48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1822 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1822  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
404 aa  829    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.761229 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0689  S-adenosylmethionine synthetase  75 
 
 
460 aa  655    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.918413 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0746  S-adenosylmethionine synthetase  64.11 
 
 
404 aa  545  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0510  S-adenosylmethionine synthetase  59.25 
 
 
401 aa  514  1e-144  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0551  S-adenosylmethionine synthetase  57.43 
 
 
404 aa  486  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.919029  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0921  S-adenosylmethionine synthetase  55.09 
 
 
404 aa  459  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2549  S-adenosylmethionine synthetase  53.59 
 
 
400 aa  418  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000819809  hitchhiker  0.00000000000000187217 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2839  S-adenosylmethionine synthetase  52.56 
 
 
400 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1862  S-adenosylmethionine synthetase  50.85 
 
 
410 aa  408  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.238805 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1448  S-adenosylmethionine synthetase  51.75 
 
 
403 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0918  S-adenosylmethionine synthetase  50.38 
 
 
400 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0247995  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0186  S-adenosylmethionine synthetase  48.75 
 
 
400 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3284  S-adenosylmethionine synthetase  48.5 
 
 
401 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0965  S-adenosylmethionine synthetase  47.87 
 
 
401 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.795652 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0865  S-adenosylmethionine synthetase  44.04 
 
 
408 aa  327  2.0000000000000001e-88  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1744  S-adenosylmethionine synthetase  44 
 
 
401 aa  325  8.000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.153739  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2306  Methionine adenosyltransferase  44.5 
 
 
400 aa  322  6e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.01761  normal  0.685937 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0726  S-adenosylmethionine synthetase  47.84 
 
 
399 aa  322  7e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0318344  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1394  S-adenosylmethionine synthetase  43.81 
 
 
400 aa  317  2e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1064  S-adenosylmethionine synthetase  42.47 
 
 
400 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.329658  normal  0.097531 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0737  S-adenosylmethionine synthetase  44.75 
 
 
406 aa  310  4e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0136402  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2333  S-adenosylmethionine synthetase  44.05 
 
 
403 aa  309  5e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.030297  hitchhiker  0.00106095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1313  S-adenosylmethionine synthetase  41.81 
 
 
398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0745  S-adenosylmethionine synthetase  45.45 
 
 
399 aa  302  6.000000000000001e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000257427  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0913  S-adenosylmethionine synthetase  42.36 
 
 
405 aa  302  9e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal  0.830566 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1330  S-adenosylmethionine synthetase  40.6 
 
 
401 aa  301  9e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0754836  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0923  S-adenosylmethionine synthetase  41.98 
 
 
400 aa  301  2e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.878507  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1768  S-adenosylmethionine synthetase  41.87 
 
 
405 aa  301  2e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0838  S-adenosylmethionine synthetase  40.45 
 
 
400 aa  300  3e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.318063  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1031  S-adenosylmethionine synthetase  41.87 
 
 
405 aa  299  6e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1293  Methionine adenosyltransferase  43.75 
 
 
398 aa  298  1e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0691116  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3461  Methionine adenosyltransferase  39.95 
 
 
401 aa  297  2e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0945  S-adenosylmethionine synthetase  41.87 
 
 
404 aa  295  7e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.939841  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0513  S-adenosylmethionine synthetase  42.26 
 
 
400 aa  295  1e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1975  S-adenosylmethionine synthetase  42.08 
 
 
402 aa  294  2e-78  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0691  S-adenosylmethionine synthetase  41.28 
 
 
402 aa  293  4e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.234507 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0490  S-adenosylmethionine synthetase  40.82 
 
 
405 aa  288  9e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.706606  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2103  S-adenosylmethionine synthetase  43.07 
 
 
402 aa  288  1e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0095  S-adenosylmethionine synthetase  43.2 
 
 
400 aa  287  2e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000589385  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6197  S-adenosylmethionine synthetase  41.15 
 
 
394 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0461  S-adenosylmethionine synthetase  41.19 
 
 
403 aa  285  7e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1180  Methionine adenosyltransferase  39.26 
 
 
404 aa  281  2e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0497405  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1669  Methionine adenosyltransferase  41.26 
 
 
401 aa  280  4e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0231  S-adenosylmethionine synthetase  37.38 
 
 
405 aa  266  7e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00947715 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5306  S-adenosylmethionine synthetase  38.77 
 
 
394 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1694  S-adenosylmethionine synthetase  38.77 
 
 
394 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1403  S-adenosylmethionine synthetase  38.96 
 
 
364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1136  S-adenosylmethionine synthetase  31.61 
 
 
408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208994  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>