74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1622 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1622  Outer membrane protein (porin)-like protein  100 
 
 		 333 aa  676    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000161608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  32.3 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  30.53 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  31.19 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3750  outer membrane protein (porin)  27.31 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.817752 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0880  OmpC family outer membrane porin  28.1 
 
 		 378 aa  53.5  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456854  normal  0.339444 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  29.82 
 
 		 386 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  29.82 
 
 		 386 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1947  hypothetical protein  24.52 
 
 		 393 aa  52.8  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309501  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5031  porin  27.24 
 
 		 357 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  29.55 
 
 		 386 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  30.26 
 
 		 386 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2970  porin  27.11 
 
 		 316 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00088463  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6299  porin Gram-negative type  28.88 
 
 		 369 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1891  porin  28.31 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0840152  normal  0.0627255 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  33.67 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  29.33 
 
 		 386 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  29.33 
 
 		 386 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  29.82 
 
 		 386 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0285  outer membrane protein (porin)  28.03 
 
 		 367 aa  50.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  30.1 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  30.1 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  30.1 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  27.08 
 
 		 394 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  28.45 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  30.1 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  30.1 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  27.63 
 
 		 387 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  30.1 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  30.1 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  28 
 
 		 375 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  27.03 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2108  porin signal peptide protein  26.87 
 
 		 381 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0434327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  28 
 
 		 375 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  30.74 
 
 		 414 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3304  porin  26.81 
 
 		 314 aa  47.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  hitchhiker  0.00000130468 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  27.56 
 
 		 375 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1073  porin  25.42 
 
 		 308 aa  47.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147353  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  28.57 
 
 		 381 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  28.89 
 
 		 381 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3454  porin  26.98 
 
 		 315 aa  47  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0284932  hitchhiker  0.000170236 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  29.33 
 
 		 380 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  24.78 
 
 		 383 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  26.88 
 
 		 380 aa  46.2  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  25.66 
 
 		 384 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  26.87 
 
 		 362 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  28.12 
 
 		 381 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  25.66 
 
 		 384 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  25.66 
 
 		 384 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1557  outer membrane porin, putative  27.47 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2322  outer membrane porin protein  27.35 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0587  putative outer membrane porin  27.35 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1848  putative outer membrane porin  27.35 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0156948  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2750  porin  27.59 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000019899  unclonable  0.00000382336 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0881  putative outer membrane porin  27.35 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  29.06 
 
 		 380 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  29.06 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  27.11 
 
 		 375 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  27.85 
 
 		 394 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  27.31 
 
 		 380 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  26.67 
 
 		 379 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  24.06 
 
 		 374 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1295  porin  24.71 
 
 		 316 aa  43.1  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  31.34 
 
 		 338 aa  43.1  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  29.57 
 
 		 367 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  25 
 
 		 362 aa  43.5  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4306  porin Gram-negative type  27.63 
 
 		 354 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4416  porin Gram-negative type  27.63 
 
 		 354 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1016  outer membrane porin  27.65 
 
 		 358 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1102  outer membrane porin  27.65 
 
 		 358 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  28.45 
 
 		 389 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  28.45 
 
 		 389 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  28.45 
 
 		 389 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  28.17 
 
 		 382 aa  42.4  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.555277 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>