255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1627 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 441 aa  894    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  58.2 
 
 		 444 aa  532  1e-150  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  52.48 
 
 		 442 aa  478  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  53.51 
 
 		 441 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  49.53 
 
 		 443 aa  429  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  47.76 
 
 		 442 aa  425  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  49.32 
 
 		 403 aa  421  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  35.82 
 
 		 481 aa  257  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  28.73 
 
 		 483 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  28.48 
 
 		 478 aa  182  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  27.96 
 
 		 501 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000194355  normal  0.0100498 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  27.97 
 
 		 480 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1059  permease YjgP/YjgQ family protein  26.78 
 
 		 498 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546166  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  27.09 
 
 		 417 aa  156  8e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0011  permease YjgP/YjgQ family protein  25.88 
 
 		 527 aa  152  2e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0598  hypothetical protein  25.69 
 
 		 651 aa  144  4e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  21.37 
 
 		 495 aa  137  4e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2110  permease YjgP/YjgQ family protein  25.54 
 
 		 486 aa  130  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185125  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06260  hypothetical protein  24.82 
 
 		 456 aa  130  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0371515  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  25.47 
 
 		 391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  22.25 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  23.69 
 
 		 792 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  31.33 
 
 		 389 aa  100  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  24.3 
 
 		 391 aa  97.1  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  23.4 
 
 		 388 aa  96.3  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  27.71 
 
 		 418 aa  95.5  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  24.54 
 
 		 374 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  28.21 
 
 		 399 aa  92  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  22.68 
 
 		 364 aa  91.7  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  36.81 
 
 		 365 aa  89.7  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  25.4 
 
 		 392 aa  87  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  26.3 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  23.45 
 
 		 379 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  20 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  26.56 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  26.64 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  24.08 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  24.08 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  36.88 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  26.13 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  26.87 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  26.07 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  22.05 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  21.99 
 
 		 380 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  23.2 
 
 		 1153 aa  75.1  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  29.41 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  24.69 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  21.92 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0556  permease YjgP/YjgQ family protein  27.99 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023803 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  19.75 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  25.19 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  32.61 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  27.94 
 
 		 395 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  23.21 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  25.42 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  23.62 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  22.51 
 
 		 1096 aa  70.9  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  24.18 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  23.51 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  31.35 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  24.15 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  23.62 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  24.15 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  23.18 
 
 		 1061 aa  67.8  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  22.32 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  23.04 
 
 		 1061 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  26.82 
 
 		 1040 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  30.09 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2209  permease YjgP/YjgQ family protein  31.25 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  25.74 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0517  permease  29.03 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300348  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  26.69 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  28.79 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2200  YjgP/YjgQ family protein  26.46 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.395164  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1856  permease YjgP/YjgQ family protein  26.46 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  24.81 
 
 		 402 aa  63.2  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  25.87 
 
 		 371 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  25.87 
 
 		 371 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  25.88 
 
 		 371 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  25.88 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  23.66 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  30.83 
 
 		 400 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  39.29 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  31.1 
 
 		 356 aa  62  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1814  permease YjgP/YjgQ  33.33 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  23.38 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  22.81 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  32.09 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  29.95 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  25 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  22.43 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  27.01 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  24.68 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  25.45 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  22.62 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  32.93 
 
 		 387 aa  59.7  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  26.17 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  36.14 
 
 		 360 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  22.22 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  25.91 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>