36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2098 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2098  protein of unknown function DUF975  100 
 
 
225 aa  450  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.274945  normal  0.188406 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1900  hypothetical protein  64.22 
 
 
226 aa  272  3e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.873498  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2146  hypothetical protein  56.34 
 
 
218 aa  255  4e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00523759  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2073  hypothetical protein  56.34 
 
 
218 aa  250  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000612499  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1792  hypothetical protein  46.45 
 
 
266 aa  209  3e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0383  hypothetical protein  41.82 
 
 
228 aa  170  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1503  protein of unknown function DUF975  34.92 
 
 
259 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.817403  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2424  hypothetical protein  31.58 
 
 
267 aa  101  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.129436 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3315  hypothetical protein  29.96 
 
 
252 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.607217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4886  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.758345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56090  hypothetical protein  32.05 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124501  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1249  hypothetical protein  30.43 
 
 
195 aa  68.6  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000710568  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2431  hypothetical protein  36.36 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.297955  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4020  hypothetical protein  27.86 
 
 
335 aa  65.5  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2044  integral membrane protein-like protein  28.32 
 
 
335 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00652767  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0167  putative transmembrane protein  26.45 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4223  hypothetical protein  24.4 
 
 
317 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4148  hypothetical protein  24.4 
 
 
317 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220941  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4379  hypothetical protein  24.4 
 
 
229 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.050134  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1040  hypothetical protein  21.74 
 
 
281 aa  55.5  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000182734  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0384  hypothetical protein  23.39 
 
 
236 aa  52.4  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4673  hypothetical protein  26.95 
 
 
323 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.265128 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2060  hypothetical protein  25 
 
 
247 aa  48.9  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1763  integral membrane protein  22.94 
 
 
200 aa  47.4  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00234926  normal  0.0438415 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003480  hypothetical protein  22.97 
 
 
265 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000514785  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0650  hypothetical protein  24.1 
 
 
218 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0597316  normal  0.331692 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02070  stress-induced protein UspE  25 
 
 
239 aa  45.8  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2197  hypothetical protein  37.39 
 
 
313 aa  45.4  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481284  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02290  hypothetical protein  21.62 
 
 
265 aa  45.1  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2212  hypothetical protein  27.86 
 
 
311 aa  45.1  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32045  normal  0.0285303 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0978  hypothetical protein  28.48 
 
 
217 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0962  integral membrane protein-like protein  23.77 
 
 
250 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.765265  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3402  hypothetical protein  34.43 
 
 
217 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.572475  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1407  hypothetical protein  21.88 
 
 
258 aa  43.5  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3440  hypothetical protein  28.06 
 
 
190 aa  42.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.744208  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3258  hypothetical protein  26.43 
 
 
295 aa  42.4  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>