More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1863 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1335  molybdopterin oxidoreductase  68.1 
 
 
928 aa  1368    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374333  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1835  molybdopterin oxidoreductase  40.9 
 
 
916 aa  688    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.357483  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2042  twin-arginine translocation pathway signal  69.96 
 
 
930 aa  1404    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.607166  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0954  twin-arginine translocation pathway signal  68.24 
 
 
927 aa  1330    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.323124  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1863  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
932 aa  1930    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2177  sulfur reductase, molybdopterin subunit  40.84 
 
 
909 aa  687    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0307  molybdopterin oxidoreductase  39.2 
 
 
938 aa  689    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000512628  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  28.4 
 
 
812 aa  249  1e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  27.43 
 
 
856 aa  245  3e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  26.76 
 
 
817 aa  241  5e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0619  molybdopterin oxidoreductase  26.72 
 
 
911 aa  214  7e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0860  molybdopterin oxidoreductase family protein  27 
 
 
981 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  25.72 
 
 
981 aa  182  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  26.97 
 
 
961 aa  182  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3996  molybdopterin oxidoreductase  25.87 
 
 
979 aa  182  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290267  normal  0.0213209 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0266  molybdopterin oxidoreductase  28.49 
 
 
1065 aa  177  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1847  molybdopterin oxidoreductase  28.16 
 
 
1058 aa  177  9.999999999999999e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.758609 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  26.5 
 
 
969 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2453  molybdopterin oxidoreductase  24.55 
 
 
909 aa  175  5e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154365  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  25.87 
 
 
978 aa  173  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0144  Nitrate reductase  22.74 
 
 
968 aa  172  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2001  molybdopterin oxidoreductase  25.94 
 
 
978 aa  168  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.754637  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1508  molybdopterin oxidoreductase  28.46 
 
 
1058 aa  168  4e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000115937 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  26.73 
 
 
978 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  25.95 
 
 
953 aa  165  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0925  molybdopterin oxidoreductase  27.8 
 
 
1062 aa  166  3e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1675  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  25.26 
 
 
974 aa  165  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1908  molybdopterin oxidoreductase  25.43 
 
 
876 aa  165  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.11 
 
 
978 aa  163  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2646  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  23 
 
 
935 aa  163  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0950035  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  24.11 
 
 
973 aa  163  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  24.11 
 
 
973 aa  163  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.38 
 
 
978 aa  162  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.38 
 
 
973 aa  162  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  24.38 
 
 
973 aa  162  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1936  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  23.47 
 
 
973 aa  162  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  24 
 
 
973 aa  160  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4940  molybdopterin oxidoreductase  24.96 
 
 
974 aa  156  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.335021 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1238  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  26.19 
 
 
928 aa  156  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1743  molybdopterin oxidoreductase  25.11 
 
 
974 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216268  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1629  molybdopterin oxidoreductase  28.4 
 
 
789 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  33.78 
 
 
732 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4227  molybdopterin oxidoreductase  25.22 
 
 
817 aa  153  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2255  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  24.33 
 
 
814 aa  154  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848686  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0479  molybdopterin oxidoreductase  27.74 
 
 
784 aa  153  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0570  DMSO reductase chain A  25.44 
 
 
958 aa  152  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345051  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  33.33 
 
 
764 aa  152  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1646  molybdopterin oxidoreductase  24.14 
 
 
807 aa  152  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165657  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1612  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  24.17 
 
 
820 aa  151  7e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2226  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  23.34 
 
 
814 aa  150  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.982689 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00898  dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit A  23.44 
 
 
814 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0778088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2749  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  23.44 
 
 
814 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0999  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  23.44 
 
 
814 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  23.44 
 
 
814 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2702  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  23.44 
 
 
814 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.98868 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00905  hypothetical protein  23.44 
 
 
814 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0839348  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  23.44 
 
 
814 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  32.79 
 
 
807 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11280  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.25 
 
 
864 aa  149  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2563  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  23.91 
 
 
794 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000909986  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17920  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.73 
 
 
826 aa  148  4.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.194946  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22240  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  25.83 
 
 
836 aa  145  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.17201 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23 
 
 
814 aa  145  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1029  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23 
 
 
814 aa  145  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1078  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23 
 
 
814 aa  144  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.965114 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0998  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23 
 
 
814 aa  145  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.181006  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  35.14 
 
 
758 aa  145  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1063  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  22.9 
 
 
814 aa  144  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0105709  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1443  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  25.25 
 
 
932 aa  144  8e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0353  molybdopterin oxidoreductase  28.75 
 
 
805 aa  144  8e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.127927 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1208  molybdopterin oxidoreductase  26.55 
 
 
947 aa  144  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3471  molybdopterin oxidoreductase  30.25 
 
 
778 aa  144  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  36.65 
 
 
759 aa  144  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2385  molybdopterin oxidoreductase  24.84 
 
 
839 aa  142  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0793925 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2562  formate dehydrogenase  34.91 
 
 
720 aa  142  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  33.99 
 
 
750 aa  142  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  35.03 
 
 
761 aa  141  3.9999999999999997e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  33.22 
 
 
739 aa  142  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0199  molybdopterin oxidoreductase  23.95 
 
 
917 aa  141  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1560  molybdopterin oxidoreductase  25.74 
 
 
917 aa  141  6e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.444202 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  26.32 
 
 
760 aa  141  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  33.89 
 
 
741 aa  141  7e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0922  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain A  22.74 
 
 
816 aa  140  7.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1789  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.05 
 
 
1020 aa  140  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1868  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.05 
 
 
1020 aa  140  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  27.74 
 
 
722 aa  139  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2304  molybdopterin oxidoreductase  26.24 
 
 
803 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3261  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  22.84 
 
 
816 aa  139  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0162  molybdopterin oxidoreductase  28.85 
 
 
805 aa  139  2e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  26.36 
 
 
760 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0320  Formate dehydrogenase  35.69 
 
 
700 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  33.67 
 
 
760 aa  138  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  31.8 
 
 
730 aa  138  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1418  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  22.76 
 
 
814 aa  138  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3394  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  22.74 
 
 
816 aa  138  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  34.12 
 
 
739 aa  138  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  33.44 
 
 
760 aa  137  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0912  molybdopterin oxidoreductase  35.1 
 
 
739 aa  137  9e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
764 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  33.55 
 
 
764 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>