More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2015 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 150 aa  308  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  84.56 
 
 		 149 aa  270  5.000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  81.21 
 
 		 149 aa  269  9e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  78.52 
 
 		 149 aa  262  8.999999999999999e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  77.18 
 
 		 149 aa  255  1e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1650  50S ribosomal protein L13  75.84 
 
 		 151 aa  255  2e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  75.17 
 
 		 149 aa  253  7e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  60.42 
 
 		 147 aa  196  7e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  65.69 
 
 		 144 aa  196  7.999999999999999e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  65.44 
 
 		 148 aa  196  7.999999999999999e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  65.71 
 
 		 142 aa  196  9e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  65.71 
 
 		 142 aa  196  9e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  63.64 
 
 		 145 aa  195  1.0000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  65.03 
 
 		 147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  66.2 
 
 		 145 aa  191  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  58.33 
 
 		 147 aa  192  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  61.11 
 
 		 147 aa  192  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  61.11 
 
 		 147 aa  192  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  60 
 
 		 148 aa  191  3e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  58.33 
 
 		 147 aa  191  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  59.03 
 
 		 149 aa  191  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  64.79 
 
 		 142 aa  189  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 144 aa  187  5e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  61.31 
 
 		 142 aa  186  5.999999999999999e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 147 aa  186  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  65.19 
 
 		 145 aa  186  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  68.15 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  61.48 
 
 		 144 aa  185  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  62.04 
 
 		 148 aa  185  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  64.44 
 
 		 143 aa  184  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1395  ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 146 aa  184  5e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000119663  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 144 aa  183  7e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  63.7 
 
 		 145 aa  183  7e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  183  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  60.74 
 
 		 150 aa  182  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  58.65 
 
 		 150 aa  182  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  65.44 
 
 		 149 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  65.44 
 
 		 149 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  56.25 
 
 		 149 aa  181  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  59.44 
 
 		 146 aa  181  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  56.25 
 
 		 147 aa  181  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  60.58 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 147 aa  181  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  60.71 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 154 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4950  50S ribosomal protein L13  58.33 
 
 		 147 aa  180  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.264788  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  61.31 
 
 		 142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  180  6e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  180  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  180  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  55.56 
 
 		 147 aa  180  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  179  8.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 147 aa  179  8.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  59.56 
 
 		 170 aa  179  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  179  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1451  50S ribosomal protein L13  62.96 
 
 		 147 aa  179  9.000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158182  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  59.85 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  59.85 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  59.85 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  60.58 
 
 		 143 aa  179  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 150 aa  178  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  53.47 
 
 		 147 aa  178  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 144 aa  178  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 150 aa  178  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  58.27 
 
 		 143 aa  177  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1469  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 147 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1176  ribosomal protein L13  53.47 
 
 		 147 aa  177  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.874786 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  56.94 
 
 		 145 aa  177  4e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  57.66 
 
 		 146 aa  177  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17241  50S ribosomal protein L13  59.85 
 
 		 143 aa  177  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  59.85 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 144 aa  177  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1625  50S ribosomal protein L13  60.58 
 
 		 143 aa  177  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.971698  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  59.12 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1981  50S ribosomal protein L13  57.89 
 
 		 150 aa  177  5.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0574002  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  177  5.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  59.12 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 144 aa  176  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  54.86 
 
 		 147 aa  176  8e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  176  8e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  59.12 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  59.56 
 
 		 151 aa  176  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2070  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000721803  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17401  50S ribosomal protein L13  59.12 
 
 		 143 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  59.12 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>