More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1711 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  100 
 
 		 444 aa  912    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  66.44 
 
 		 441 aa  624  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  53.67 
 
 		 444 aa  477  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  52.2 
 
 		 442 aa  458  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  52.2 
 
 		 440 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  49.89 
 
 		 449 aa  444  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  48.31 
 
 		 440 aa  421  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  40.24 
 
 		 438 aa  311  1e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  35.1 
 
 		 432 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  36.61 
 
 		 443 aa  265  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  35.63 
 
 		 430 aa  261  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  36.19 
 
 		 457 aa  261  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  36.87 
 
 		 427 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  36.5 
 
 		 435 aa  249  5e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  33.72 
 
 		 429 aa  240  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  37.88 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  37.88 
 
 		 407 aa  229  5e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  38.44 
 
 		 445 aa  227  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  31.68 
 
 		 437 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  31.81 
 
 		 434 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  31.54 
 
 		 434 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  31.54 
 
 		 434 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  30.94 
 
 		 450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  30.51 
 
 		 441 aa  197  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  30.28 
 
 		 422 aa  197  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.28 
 
 		 422 aa  197  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  31.88 
 
 		 428 aa  194  3e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  29.37 
 
 		 434 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  29.31 
 
 		 432 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  29.58 
 
 		 437 aa  186  9e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  29.47 
 
 		 450 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  30.71 
 
 		 438 aa  182  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  29.13 
 
 		 434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  29.89 
 
 		 428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  29.23 
 
 		 446 aa  180  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  28.4 
 
 		 415 aa  179  7e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0588  WD40 domain protein beta Propeller  32.7 
 
 		 439 aa  179  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000301748  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  28.09 
 
 		 441 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  28.21 
 
 		 428 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  31.76 
 
 		 454 aa  173  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  27.21 
 
 		 427 aa  173  6.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  29.44 
 
 		 446 aa  171  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  30.64 
 
 		 451 aa  169  9e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  28.02 
 
 		 444 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  26.96 
 
 		 424 aa  168  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  31.94 
 
 		 461 aa  167  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  29.43 
 
 		 435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  26.52 
 
 		 432 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  27.54 
 
 		 450 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  27.32 
 
 		 427 aa  166  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  29.06 
 
 		 425 aa  164  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  27.78 
 
 		 450 aa  164  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  28.99 
 
 		 434 aa  164  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  27.74 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  26.27 
 
 		 430 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  27.11 
 
 		 436 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  27.95 
 
 		 439 aa  163  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  27.78 
 
 		 449 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  26.51 
 
 		 430 aa  163  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  26.59 
 
 		 441 aa  163  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1454  TolB protein  25.57 
 
 		 419 aa  162  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  25.62 
 
 		 419 aa  162  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  26.27 
 
 		 421 aa  162  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  26.28 
 
 		 450 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  29.7 
 
 		 451 aa  161  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  27.16 
 
 		 430 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  27.16 
 
 		 430 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  27.19 
 
 		 429 aa  160  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  30.45 
 
 		 442 aa  159  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  25.52 
 
 		 443 aa  160  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  27.58 
 
 		 463 aa  160  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  27.16 
 
 		 463 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  27.05 
 
 		 449 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  27.16 
 
 		 433 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  27.16 
 
 		 433 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  27.16 
 
 		 431 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  27.16 
 
 		 463 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  26.81 
 
 		 442 aa  159  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0727  TolB domain-containing protein  31.72 
 
 		 437 aa  158  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  26.21 
 
 		 430 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  28.04 
 
 		 462 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  28.16 
 
 		 441 aa  157  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  29.89 
 
 		 442 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  29.89 
 
 		 442 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  29.89 
 
 		 442 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  29.97 
 
 		 441 aa  156  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1585  WD40 domain protein beta Propeller  25.92 
 
 		 437 aa  156  6e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.637887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.53 
 
 		 446 aa  156  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  29.97 
 
 		 442 aa  156  7e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  28.46 
 
 		 442 aa  155  9e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  26.63 
 
 		 438 aa  156  9e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  26.27 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  29.61 
 
 		 442 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  28.34 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  27.17 
 
 		 439 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  25.85 
 
 		 431 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  29.78 
 
 		 442 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  25.85 
 
 		 431 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  29.78 
 
 		 442 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  29.78 
 
 		 442 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>