98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1621 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  100 
 
 
138 aa  269  8.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  70.15 
 
 
140 aa  192  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  64.49 
 
 
149 aa  184  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  66.42 
 
 
136 aa  180  6e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  61.59 
 
 
138 aa  174  5e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1889  DoxX family protein  61.31 
 
 
150 aa  152  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  51.94 
 
 
143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  53.91 
 
 
128 aa  131  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  51.52 
 
 
157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  48.09 
 
 
144 aa  125  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  48.06 
 
 
143 aa  124  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  48.06 
 
 
144 aa  123  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  51.61 
 
 
131 aa  120  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  45.74 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  48.06 
 
 
143 aa  118  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  48.12 
 
 
134 aa  114  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  47.62 
 
 
127 aa  114  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  45.97 
 
 
130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  45.86 
 
 
140 aa  114  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  48.39 
 
 
130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  44.78 
 
 
128 aa  111  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  44.03 
 
 
134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2799  DoxX family protein  48 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  48.09 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  50.45 
 
 
137 aa  107  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  50 
 
 
131 aa  104  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0915  DoxX  44.92 
 
 
131 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  41.6 
 
 
127 aa  102  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  47.33 
 
 
137 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1661  DoxX  40.98 
 
 
132 aa  95.5  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.430613  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3963  DoxX family protein  43.48 
 
 
114 aa  90.9  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804647  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2974  DoxX  45.97 
 
 
134 aa  90.5  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00548742  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2122  DoxX family protein  40.16 
 
 
129 aa  84  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0176  SRC kinase associated phosphoprotein 2  37.17 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.479419  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  35.51 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  33.57 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  30.28 
 
 
147 aa  53.9  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  29.32 
 
 
148 aa  53.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  40.68 
 
 
161 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  36.29 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  32.86 
 
 
144 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  30.4 
 
 
138 aa  51.2  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  35.97 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  32.59 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  33.87 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  31.3 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  29.5 
 
 
133 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02881  hypothetical protein  30.88 
 
 
186 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  34.33 
 
 
147 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0267  hypothetical protein  30.15 
 
 
186 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  27.07 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  31.88 
 
 
144 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02871  hypothetical protein  30.15 
 
 
186 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.714602  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  36.84 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  33.86 
 
 
172 aa  45.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  31.5 
 
 
144 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  31.15 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  32.81 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1342  DoxX family protein  33.33 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  30.43 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  32.35 
 
 
137 aa  43.9  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  27.97 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02981  hypothetical protein  29.1 
 
 
186 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.925648  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  27.41 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  36.29 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  29.36 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4241  DoxX family protein  32.37 
 
 
297 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  33.33 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  25.93 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0094  DoxX family protein  35.63 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  35.65 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02921  hypothetical protein  28.47 
 
 
190 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  31.15 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  30.36 
 
 
149 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  29.79 
 
 
296 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  34.04 
 
 
181 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  35.25 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  31.9 
 
 
136 aa  41.2  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  35.25 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  30.3 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  30.6 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  35.88 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  35.61 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5722  DoxX family protein  34.62 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.486124  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  35.59 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  32.82 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  35.88 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  28.17 
 
 
154 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0883  DoxX family protein  29.63 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4589  hypothetical protein  35.4 
 
 
134 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4441  hypothetical protein  35.4 
 
 
134 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4106  hypothetical protein  35.4 
 
 
134 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4095  hypothetical protein  35.4 
 
 
134 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0756  hypothetical protein  35.4 
 
 
134 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4257  hypothetical protein  35.4 
 
 
134 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4480  hypothetical protein  35.4 
 
 
134 aa  40  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4442  hypothetical protein  35.4 
 
 
134 aa  40  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4492  hypothetical protein  35.4 
 
 
134 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>