More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1598 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0853  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  88.26 
 
 
545 aa  974    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0851  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  88.26 
 
 
545 aa  975    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.157945  normal  0.412273 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0970  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  86.42 
 
 
545 aa  953    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0163848  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0752  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  84.77 
 
 
545 aa  943    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.511316  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0643  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  85.06 
 
 
544 aa  945    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552071  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1598  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  100 
 
 
545 aa  1086    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1864  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  85.24 
 
 
544 aa  944    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1369  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  48.13 
 
 
549 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137682  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1268  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  48.22 
 
 
549 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2580  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  48.13 
 
 
549 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233516  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1280  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  46.45 
 
 
554 aa  465  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4908  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.03 
 
 
559 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0350  NADH dehydrogenase I, M subunit  43.18 
 
 
522 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3914  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.93 
 
 
535 aa  413  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0719914  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3343  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.26 
 
 
519 aa  415  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.36 
 
 
525 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.93 
 
 
535 aa  412  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000144113 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.54 
 
 
555 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2614  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain M  47.2 
 
 
564 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0658114 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3126  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.94 
 
 
535 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.09 
 
 
497 aa  397  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1656  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.7 
 
 
495 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.750988  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  41.45 
 
 
502 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2411  NADH dehydrogenase subunit M  41.45 
 
 
502 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139684  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1295  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.2 
 
 
559 aa  379  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0809  NADH dehydrogenase subunit M  41.26 
 
 
502 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1728  NADH dehydrogenase subunit M  40.33 
 
 
512 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.694351  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1567  NADH dehydrogenase subunit M  40.73 
 
 
510 aa  373  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0145309  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1034  NADH dehydrogenase subunit M  40.59 
 
 
501 aa  375  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1992  NADH dehydrogenase subunit M  41.14 
 
 
513 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2529  NADH dehydrogenase subunit M  41 
 
 
513 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0432269  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0816  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.12 
 
 
497 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.52 
 
 
542 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1037  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.12 
 
 
525 aa  366  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.260264  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1190  NADH dehydrogenase subunit M  41 
 
 
513 aa  365  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.602239  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2873  NADH dehydrogenase subunit M  40.11 
 
 
505 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593537  normal  0.190787 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0442  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.33 
 
 
542 aa  365  2e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.990094  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3286  NADH dehydrogenase subunit M  39.78 
 
 
505 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0790  NADH dehydrogenase subunit M  40.15 
 
 
489 aa  364  2e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0146664  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0902  NADH dehydrogenase subunit M  41.4 
 
 
503 aa  363  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0414  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.04 
 
 
542 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3625  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.15 
 
 
491 aa  363  4e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1304  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.94 
 
 
521 aa  363  5.0000000000000005e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278041  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0759  NADH dehydrogenase subunit M  39.71 
 
 
521 aa  362  9e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3214  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.29 
 
 
514 aa  361  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4621  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.26 
 
 
503 aa  360  3e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0225414 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2586  NADH dehydrogenase subunit M  40.41 
 
 
505 aa  360  5e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal  0.933861 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1328  NADH dehydrogenase subunit M  39.44 
 
 
515 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0365587 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0693  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.66 
 
 
510 aa  356  5e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.378065  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0270  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.96 
 
 
559 aa  356  6.999999999999999e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.256244  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2232  NADH dehydrogenase subunit M  39.89 
 
 
513 aa  355  1e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1195  NADH dehydrogenase subunit M  39.37 
 
 
514 aa  355  1e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0932  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, M subunit  40.71 
 
 
497 aa  354  2e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1248  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.39 
 
 
534 aa  354  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130648  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_803  NADH:quinone oxidoreductase subunit 4 (chain M)  41.12 
 
 
497 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1073  NADH dehydrogenase subunit M  39.55 
 
 
496 aa  353  5e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4402  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.06 
 
 
506 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2618  NADH-quinone oxidoreductase, M subunit  38.66 
 
 
494 aa  352  7e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4138  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.15 
 
 
506 aa  353  7e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.68162  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.66 
 
 
494 aa  352  7e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4549  NADH dehydrogenase subunit M  38.7 
 
 
502 aa  352  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.177769 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1273  NADH dehydrogenase subunit M  39.7 
 
 
503 aa  352  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218995  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1875  NADH dehydrogenase subunit M  38.59 
 
 
502 aa  351  2e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123353  normal  0.162516 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1365  NADH dehydrogenase subunit M  39.16 
 
 
503 aa  351  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288443  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.94 
 
 
522 aa  350  3e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.676502  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0425  NADH dehydrogenase subunit M  39.74 
 
 
496 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1817  NADH dehydrogenase subunit M  39.74 
 
 
496 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1448  NADH dehydrogenase subunit M  39.74 
 
 
496 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1311  NADH dehydrogenase subunit M  39.74 
 
 
496 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1142  NADH dehydrogenase subunit M  39.74 
 
 
496 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400671  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0725  NADH dehydrogenase subunit M  39.74 
 
 
496 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1302  NADH dehydrogenase subunit M  39.74 
 
 
496 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4155  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.78 
 
 
534 aa  350  4e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0166298 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0829  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.59 
 
 
504 aa  350  5e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1108  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.24 
 
 
509 aa  349  8e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1952  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.43 
 
 
507 aa  348  1e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0417902  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2208  NADH dehydrogenase subunit M  38.78 
 
 
502 aa  348  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2386  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.66 
 
 
507 aa  348  2e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0446554  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2820  NADH dehydrogenase subunit M  39.85 
 
 
494 aa  347  3e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2261  NADH dehydrogenase subunit M  39.55 
 
 
496 aa  347  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.796685  normal  0.444802 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1625  NADH dehydrogenase subunit M  39.55 
 
 
496 aa  347  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209377  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2237  NADH dehydrogenase subunit M  39.55 
 
 
496 aa  347  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.759454  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1297  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.23 
 
 
517 aa  346  5e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.310609  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1007  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.22 
 
 
527 aa  346  5e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.244989  normal  0.172272 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1202  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.58 
 
 
527 aa  346  7e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1073  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.58 
 
 
527 aa  346  8e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.397792  normal  0.614174 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5565  NADH dehydrogenase subunit M  39.18 
 
 
496 aa  345  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0400022  normal  0.331028 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2275  NADH dehydrogenase subunit M  39.37 
 
 
496 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229712  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2154  NADH dehydrogenase subunit M  40.3 
 
 
496 aa  345  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.575239  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1040  NADH dehydrogenase subunit M  40.37 
 
 
496 aa  344  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.926201  normal  0.336803 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2819  NADH dehydrogenase subunit M  39.5 
 
 
502 aa  343  4e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3212  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.23 
 
 
517 aa  343  4e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3246  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.57 
 
 
509 aa  342  8e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1059  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.42 
 
 
502 aa  342  9e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.85 
 
 
585 aa  340  2.9999999999999998e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341288  normal  0.991992 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0193  NADH dehydrogenase subunit M  39.49 
 
 
507 aa  340  4e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2416  NADH dehydrogenase subunit M  39.96 
 
 
506 aa  340  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185861  hitchhiker  0.00201163 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0961  NADH dehydrogenase subunit M  39.37 
 
 
494 aa  339  5.9999999999999996e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0280946  normal  0.49186 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2050  NADH dehydrogenase subunit M  40.3 
 
 
488 aa  339  9e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232549  normal  0.0955875 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0150  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.3 
 
 
508 aa  339  9.999999999999999e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000116263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>