More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2068 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2042  citrate synthase I  79.02 
 
 		 447 aa  751    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2068  citrate synthase I  100 
 
 		 450 aa  935    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.355535  normal  0.380729 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0336  citrate synthase I  80.13 
 
 		 447 aa  757    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000388875  normal  0.187011 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0317  citrate synthase I  77.68 
 
 		 447 aa  731    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1088  citrate synthase I  70.56 
 
 		 443 aa  664    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7227  citrate synthase I  71.06 
 
 		 455 aa  637    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2083  citrate synthase  79.24 
 
 		 447 aa  751    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.48822  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2417  citrate synthase I  79.64 
 
 		 447 aa  746    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1870  citrate synthase I  86.64 
 
 		 448 aa  806    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.859731 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0083  citrate synthase  69.41 
 
 		 455 aa  633  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0888  citrate synthase  67.83 
 
 		 447 aa  625  1e-178  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.631219  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2617  citrate synthase I  66.74 
 
 		 436 aa  620  1e-176  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.819839 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3738  citrate synthase I  66.9 
 
 		 428 aa  600  1e-170  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.680995  normal  0.033422 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2007  citrate synthase I  65.88 
 
 		 427 aa  598  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1676  citrate synthase  65.41 
 
 		 445 aa  599  1e-170  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308594  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3488  citrate synthase I  65.73 
 
 		 428 aa  591  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0581  citrate synthase I  65.96 
 
 		 428 aa  581  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1835  citrate synthase I  61.97 
 
 		 422 aa  542  1e-153  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  54.15 
 
 		 434 aa  487  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6352  type II citrate synthase  54.52 
 
 		 433 aa  478  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0645718  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  52.56 
 
 		 431 aa  478  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2481  type II citrate synthase  53.65 
 
 		 433 aa  481  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523496  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  54.76 
 
 		 427 aa  478  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2752  citrate synthase  55.81 
 
 		 432 aa  480  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.816634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2320  type II citrate synthase  53.65 
 
 		 433 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  53.65 
 
 		 434 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  54.29 
 
 		 434 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  53.35 
 
 		 434 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  52.66 
 
 		 434 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  54.46 
 
 		 429 aa  472  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  52.63 
 
 		 428 aa  472  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000689188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  54.18 
 
 		 429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2251  citrate synthase I  52.31 
 
 		 434 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  52.05 
 
 		 434 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  52.17 
 
 		 433 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1395  citrate synthase  51.26 
 
 		 434 aa  469  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322092  normal  0.0167868 
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  53.57 
 
 		 430 aa  465  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  51.61 
 
 		 433 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  52.87 
 
 		 435 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  53.57 
 
 		 430 aa  465  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  53.97 
 
 		 430 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  53.22 
 
 		 429 aa  462  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  51.6 
 
 		 433 aa  463  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  52.67 
 
 		 428 aa  464  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  51.83 
 
 		 433 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  51.03 
 
 		 439 aa  463  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  53.83 
 
 		 436 aa  462  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  51.6 
 
 		 433 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  53.38 
 
 		 429 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  52.86 
 
 		 438 aa  461  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  54.23 
 
 		 430 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  53.38 
 
 		 446 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  51.37 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  51.37 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  58.06 
 
 		 427 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2860  citrate synthase  54.09 
 
 		 432 aa  459  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2787  citrate synthase I  51.26 
 
 		 426 aa  461  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.420339  normal  0.059507 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  51.37 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  51.37 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  51.37 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  51.37 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  51.6 
 
 		 433 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  52.73 
 
 		 432 aa  461  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  52.98 
 
 		 429 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  53.38 
 
 		 429 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  51.37 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  55.24 
 
 		 429 aa  459  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  51.37 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3316  type II citrate synthase  51.37 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  52.74 
 
 		 429 aa  459  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  51.37 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418606 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0897  citrate synthase  52.9 
 
 		 433 aa  461  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0898483  normal  0.676877 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  52.76 
 
 		 429 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  55.75 
 
 		 427 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3589  type II citrate synthase  51.14 
 
 		 433 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  52.51 
 
 		 429 aa  455  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2147  type II citrate synthase  51.14 
 
 		 433 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787035  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  51.61 
 
 		 433 aa  455  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5525  type II citrate synthase  50.92 
 
 		 432 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615237  normal  0.487627 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1134  type II citrate synthase  50.69 
 
 		 432 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  55.13 
 
 		 442 aa  455  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33600  citrate synthase  56.6 
 
 		 437 aa  456  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2545  citrate synthase I  52.35 
 
 		 431 aa  457  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4428  type II citrate synthase  51.14 
 
 		 433 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1630  type II citrate synthase  52.63 
 
 		 428 aa  455  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.01465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1705  type II citrate synthase  52.63 
 
 		 428 aa  455  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00232802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3939  type II citrate synthase  51.14 
 
 		 433 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0841  type II citrate synthase  51.56 
 
 		 429 aa  455  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  55.24 
 
 		 427 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1926  type II citrate synthase  52.4 
 
 		 428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1370  citrate synthase  52.67 
 
 		 423 aa  451  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1366  citrate synthase  52.67 
 
 		 423 aa  451  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1187  citrate synthase  51.73 
 
 		 431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0599  type II citrate synthase  51.39 
 
 		 430 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.281651  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1678  type II citrate synthase  50.45 
 
 		 431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0407476  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2165  type II citrate synthase  51.47 
 
 		 437 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.962895  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3091  citrate synthase I  53 
 
 		 428 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.31999 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1705  type II citrate synthase  52.4 
 
 		 428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.668035 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2274  type II citrate synthase  56.67 
 
 		 428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000358341  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2257  citrate synthase I  55.06 
 
 		 431 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19804  normal  0.414999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>