More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1789 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 309 aa  632  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  70.79 
 
 		 292 aa  434  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  70.61 
 
 		 287 aa  411  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  66.31 
 
 		 288 aa  387  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  64.87 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  64.75 
 
 		 288 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  54.29 
 
 		 284 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  51.59 
 
 		 284 aa  323  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  52.86 
 
 		 284 aa  320  1.9999999999999998e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  48.93 
 
 		 284 aa  317  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  48.93 
 
 		 284 aa  317  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  53.05 
 
 		 284 aa  317  2e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  50.88 
 
 		 284 aa  314  9.999999999999999e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  53.76 
 
 		 296 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  53.17 
 
 		 289 aa  311  5.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 		 284 aa  309  4e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  52.31 
 
 		 296 aa  304  1.0000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  51.99 
 
 		 283 aa  300  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 		 287 aa  299  4e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  48.58 
 
 		 287 aa  291  1e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  46.55 
 
 		 300 aa  289  4e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  49.3 
 
 		 289 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  49.3 
 
 		 289 aa  288  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  46.85 
 
 		 299 aa  287  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  48.11 
 
 		 294 aa  287  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  47.77 
 
 		 294 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  46.15 
 
 		 286 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  48.11 
 
 		 294 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  46.15 
 
 		 286 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  47.77 
 
 		 294 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  47.77 
 
 		 294 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  49.3 
 
 		 287 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  46.29 
 
 		 300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  49.47 
 
 		 283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2699  formyltetrahydrofolate deformylase  48.11 
 
 		 294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622702  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 		 287 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  48.23 
 
 		 282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2841  formyltetrahydrofolate deformylase  48.11 
 
 		 294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  47.16 
 
 		 281 aa  282  5.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0678  formyltetrahydrofolate deformylase  49.47 
 
 		 285 aa  280  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  47.84 
 
 		 282 aa  280  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  46.76 
 
 		 284 aa  279  3e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  47.84 
 
 		 282 aa  280  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  47.48 
 
 		 284 aa  279  4e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  46.67 
 
 		 286 aa  279  4e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  48.23 
 
 		 286 aa  278  7e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  46.15 
 
 		 285 aa  278  9e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  47.28 
 
 		 296 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  47.54 
 
 		 287 aa  277  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  47.31 
 
 		 283 aa  276  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  48.06 
 
 		 287 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0496  formyltetrahydrofolate deformylase  48.42 
 
 		 293 aa  276  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275042  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  47.12 
 
 		 282 aa  276  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  45.71 
 
 		 293 aa  276  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  46.8 
 
 		 295 aa  275  5e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  46.32 
 
 		 289 aa  275  6e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1577  formyltetrahydrofolate deformylase  47.16 
 
 		 287 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.621505 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  45.61 
 
 		 289 aa  275  9e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18381  formyltetrahydrofolate deformylase  48.24 
 
 		 284 aa  275  9e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  46.5 
 
 		 288 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0584  formyltetrahydrofolate deformylase  47.06 
 
 		 291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  44.41 
 
 		 287 aa  273  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1311  formyltetrahydrofolate deformylase  46.1 
 
 		 284 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  44.33 
 
 		 290 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21841  formyltetrahydrofolate deformylase  45.74 
 
 		 284 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.310068  normal  0.572618 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  46.26 
 
 		 294 aa  272  5.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  46.26 
 
 		 294 aa  272  5.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  46.1 
 
 		 307 aa  271  7e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1303  formyltetrahydrofolate deformylase  46.26 
 
 		 295 aa  271  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.154885 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  46.76 
 
 		 284 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.571525  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1192  formyltetrahydrofolate deformylase  47.12 
 
 		 283 aa  271  1e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  46.79 
 
 		 294 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1023  formyltetrahydrofolate deformylase  48.04 
 
 		 284 aa  270  2e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.124115  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4562  formyltetrahydrofolate deformylase  47.7 
 
 		 287 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0944  formyltetrahydrofolate deformylase  46.79 
 
 		 294 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1583  formyltetrahydrofolate deformylase  46.64 
 
 		 287 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1100  formyltetrahydrofolate deformylase  46.76 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.862849  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  46.4 
 
 		 282 aa  269  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  47.22 
 
 		 287 aa  269  5e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  44.6 
 
 		 288 aa  269  5e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2603  formyltetrahydrofolate deformylase  46.43 
 
 		 294 aa  269  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  45.91 
 
 		 288 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2552  formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 		 284 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445829 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  46.76 
 
 		 282 aa  268  7e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  48.39 
 
 		 287 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  46.34 
 
 		 316 aa  268  8e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2074  formyltetrahydrofolate deformylase  46.26 
 
 		 288 aa  268  8e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  46.15 
 
 		 284 aa  268  8.999999999999999e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  47.33 
 
 		 282 aa  268  8.999999999999999e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  46.4 
 
 		 284 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.857167  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1628  formyltetrahydrofolate deformylase  45.1 
 
 		 298 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0459247  normal  0.542854 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  46.26 
 
 		 288 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19121  formyltetrahydrofolate deformylase  46.04 
 
 		 290 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2122  formyltetrahydrofolate deformylase  46.95 
 
 		 297 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  46.69 
 
 		 289 aa  266  4e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  46.62 
 
 		 288 aa  266  5e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  46.21 
 
 		 283 aa  265  5.999999999999999e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2671  formyltetrahydrofolate deformylase  47.67 
 
 		 284 aa  265  5.999999999999999e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0749436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4352  formyltetrahydrofolate deformylase  46.26 
 
 		 299 aa  265  8e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157663  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1237  formyltetrahydrofolate deformylase  47.33 
 
 		 284 aa  264  1e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>