More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1767 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1767  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
349 aa  712    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00166566  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1646  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  77.2 
 
 
312 aa  483  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.108455  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2055  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  71.99 
 
 
311 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00545936  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0719  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  71.1 
 
 
308 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.778436  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1334  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.86 
 
 
311 aa  442  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0492  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  70.43 
 
 
301 aa  437  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0142904  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1788  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  71.24 
 
 
308 aa  424  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000240723  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0723  aspartate carbamoyltransferase  50 
 
 
320 aa  295  7e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.515501  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  50.49 
 
 
312 aa  293  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  49.67 
 
 
313 aa  293  4e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2657  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.37 
 
 
306 aa  293  4e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1173  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.4 
 
 
310 aa  291  9e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0344  aspartate carbamoyltransferase  46.93 
 
 
307 aa  291  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000132392  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.86 
 
 
313 aa  289  6e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0725  aspartate carbamoyltransferase  47.78 
 
 
312 aa  288  7e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00253963  hitchhiker  0.0000000314766 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.52 
 
 
307 aa  288  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  47.76 
 
 
311 aa  288  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0084  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.41 
 
 
307 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2333  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.86 
 
 
328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.993872  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2268  aspartate carbamoyltransferase  46.75 
 
 
315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.120593  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.12 
 
 
312 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2090  aspartate carbamoyltransferase  48.36 
 
 
305 aa  282  8.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3190  aspartate carbamoyltransferase  47.37 
 
 
319 aa  281  9e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.482997  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0924  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.68 
 
 
344 aa  280  3e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463158  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  47.71 
 
 
306 aa  280  3e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0370  aspartate carbamoyltransferase  46.45 
 
 
309 aa  279  4e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1284  aspartate carbamoyltransferase  47.21 
 
 
312 aa  279  5e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0189809  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10323  probable aspartate carbamoyltransferase  44.66 
 
 
309 aa  279  6e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0953  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.37 
 
 
312 aa  278  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0935774  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0941  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.19 
 
 
328 aa  277  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.253806  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0370  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.66 
 
 
307 aa  276  6e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0685539  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1641  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.87 
 
 
321 aa  274  1.0000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.452041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4349  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.71 
 
 
316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0964  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.22 
 
 
308 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2660  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.91 
 
 
315 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3345  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.4 
 
 
320 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.164434  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1818  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.39 
 
 
304 aa  273  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.175577  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5487  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.91 
 
 
313 aa  273  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.07038 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3310  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.37 
 
 
316 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0678  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.96 
 
 
323 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  46.58 
 
 
312 aa  271  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1713  aspartate carbamoyltransferase  46.43 
 
 
320 aa  271  1e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  47.44 
 
 
329 aa  271  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0541  aspartate carbamoyltransferase  46.75 
 
 
306 aa  270  2e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000499557  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09370  aspartate carbamoyltransferase  47.04 
 
 
313 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.370258  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3747  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.91 
 
 
315 aa  269  4e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67324  normal  0.0274086 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2913  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.54 
 
 
336 aa  270  4e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.02 
 
 
323 aa  269  5e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880032  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0622  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.02 
 
 
323 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2324  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.91 
 
 
346 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0736648 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0612  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.68 
 
 
313 aa  269  7e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.295857  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3848  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.03 
 
 
316 aa  268  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0236185 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0602  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.03 
 
 
316 aa  268  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.89 
 
 
316 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2765  aspartate carbamoyltransferase  46.36 
 
 
313 aa  268  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.376966  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0503  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.65 
 
 
312 aa  268  1e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0338301  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2582  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.73 
 
 
317 aa  267  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.54 
 
 
317 aa  267  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0346  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.93 
 
 
321 aa  267  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419246  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3059  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.05 
 
 
327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2666  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.05 
 
 
327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3061  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.22 
 
 
341 aa  266  2.9999999999999995e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.280506  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3808  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.91 
 
 
341 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03120  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.77 
 
 
336 aa  267  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0295366  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0871  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.91 
 
 
341 aa  266  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1994  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.91 
 
 
343 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165088  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0708  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.25 
 
 
323 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3167  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.91 
 
 
343 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0365  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.62 
 
 
324 aa  266  5e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1581  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.12 
 
 
320 aa  266  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1145  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.57 
 
 
320 aa  266  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2282  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.2 
 
 
317 aa  266  5e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.47523  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.94 
 
 
323 aa  266  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.1 
 
 
328 aa  266  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  45.9 
 
 
313 aa  266  5e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3890  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.2 
 
 
319 aa  265  5.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0327  aspartate carbamoyltransferase  46.05 
 
 
312 aa  266  5.999999999999999e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.22 
 
 
361 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3145  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.22 
 
 
361 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3109  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.22 
 
 
361 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2749  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.22 
 
 
361 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0919  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.22 
 
 
361 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1353  aspartate carbamoyltransferase  47.12 
 
 
333 aa  265  7e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0910  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.44 
 
 
320 aa  265  7e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.297016 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12660  aspartate carbamoyltransferase  45.6 
 
 
319 aa  265  7e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0228481 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3512  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.75 
 
 
315 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0482  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.93 
 
 
334 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1465  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.9 
 
 
343 aa  264  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.981882  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1010  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.71 
 
 
334 aa  264  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174033  normal  0.205744 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3105  aspartate carbamoyltransferase  45.42 
 
 
302 aa  264  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178757  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3635  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.93 
 
 
315 aa  264  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.177369 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5040  aspartate carbamoyltransferase  45.48 
 
 
334 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.93 
 
 
315 aa  264  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15550  aspartate carbamoyltransferase  47.42 
 
 
310 aa  264  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.824951  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2102  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.5 
 
 
317 aa  264  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11409  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.41 
 
 
319 aa  264  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.098973  normal  0.197941 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0155  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.71 
 
 
309 aa  263  3e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.269734  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4545  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  42.63 
 
 
308 aa  263  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.27 
 
 
343 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0757  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.27 
 
 
343 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.305012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>