More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1775 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1775  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 159 aa  318  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  59.49 
 
 		 164 aa  187  5.999999999999999e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  56.69 
 
 		 169 aa  184  4e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  54.14 
 
 		 167 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1798  lipoprotein signal peptidase  54.72 
 
 		 168 aa  172  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226903  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  54.09 
 
 		 168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  47.77 
 
 		 163 aa  147  5e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2046  lipoprotein signal peptidase  41.92 
 
 		 193 aa  110  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  45.39 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  37.09 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  38.61 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  37.75 
 
 		 191 aa  85.1  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  40.15 
 
 		 149 aa  83.6  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  40.43 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0234  Lipoprotein signal peptidase-like protein  29.69 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  37.09 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3677  signal peptidase II  30.32 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.273504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  37.84 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  36.08 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  38.12 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  38.06 
 
 		 212 aa  77  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 		 191 aa  77  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  38.31 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  36.94 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5729  Lipoprotein signal peptidase-like protein  32.07 
 
 		 261 aa  74.3  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0418  peptidase A8 signal peptidase II  28.57 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.216588 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3783  lipoprotein signal peptidase  35.48 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.800649  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4392  lipoprotein signal peptidase  30.29 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000433749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4439  signal peptidase II  35.57 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1530  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 		 166 aa  72  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  35.48 
 
 		 235 aa  72  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  38.69 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  37.16 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  38.41 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  38.26 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1257  lipoprotein signal peptidase  32.89 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  37.16 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  32.89 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  36.25 
 
 		 178 aa  70.5  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  35.67 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  38.19 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  32.48 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  35.25 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  35.9 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  34.21 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0762  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  34.9 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  32.69 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  36.31 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  31.79 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  34.9 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09461  lipoprotein signal peptidase  39.24 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.268315  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  38.12 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  33.78 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  34.25 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  30.88 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0018  lipoprotein signal peptidase  30.56 
 
 		 236 aa  67.4  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  31.45 
 
 		 178 aa  67.4  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0760  lipoprotein signal peptidase  33.8 
 
 		 158 aa  67  0.00000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.473173  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  32.69 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  32.65 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0555  lipoprotein signal peptidase  39.04 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.803857  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  32.43 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  30.57 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  39.22 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0885  lipoprotein signal peptidase  32.24 
 
 		 152 aa  67  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0111972  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 		 219 aa  67  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1910  lipoprotein signal peptidase  37.16 
 
 		 154 aa  67  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  33.99 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  32.08 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  37.66 
 
 		 243 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0710  lipoprotein signal peptidase  39.04 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108511 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  32.89 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  31.51 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  36.5 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  34.01 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  32.72 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1860  signal peptidase II  33.97 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2249  lipoprotein signal peptidase  31.29 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.464022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  35.46 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  35.81 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0037  lipoprotein signal peptidase  37.09 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.251395 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  32.69 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>