More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2089 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  100 
 
 
460 aa  910    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2058  magnesium transporter  81.52 
 
 
460 aa  740    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2441  magnesium transporter  79.13 
 
 
460 aa  735    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0320  divalent cation transporter  80.22 
 
 
460 aa  756    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0139413 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1801  divalent cation transporter  77.83 
 
 
460 aa  731    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1890  magnesium transporter  92.83 
 
 
460 aa  831    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2099  magnesium transporter  82.83 
 
 
460 aa  755    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.168721  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  58.23 
 
 
463 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0914  magnesium transporter  55.97 
 
 
460 aa  501  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2002  magnesium transporter  56.7 
 
 
458 aa  482  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.493999  normal  0.0929187 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1318  magnesium transporter  50.88 
 
 
458 aa  458  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6729  magnesium transporter  44.52 
 
 
463 aa  421  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143213  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3303  magnesium transporter  44.28 
 
 
461 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0876  magnesium transporter  45.05 
 
 
465 aa  375  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0822  magnesium transporter  45.05 
 
 
465 aa  375  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3944  magnesium transporter  48.04 
 
 
441 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4087  magnesium transporter  48.04 
 
 
441 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4616  magnesium transporter  45.5 
 
 
456 aa  371  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  decreased coverage  0.00267397 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4054  magnesium transporter  48.04 
 
 
441 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3524  magnesium transporter  44.47 
 
 
454 aa  369  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5457  magnesium transporter  45.71 
 
 
456 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.169675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4800  magnesium transporter  45.5 
 
 
456 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.832783  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0891  magnesium transporter  42.11 
 
 
449 aa  368  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182098 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0331  magnesium transporter  43.79 
 
 
458 aa  363  4e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2728  divalent cation transporter  44.42 
 
 
456 aa  362  1e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4147  magnesium transporter  43.49 
 
 
454 aa  360  4e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.235845 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02891  magnesium transporter  43.26 
 
 
455 aa  360  4e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  40.93 
 
 
454 aa  359  6e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3903  magnesium transporter  45.72 
 
 
456 aa  351  1e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508399  normal  0.721995 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1342  divalent cation transporter  40.8 
 
 
447 aa  350  4e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.09733  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  40.75 
 
 
449 aa  350  4e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0080  magnesium transporter  48.37 
 
 
438 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0946  magnesium transporter  43.07 
 
 
457 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1095  magnesium transporter  41.82 
 
 
457 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.20606  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  40.85 
 
 
468 aa  334  2e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1082  divalent cation transporter  40.18 
 
 
447 aa  327  2.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1398  magnesium transport protein  43.52 
 
 
458 aa  327  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  41.13 
 
 
465 aa  325  1e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  39.37 
 
 
463 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  38.17 
 
 
446 aa  322  6e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0419  magnesium transporter  37.92 
 
 
455 aa  322  9.999999999999999e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  36.36 
 
 
452 aa  311  2e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  38.17 
 
 
446 aa  310  4e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  37.95 
 
 
466 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  38.48 
 
 
462 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  38.26 
 
 
462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2001  magnesium transporter  37.06 
 
 
447 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2363  magnesium transporter  36.54 
 
 
454 aa  300  5e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  37.94 
 
 
469 aa  300  5e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  37.28 
 
 
469 aa  299  7e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2000  magnesium transporter  39.51 
 
 
454 aa  298  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01460  Mg2+ transporter MgtE  36.08 
 
 
452 aa  297  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  34.09 
 
 
443 aa  295  1e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  33.78 
 
 
444 aa  293  3e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  35.48 
 
 
449 aa  293  5e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1454  magnesium transporter  35.35 
 
 
447 aa  290  4e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192338  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0092  magnesium transporter  38.39 
 
 
486 aa  287  2e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  35.98 
 
 
469 aa  287  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  36.3 
 
 
468 aa  285  9e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0138  divalent cation transporter  38.5 
 
 
486 aa  284  3.0000000000000004e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  35.76 
 
 
468 aa  283  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1523  magnesium transporter  37.5 
 
 
447 aa  282  1e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  35.62 
 
 
468 aa  282  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1159  magnesium transporter  36.74 
 
 
450 aa  281  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0382  magnesium transporter  31.01 
 
 
454 aa  280  4e-74  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  33.33 
 
 
456 aa  279  7e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  36.19 
 
 
450 aa  279  9e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1785  divalent cation transporter  37.24 
 
 
447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1691  magnesium transporter  32.44 
 
 
452 aa  272  8.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0276763 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1690  magnesium transporter  36.24 
 
 
452 aa  272  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0394876 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  33.33 
 
 
449 aa  271  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  34.62 
 
 
442 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0971  magnesium transporter  33.63 
 
 
457 aa  268  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01631  Mg2+ transporter  38.17 
 
 
473 aa  268  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  32.69 
 
 
458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1471  magnesium transporter  35.49 
 
 
449 aa  264  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2199  divalent cation transporter  32.84 
 
 
465 aa  263  6e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  34.49 
 
 
463 aa  261  2e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1145  magnesium transporter  33.56 
 
 
457 aa  260  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17571  Mg2+ transporter  37.69 
 
 
471 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.161452  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3300  magnesium transporter  32.16 
 
 
457 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2520  magnesium transporter  33.33 
 
 
454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  32.66 
 
 
450 aa  253  7e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4176  magnesium transporter  35.44 
 
 
452 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.987951  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  32.08 
 
 
451 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  35.01 
 
 
461 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  35.01 
 
 
461 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2496  magnesium transporter  32.37 
 
 
442 aa  251  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  31.93 
 
 
445 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  31.86 
 
 
451 aa  249  5e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1703  magnesium transporter  32.81 
 
 
445 aa  249  6e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25770  Mg2+ transporter MgtE  33.63 
 
 
462 aa  248  1e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6844  magnesium transporter  34.21 
 
 
454 aa  249  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1056  magnesium transporter  32.38 
 
 
457 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0801577  hitchhiker  0.0000813528 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3521  magnesium transporter  32.38 
 
 
457 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  31.93 
 
 
445 aa  246  4e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2935  magnesium transporter  31.94 
 
 
457 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3396  magnesium transporter  31.94 
 
 
457 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5582  magnesium transporter  33.56 
 
 
444 aa  245  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1907  magnesium transporter  32.39 
 
 
445 aa  243  3.9999999999999997e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>