More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1810 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
206 aa  411  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  81.09 
 
 
202 aa  331  5e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  62.25 
 
 
204 aa  263  1e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  65.2 
 
 
204 aa  256  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  63.55 
 
 
206 aa  256  2e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0859  SNARE associated Golgi protein  64.04 
 
 
206 aa  254  7e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4069  SNARE associated Golgi protein  40 
 
 
219 aa  150  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208186  hitchhiker  0.00137396 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  45.51 
 
 
198 aa  148  5e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  39.79 
 
 
268 aa  147  8e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  40.09 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  41.55 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  41.06 
 
 
219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  41.06 
 
 
219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  41.06 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  41.06 
 
 
219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  39.89 
 
 
220 aa  138  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  46.34 
 
 
237 aa  137  7.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  45.73 
 
 
237 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  38.74 
 
 
363 aa  136  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  46.58 
 
 
223 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  40.58 
 
 
221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  41.36 
 
 
201 aa  135  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  41.06 
 
 
220 aa  135  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  44.67 
 
 
221 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  40.32 
 
 
259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  41.99 
 
 
219 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  41.99 
 
 
219 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  41.99 
 
 
219 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  41.99 
 
 
219 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  41.99 
 
 
219 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  41.99 
 
 
219 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  44 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  44.9 
 
 
221 aa  133  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  44.97 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  44.25 
 
 
214 aa  132  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  40.19 
 
 
232 aa  131  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  42.29 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1368  integral membrane protein  36.07 
 
 
221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377957  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  42.05 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  44.74 
 
 
220 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  40 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  46 
 
 
222 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  44.74 
 
 
220 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  44.74 
 
 
220 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  42.29 
 
 
219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  38.17 
 
 
256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  41.05 
 
 
216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  40.58 
 
 
220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  38.65 
 
 
219 aa  128  8.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  45.33 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  42.44 
 
 
219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1653  SNARE associated Golgi protein  36.87 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  43.37 
 
 
218 aa  126  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  42.35 
 
 
216 aa  125  5e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  44 
 
 
237 aa  125  6e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  40.1 
 
 
221 aa  124  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  37.26 
 
 
245 aa  124  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2425  hypothetical protein  45.1 
 
 
262 aa  122  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0179  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.04 
 
 
229 aa  122  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.843652  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  37.63 
 
 
215 aa  122  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  37.63 
 
 
215 aa  122  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  44.67 
 
 
224 aa  121  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  37.97 
 
 
220 aa  121  8e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  38.83 
 
 
212 aa  121  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  38.8 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0592  SNARE associated Golgi protein  44.67 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  41.57 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  43.85 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2349  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.5 
 
 
194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.913999  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  38.71 
 
 
213 aa  119  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  39.29 
 
 
220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4379  hypothetical protein  44.76 
 
 
234 aa  118  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.76296  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  39.1 
 
 
235 aa  118  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  40.36 
 
 
215 aa  118  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  41.46 
 
 
252 aa  118  7e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  37.77 
 
 
227 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1543  DedA family protein  36.71 
 
 
202 aa  117  9e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.201859  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0540  SNARE associated Golgi protein  45.33 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4994  hypothetical protein  46 
 
 
216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0579  SNARE associated Golgi protein  45.33 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.6837  normal  0.582888 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  39.88 
 
 
230 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0632  DedA family protein  36.08 
 
 
202 aa  116  3e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  37.77 
 
 
219 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  37.19 
 
 
277 aa  115  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  39.88 
 
 
213 aa  115  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.55 
 
 
209 aa  115  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  38.3 
 
 
214 aa  115  6e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.18 
 
 
458 aa  114  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  37.97 
 
 
222 aa  114  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4407  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.29 
 
 
215 aa  114  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0392  DedA family protein  35.05 
 
 
241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  42 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  38 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  38.67 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4182  SNARE associated Golgi protein  39.1 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.989097  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  37.02 
 
 
228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0244  SNARE associated Golgi protein  41.18 
 
 
237 aa  112  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.052895  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  38.16 
 
 
218 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  41.42 
 
 
223 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  42.11 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>