More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2074 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2074  isochorismate synthase  100 
 
 		 471 aa  977    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.49442  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1877  isochorismate synthase  58.32 
 
 		 475 aa  568  1e-161  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2422  isochorismate synthase  54.11 
 
 		 468 aa  513  1e-144  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2047  isochorismate synthase  53.71 
 
 		 473 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.489046  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0332  isochorismate synthase  52.15 
 
 		 473 aa  484  1e-135  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0246955  normal  0.0588972 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2088  isochorismate synthases  53.06 
 
 		 477 aa  475  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000640643  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1701  isochorismate synthase  46.49 
 
 		 482 aa  420  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  36.08 
 
 		 466 aa  275  9e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2897  isochorismate synthases  34.13 
 
 		 473 aa  259  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0157993  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0130  isochorismate synthase  33.66 
 
 		 414 aa  231  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000366524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0130  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  33.92 
 
 		 452 aa  230  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4071  isochorismate synthases  32.78 
 
 		 452 aa  229  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.381607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3868  isochorismate synthases  33.81 
 
 		 452 aa  229  7e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172754  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4713  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  32.04 
 
 		 452 aa  225  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3913  isochorismate synthases  33.33 
 
 		 460 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.348383  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0093  isochorismate synthase  31.25 
 
 		 452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3961  isochorismate synthases  33.1 
 
 		 452 aa  221  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.338247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  33.25 
 
 		 452 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4256  isochorismate synthase  33.25 
 
 		 452 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0088  isochorismate synthase  33.02 
 
 		 452 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3677  isochorismate synthase  31.84 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4089  isochorismate synthase  31.39 
 
 		 452 aa  217  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4451  isochorismate synthase  32.78 
 
 		 452 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  30.66 
 
 		 460 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0355  isochorismate synthases  34.2 
 
 		 432 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.065089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  33.86 
 
 		 486 aa  209  8e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  32.43 
 
 		 455 aa  208  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3873  isochorismate synthase  32.47 
 
 		 452 aa  208  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.971486  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  33.16 
 
 		 445 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1098  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.86 
 
 		 440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.994822  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  29.98 
 
 		 461 aa  194  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004033  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.32 
 
 		 435 aa  193  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  33.41 
 
 		 451 aa  190  5e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2562  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.36 
 
 		 431 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.436798  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  31.4 
 
 		 451 aa  189  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3204  isochorismate synthase  31.16 
 
 		 442 aa  188  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2644  isochorismate synthase, menaquinone-specific  31.14 
 
 		 431 aa  186  6e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.181423  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  32.77 
 
 		 452 aa  186  9e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02192  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.8 
 
 		 431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472694  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1392  isochorismate synthase  30.8 
 
 		 431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.310179  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1383  isochorismate synthase  30.8 
 
 		 431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02151  hypothetical protein  30.8 
 
 		 431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.392622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2411  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.8 
 
 		 431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.711166  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1126  isochorismate synthases  29.18 
 
 		 471 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3407  isochorismate synthase, menaquinone-specific  30.91 
 
 		 431 aa  184  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.26 
 
 		 464 aa  182  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.42 
 
 		 464 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01428  isochorismate synthase  30.07 
 
 		 435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.09 
 
 		 464 aa  181  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.11 
 
 		 464 aa  180  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1110  isochorismate synthase  30.7 
 
 		 442 aa  180  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0109338  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1562  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.25 
 
 		 435 aa  181  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2420  isochorismate synthase, menaquinone-specific  30.45 
 
 		 431 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.37861  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.11 
 
 		 464 aa  179  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.89 
 
 		 464 aa  179  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.11 
 
 		 464 aa  179  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.89 
 
 		 464 aa  179  9e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.88 
 
 		 464 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3015  isochorismate synthase  31.96 
 
 		 441 aa  178  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  29.96 
 
 		 469 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  32.21 
 
 		 554 aa  177  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.89 
 
 		 464 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1044  isochorismate synthase  32.68 
 
 		 440 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0230464  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1481  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.7 
 
 		 455 aa  173  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1786  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.7 
 
 		 455 aa  172  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  28.95 
 
 		 464 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1588  isochorismate synthase  29.7 
 
 		 455 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2538  menaquinone-specific isochorismate synthase  28.95 
 
 		 431 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2654  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.48 
 
 		 431 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.253728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  30.49 
 
 		 492 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2815  isochorismate synthase  29.37 
 
 		 431 aa  169  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2550  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.25 
 
 		 431 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.920817  normal  0.811222 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2495  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.25 
 
 		 431 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2446  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.25 
 
 		 431 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.22501  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  30.49 
 
 		 492 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  31.44 
 
 		 453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  31.44 
 
 		 453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  29.41 
 
 		 481 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0618  isochorismate synthase  30.1 
 
 		 427 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.734802  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3284  isochorismate synthase  28.78 
 
 		 432 aa  162  9e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  31.51 
 
 		 467 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2632  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.06 
 
 		 471 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1545  isochorismate synthase  31.46 
 
 		 466 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02521  isochorismate synthase  31.69 
 
 		 466 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  31 
 
 		 473 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  30.02 
 
 		 485 aa  155  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  29.05 
 
 		 482 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  26.96 
 
 		 476 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  27.74 
 
 		 476 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  38.1 
 
 		 498 aa  153  5e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  29.8 
 
 		 456 aa  153  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  30.97 
 
 		 495 aa  153  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  29.93 
 
 		 471 aa  152  8.999999999999999e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  28.49 
 
 		 476 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  28.49 
 
 		 476 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  27.15 
 
 		 477 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  30.23 
 
 		 481 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2120  isochorismate synthase  32.07 
 
 		 475 aa  150  4e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  32.73 
 
 		 398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.81 
 
 		 492 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>