  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4470  extracellular solute-binding protein  32.39 
 
 
360 aa  203  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0989  ionotropic glutamate receptor  31.39 
 
 
385 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00799659  normal  0.390721 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17521  GIC family ligand gated channel  32.04 
 
 
333 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0766  ionotropic glutamate receptor  28.87 
 
 
357 aa  158  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1231  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 
366 aa  156  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.196544  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4230  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 
396 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.062377 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3401  extracellular solute-binding protein family 3  34.36 
 
 
345 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288087 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2998  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 
354 aa  151  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.593817  normal  0.519466 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06570  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  27.43 
 
 
363 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3185  extracellular solute-binding protein family 3  29.27 
 
 
386 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0319469  normal  0.327167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5634  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 
376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3087  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 
360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4522  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 
375 aa  123  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2561  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 
367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1963  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 
382 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.503489  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2141  extracellular solute-binding protein  46.67 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0343212 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  41.86 
 
 
246 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1918  extracellular solute-binding protein family 3  38.55 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  35.45 
 
 
247 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.45 
 
 
493 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  32.5 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  41.1 
 
 
247 aa  67  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0906  extracellular solute-binding protein  36.78 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.663665  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0520  amino acid  32.23 
 
 
270 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  35.11 
 
 
517 aa  65.5  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2855  extracellular solute-binding protein  36.9 
 
 
249 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0813  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  30.58 
 
 
271 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.000000000481343  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1189  extracellular solute-binding protein family 3  28.78 
 
 
252 aa  63.9  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0178  extracellular solute-binding protein  36.67 
 
 
299 aa  63.9  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1863  extracellular solute-binding protein  37.96 
 
 
292 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4567  cyclic nucleotide-binding protein  36.17 
 
 
385 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1806  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  36.25 
 
 
468 aa  62  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000163155  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2011  extracellular solute-binding protein  31.16 
 
 
282 aa  60.8  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.986691  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1169  hypothetical protein  39.33 
 
 
251 aa  60.8  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.242801  normal  0.430394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1590  extracellular solute-binding protein family 3  29.06 
 
 
282 aa  60.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000563013  normal  0.528565 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.73 
 
 
248 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.73 
 
 
248 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.73 
 
 
248 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.73 
 
 
248 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.73 
 
 
248 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4024  extracellular solute-binding protein  33 
 
 
270 aa  60.1  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400278  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1594  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 
233 aa  60.1  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.50159  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.23 
 
 
513 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  28.68 
 
 
263 aa  59.7  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.17 
 
 
408 aa  59.7  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.77 
 
 
253 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.73 
 
 
248 aa  58.9  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1259  extracellular solute-binding protein  36.51 
 
 
295 aa  58.9  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0438  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  28.81 
 
 
480 aa  59.3  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.126368  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.73 
 
 
248 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.73 
 
 
248 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.73 
 
 
248 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.73 
 
 
248 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  29.91 
 
 
244 aa  58.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.73 
 
 
248 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2452  extracellular solute-binding protein family 3  32.46 
 
 
259 aa  58.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.73 
 
 
248 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  35.11 
 
 
412 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  32.73 
 
 
248 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.73 
 
 
248 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0098  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.74 
 
 
487 aa  58.5  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000321849  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 
264 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  35.11 
 
 
419 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2184  extracellular solute-binding protein  32.18 
 
 
295 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092646 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  31.13 
 
 
247 aa  57  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  32.1 
 
 
501 aa  57  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0734  hypothetical protein  29.73 
 
 
250 aa  57  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1803  extracellular solute-binding protein  32.18 
 
 
288 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.363702  normal  0.037594 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  35.29 
 
 
409 aa  56.6  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  37.78 
 
 
270 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0357  extracellular solute-binding protein  31.5 
 
 
270 aa  56.2  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15430  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  28.23 
 
 
297 aa  56.2  0.0000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0169266  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30 
 
 
250 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30 
 
 
250 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.11 
 
 
247 aa  56.2  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  35.56 
 
 
228 aa  55.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2488  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.29 
 
 
248 aa  55.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3699  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.25 
 
 
248 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0756284  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.87 
 
 
248 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.96 
 
 
247 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.87 
 
 
248 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.52 
 
 
250 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1245  amino acid  35.87 
 
 
268 aa  55.8  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.3 
 
 
250 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3441  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.52 
 
 
250 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.84 
 
 
267 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.96 
 
 
247 aa  55.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.52 
 
 
250 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1767  extracellular solute-binding protein  30.88 
 
 
276 aa  55.8  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.99488  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.87 
 
 
248 aa  56.2  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1923  amino acid ABC transporter permease/periplasmic protein  29.91 
 
 
714 aa  55.8  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.132292  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.52 
 
 
250 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 
264 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  43.37 
 
 
276 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  44.05 
 
 
274 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30 
 
 
250 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30 
 
 
250 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>