110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1613 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  100 
 
 
311 aa  646    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  65.59 
 
 
310 aa  414  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  43.87 
 
 
314 aa  272  5.000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  42.72 
 
 
316 aa  247  2e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  44.53 
 
 
312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0955  methyltransferase type 12  41.42 
 
 
313 aa  233  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.978097  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  36.79 
 
 
330 aa  179  7e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  32.48 
 
 
300 aa  156  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  33.11 
 
 
306 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  30.59 
 
 
298 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  30.85 
 
 
287 aa  138  8.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  32.47 
 
 
273 aa  132  5e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  28.36 
 
 
285 aa  125  7e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  27.7 
 
 
282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
330 aa  93.2  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
303 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  28.06 
 
 
318 aa  89.4  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  32.1 
 
 
332 aa  86.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  24.74 
 
 
317 aa  87  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  27.65 
 
 
310 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  30 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  28.02 
 
 
342 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  29.96 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  31.87 
 
 
308 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  24.42 
 
 
358 aa  77.4  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  27.1 
 
 
281 aa  75.9  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  27.75 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  27.35 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  23.46 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  26.95 
 
 
672 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.41 
 
 
345 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  24.74 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  28.65 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  28.8 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  28.97 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  28.47 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  27.23 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  29.9 
 
 
333 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  28.49 
 
 
335 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  30.46 
 
 
346 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 
1037 aa  62  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  22.18 
 
 
310 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  29.9 
 
 
323 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  29.9 
 
 
323 aa  62  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  21.96 
 
 
308 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5277  methyltransferase type 12  34.48 
 
 
625 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  26.53 
 
 
286 aa  55.8  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  21.4 
 
 
306 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14431  hypothetical protein  25.16 
 
 
341 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.131958  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  25.41 
 
 
1340 aa  54.3  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3474  Methyltransferase type 12  26.41 
 
 
371 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5610  methyltransferase type 12  35.37 
 
 
613 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194335  hitchhiker  0.000698076 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2732  hypothetical protein  21.77 
 
 
236 aa  52.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422466  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1277  Methyltransferase type 11  24.67 
 
 
572 aa  52.4  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  32.19 
 
 
383 aa  52.4  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 
1177 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  24.48 
 
 
240 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  27.22 
 
 
215 aa  51.2  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 
1523 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  29.55 
 
 
310 aa  50.8  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1840  methionine biosynthesis MetW  27.27 
 
 
205 aa  50.4  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0560635  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  24.82 
 
 
298 aa  50.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  27.16 
 
 
323 aa  49.7  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  26.92 
 
 
293 aa  49.7  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  28.65 
 
 
244 aa  49.3  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  30.68 
 
 
447 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
1177 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  30.68 
 
 
447 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  26.25 
 
 
305 aa  49.3  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2104  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like protein  25.66 
 
 
304 aa  49.3  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  26.45 
 
 
1523 aa  49.3  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  29.07 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  27.22 
 
 
581 aa  47.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  26.79 
 
 
415 aa  47.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0032  hypothetical protein  29.55 
 
 
187 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0058  hypothetical protein  29.55 
 
 
187 aa  47  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.546148 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 
996 aa  46.6  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  24.71 
 
 
326 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3809  methyltransferase type 11  27.95 
 
 
354 aa  46.6  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0063  hypothetical protein  28.79 
 
 
187 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.387558  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  27.92 
 
 
303 aa  46.2  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3404  methyltransferase type 11  30.28 
 
 
226 aa  46.2  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3087  hypothetical protein  23.67 
 
 
353 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123974  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0356  methyltransferase type 11  22.96 
 
 
293 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859142  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  27.73 
 
 
450 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 
1314 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  31.73 
 
 
457 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  25.42 
 
 
233 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0100  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.46 
 
 
253 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1217  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 
607 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.861271  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1253  hypothetical protein  23.23 
 
 
255 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.470333  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  24.36 
 
 
292 aa  44.3  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1484  glycosyl transferase WecB/TagA/CpsF  25 
 
 
574 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000853936  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0079  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.46 
 
 
253 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  21.71 
 
 
232 aa  44.3  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0448  methyltransferase type 12  21.48 
 
 
307 aa  43.9  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00834451  normal  0.0296348 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 
1094 aa  43.9  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  23.95 
 
 
334 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>