More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2023 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 187 aa  378  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  71.34 
 
 		 174 aa  242  1.9999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0341047  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  45.39 
 
 		 581 aa  124  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  44.44 
 
 		 334 aa  121  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  41.91 
 
 		 462 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  43.15 
 
 		 233 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2847  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  39.58 
 
 		 306 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  37.74 
 
 		 706 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  40.15 
 
 		 539 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  42.64 
 
 		 706 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  40.58 
 
 		 582 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.35 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  37.66 
 
 		 649 aa  106  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  39.37 
 
 		 306 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1228  TPR repeat-containing protein  41.48 
 
 		 297 aa  101  8e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  40.62 
 
 		 820 aa  100  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.06 
 
 		 746 aa  100  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  35.98 
 
 		 446 aa  99.4  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20381  hypothetical protein  42.24 
 
 		 164 aa  99.4  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136589 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 		 331 aa  97.8  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  36.57 
 
 		 392 aa  97.8  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0096  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 		 191 aa  97.4  9e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00110052  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  42.74 
 
 		 605 aa  97.1  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 		 371 aa  97.4  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.31 
 
 		 542 aa  96.3  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 		 308 aa  96.3  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.69 
 
 		 237 aa  95.5  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.75 
 
 		 308 aa  95.1  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.6 
 
 		 406 aa  94.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.6 
 
 		 406 aa  94.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.64 
 
 		 357 aa  94.4  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  38.4 
 
 		 1421 aa  94.4  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  33.54 
 
 		 361 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  37.29 
 
 		 260 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  33.91 
 
 		 243 aa  94  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.29 
 
 		 261 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0092  TPR repeat-containing protein  38.69 
 
 		 186 aa  93.6  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.51 
 
 		 1022 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.53 
 
 		 249 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  35.81 
 
 		 271 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.53 
 
 		 249 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1162  TPR repeat-containing protein  36.11 
 
 		 205 aa  92.4  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  39.68 
 
 		 428 aa  92.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  34.56 
 
 		 404 aa  91.7  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 		 306 aa  91.7  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00751  hypothetical protein  38.24 
 
 		 205 aa  91.7  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.499954 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22531  TPR repeat-containing protein  36.55 
 
 		 202 aa  91.3  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0055  TPR repeat-containing protein  34.42 
 
 		 166 aa  91.3  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.71 
 
 		 988 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 		 1276 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1997  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 248 aa  89.7  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1828  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.86 
 
 		 175 aa  89.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  32.33 
 
 		 279 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1105  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 732 aa  89.4  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32 
 
 		 1056 aa  89  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  37.7 
 
 		 1827 aa  89  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3135  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 731 aa  89.4  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0088  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.18 
 
 		 185 aa  89  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 556 aa  88.6  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2669  TPR repeat-containing protein  31.72 
 
 		 189 aa  88.6  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00543716  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  32.72 
 
 		 301 aa  88.2  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.79 
 
 		 818 aa  87.8  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 		 301 aa  87  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.16 
 
 		 289 aa  87  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 471 aa  87  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0131  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  36.5 
 
 		 280 aa  86.7  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 289 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  37.01 
 
 		 391 aa  87  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 458 aa  86.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.34 
 
 		 784 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 		 450 aa  85.5  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 349 aa  85.5  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.75 
 
 		 373 aa  85.5  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 		 284 aa  85.9  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  41.9 
 
 		 1056 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  37.07 
 
 		 515 aa  84.7  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  37.59 
 
 		 269 aa  84.7  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  40 
 
 		 442 aa  84.7  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  33.1 
 
 		 547 aa  84  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.18 
 
 		 778 aa  84  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  38.84 
 
 		 750 aa  83.2  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2723  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26129  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  36.09 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0934  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.64 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  35.09 
 
 		 385 aa  82.4  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.8 
 
 		 810 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  35.61 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  35.04 
 
 		 1240 aa  82.4  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0543  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.83 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  36.92 
 
 		 3560 aa  82.4  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  35.82 
 
 		 617 aa  81.6  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  34.4 
 
 		 295 aa  81.6  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 687 aa  82  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  34.4 
 
 		 295 aa  82  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1972  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  39.66 
 
 		 376 aa  81.6  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>