More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1648 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 177 aa  365  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  57.23 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  51.15 
 
 		 170 aa  177  5.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 158 aa  97.1  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  39.84 
 
 		 161 aa  93.6  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 156 aa  91.3  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 173 aa  90.5  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 158 aa  90.5  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 174 aa  90.9  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 158 aa  89  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  37.19 
 
 		 191 aa  89  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  87  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 158 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 158 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 158 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 158 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  34.59 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  36.36 
 
 		 162 aa  84.7  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  33.09 
 
 		 161 aa  84.3  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 168 aa  83.6  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  35.61 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 153 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  35 
 
 		 158 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  29.85 
 
 		 158 aa  80.5  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  35.83 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  36 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  33.33 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  35 
 
 		 147 aa  77  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  35.9 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  35.16 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  35.9 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 167 aa  73.9  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 148 aa  72  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2954  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0252271 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  31.82 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  28.17 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 149 aa  62  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34950  MarR family regulatory protein  32.56 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  26.57 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2562  MarR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0883  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.736004  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  27.14 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3267  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  26.57 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 148 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  26.61 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  26.61 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  25.87 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1597  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  25.87 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>