122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1944 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1944  Excinuclease ABC C subunit domain protein  100 
 
 		 84 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.752306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0062  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.87 
 
 		 78 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.330089  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0210  hypothetical protein  39.47 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101895  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0107  hypothetical protein  40.51 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.629422 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1103  excinuclease ABC subunit C  45 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0254  excinuclease ABC subunit C  42.65 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1697  GIY-YIG domain-containing protein  43.28 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00497401  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0402  excinuclease ABC subunit C  39.74 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  43.28 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03940  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.12 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1593  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.68 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.758459 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1867  Excinuclease ABC C subunit domain protein  43.28 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000216284  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1816  excinuclease ABC, C subunit-like protein  41.03 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.406649 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1935  excinuclease ABC subunit C  39.24 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.517176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1139  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.97 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2985  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.85 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00056528  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1603  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.79 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000181458  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  43.94 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2914  excinuclease ABC subunit C  41.03 
 
 		 101 aa  50.4  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00677745  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0003  excinuclease ABC subunit C  41.54 
 
 		 95 aa  50.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2919  endonuclease  41.79 
 
 		 106 aa  50.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1328  excinuclease ABC subunit C  46.15 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0771  excinuclease ABC subunit C  42.42 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959878 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0133  excinuclease ABC subunit C  40.58 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1362  excinuclease ABC subunit C  45.45 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1073  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.81 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081744 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1984  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.29 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569269  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0778  hypothetical protein  43.08 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.68184  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2257  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.45 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1901  excinuclease ABC subunit C  39.39 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.873761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3467  excinuclease ABC subunit C  39.39 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.506637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4217  excinuclease ABC subunit C  37.68 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0141  excinuclease ABC subunit C  39.13 
 
 		 92 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4146  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.39 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.824379  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1952  Excinuclease ABC C subunit domain protein  43.94 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3661  excinuclease ABC subunit C  38.89 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.902012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0101  excinuclease ABC subunit C  41.18 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.873181  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0136  excinuclease ABC subunit C  36.23 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.228252 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4267  excinuclease ABC subunit C  40.91 
 
 		 180 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0916  excinuclease ABC subunit C  46.38 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0140  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.71 
 
 		 166 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4364  putative excinuclease ABC protein, C subunit  42.65 
 
 		 69 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0179482 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1731  Excinuclease ABC C subunit domain protein  31.46 
 
 		 91 aa  47.4  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.26715  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0145  endonuclease  36.23 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0126  hypothetical protein  37.31 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3101  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  40.79 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4401  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  42.86 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1053  excinuclease ABC, C subunit  38.46 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.175656  normal  0.959304 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0448  excinuclease ABC subunit C  43.86 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0115  excinuclease ABC subunit C  36.76 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1525  endonuclease  41.54 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2524  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1158  excinuclease ABC subunit C  32.5 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0285  excinuclease ABC subunit C  37.88 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722146  normal  0.992997 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3151  excinuclease ABC subunit C  36.59 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0891506  normal  0.0226516 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1038  hypothetical protein  42.42 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258363  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1409  excinuclease ABC subunit C  36.36 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0131  excinuclease ABC subunit C  36.76 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2291  excinuclease ABC subunit C  36.92 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.361879  normal  0.317834 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3752  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.88 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2170  excinuclease ABC subunit C  37.31 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.013295  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4370  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2084  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.31 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000359134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0038  excinuclease ABC subunit C  36.76 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0136  excinuclease ABC subunit C  35.29 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3553  GIY-YIG nuclease superfamily protein  34.85 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.158193 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2636  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.75 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.303825  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0136  excinuclease ABC subunit C  36.23 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0137  excinuclease ABC subunit C  35.29 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0489368 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0509  excinuclease ABC subunit C  35.82 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.107949  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0522  excinuclease ABC subunit C  35.82 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.199527  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4335  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.39 
 
 		 95 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0231895  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3055  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.3 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1435  excinuclease ABC subunit C  40.91 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14150  GIY-YIG nuclease superfamily protein  37.31 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.121781  normal  0.153151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7339  putative excinuclease ABC, C subunit  37.88 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1312  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.71 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.12439  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4264  excinuclease ABC subunit C  34.85 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604611  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4762  excinuclease ABC subunit C  36.23 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000128421 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4225  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.39 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0073463  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  37.88 
 
 		 338 aa  43.9  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1257  GIY-YIG nuclease superfamily protein  37.31 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05250  endo/excinuclease amino terminal domain protein  41.79 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3382  excinuclease ABC subunit C  37.31 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114521  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0651  excinuclease ABC subunit C  38.46 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0670127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3514  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.24 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0145  hypothetical protein  35.29 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09001  hypothetical protein  39.71 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0706  excinuclease ABC subunit C  37.14 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0294  hypothetical cytosolic protein  40 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.479939  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1899  GIY-YIG catalytic domain-containing protein  40 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5085  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.78 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_002978  WD0358  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  38.46 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2011  endonuclease  36.36 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000274341  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2889  excinuclease ABC subunit C  34.78 
 
 		 95 aa  42  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0492999  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2599  excinuclease ABC subunit C  38.55 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2891  excinuclease ABC subunit C  39.39 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.625064  normal  0.178968 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2602  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.13 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000820325  normal  0.0436651 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1266  excinuclease ABC subunit C  38.46 
 
 		 109 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0720825  normal  0.107878 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2227  excinuclease ABC subunit C  39.13 
 
 		 107 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000408802  hitchhiker  0.0000527007 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>