More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1662 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 381 aa  740    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 388 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  35.95 
 
 		 423 aa  224  3e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  35.7 
 
 		 423 aa  223  4e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  35.7 
 
 		 423 aa  223  4.9999999999999996e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 397 aa  194  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  33.95 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  33.62 
 
 		 414 aa  176  8e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  34.4 
 
 		 396 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  33.71 
 
 		 414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  34.12 
 
 		 373 aa  160  4e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4891  major facilitator transporter  33.9 
 
 		 409 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390253  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3273  major facilitator transporter  33.9 
 
 		 409 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0542458 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6916  major facilitator transporter  33.9 
 
 		 409 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 409 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0679  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 403 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6406  major facilitator transporter  33.53 
 
 		 409 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  30.34 
 
 		 409 aa  143  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  32.8 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 410 aa  119  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3739  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 403 aa  116  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 411 aa  115  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 385 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  27.52 
 
 		 399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 384 aa  113  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3637  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476152  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 399 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0827  major facilitator superfamily permease  29.5 
 
 		 392 aa  104  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 		 400 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  29.08 
 
 		 386 aa  103  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 		 383 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4092  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 		 396 aa  97.1  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 		 400 aa  93.2  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2079  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 423 aa  92.8  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.816032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 		 415 aa  91.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1649  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 413 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1716  major facilitator superfamily transporter  27.85 
 
 		 413 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1625  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 413 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0979521  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 388 aa  90.5  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1657  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 413 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.992815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 391 aa  87.8  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  27.79 
 
 		 388 aa  86.3  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  27.3 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2090  major facilitator transporter  28 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106737  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0734  major facilitator superfamily permease  25.52 
 
 		 401 aa  83.2  0.000000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00142824  normal  0.0126136 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  24.6 
 
 		 383 aa  80.5  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0134  major facilitator superfamily permease  26.38 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3646  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  29.63 
 
 		 501 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  20.97 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  25.69 
 
 		 487 aa  78.2  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0898  major facilitator family transporter  23.44 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  23.43 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  23.43 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0296  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.93 
 
 		 531 aa  77  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.04 
 
 		 476 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0658  major facilitator transporter  23.44 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1308  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000644714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 474 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  29.1 
 
 		 515 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4530  major facilitator family transporter  23.85 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516795  normal  0.212177 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.57 
 
 		 504 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0801  major facilitator family transporter  23.18 
 
 		 394 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0947  drug resistance transporter  25.66 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  23.23 
 
 		 448 aa  74.3  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.04 
 
 		 498 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0819  major facilitator family transporter  23.53 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.23042e-52 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 439 aa  73.2  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.19 
 
 		 478 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  29.33 
 
 		 478 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  28.14 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.19 
 
 		 479 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.19 
 
 		 479 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  29.33 
 
 		 478 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  28.14 
 
 		 399 aa  72.8  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  28.14 
 
 		 424 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.33 
 
 		 478 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0651  major facilitator family transporter  22.92 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0650  major facilitator family transporter  22.87 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407315  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.33 
 
 		 478 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1000  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 531 aa  72.4  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.99 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.4 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1289  major facilitator superfamily permease  25.59 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000157601  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  26.48 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.18 
 
 		 480 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.85 
 
 		 697 aa  70.5  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  26.14 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>