16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2097 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2097  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  661    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.206724 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1899  hypothetical protein  58.84 
 
 
294 aa  346  3e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.201368  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1581  hypothetical protein  39.01 
 
 
274 aa  188  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.518967  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1734  hypothetical protein  37.55 
 
 
273 aa  176  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0825048  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0059  hypothetical protein  33.09 
 
 
268 aa  132  6e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1695  hypothetical protein  29.36 
 
 
246 aa  106  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1876  hypothetical protein  31.09 
 
 
245 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.136655  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1084  hypothetical protein  30.88 
 
 
245 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238107  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0434  hypothetical protein  25.84 
 
 
261 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0850  hypothetical protein  27.09 
 
 
246 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00832469  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1428  hypothetical protein  27.47 
 
 
264 aa  87.4  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1491  hypothetical protein  26.5 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1586  hypothetical protein  28.02 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0196619  normal  0.892505 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1927  hypothetical protein  28.91 
 
 
262 aa  62.4  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000210068  hitchhiker  0.00302398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2010  hypothetical protein  25.77 
 
 
223 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2380  hypothetical protein  25.12 
 
 
230 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00980429  normal  0.518017 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>