More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1526 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0991  adenylosuccinate lyase  83.06 
 
 		 434 aa  736    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1307  adenylosuccinate lyase  87.06 
 
 		 427 aa  774    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.325105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1152  adenylosuccinate lyase  80.71 
 
 		 426 aa  720    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.716556 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1139  adenylosuccinate lyase  82.82 
 
 		 425 aa  738    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.863394  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1526  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 425 aa  877    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1212  adenylosuccinate lyase  81.09 
 
 		 434 aa  706    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1108  adenylosuccinate lyase  81.8 
 
 		 434 aa  722    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.34197  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  58.35 
 
 		 430 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  56.87 
 
 		 431 aa  501  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  56.24 
 
 		 431 aa  503  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  56.87 
 
 		 431 aa  501  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  55.92 
 
 		 431 aa  494  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  56.24 
 
 		 430 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  55.97 
 
 		 433 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  55.27 
 
 		 435 aa  489  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  55.27 
 
 		 435 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  55.27 
 
 		 435 aa  489  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  55.04 
 
 		 435 aa  488  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  55.04 
 
 		 435 aa  488  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  55.27 
 
 		 435 aa  490  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  55.27 
 
 		 435 aa  491  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  55.29 
 
 		 431 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  55.04 
 
 		 435 aa  488  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  55.04 
 
 		 435 aa  488  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  55.27 
 
 		 435 aa  490  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  54.35 
 
 		 434 aa  490  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  55.92 
 
 		 431 aa  486  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  55.45 
 
 		 431 aa  485  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  55.06 
 
 		 432 aa  485  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  56.71 
 
 		 430 aa  488  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  54.82 
 
 		 430 aa  484  1e-135  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  53.41 
 
 		 431 aa  479  1e-134  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  56.87 
 
 		 437 aa  481  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  56.47 
 
 		 431 aa  475  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  54.74 
 
 		 431 aa  478  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  51.29 
 
 		 431 aa  477  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  52.71 
 
 		 431 aa  473  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  52.71 
 
 		 431 aa  473  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  54.59 
 
 		 431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3743  adenylosuccinate lyase  53.76 
 
 		 422 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.391342 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  54.27 
 
 		 431 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  53.18 
 
 		 451 aa  467  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  52.71 
 
 		 451 aa  465  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  53.55 
 
 		 431 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  52.71 
 
 		 451 aa  464  1e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  53.76 
 
 		 431 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  53.19 
 
 		 431 aa  461  1e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  53.76 
 
 		 431 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4928  adenylosuccinate lyase  52.47 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000014766  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  52.86 
 
 		 431 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  53.76 
 
 		 438 aa  459  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1842  adenylosuccinate lyase  53.18 
 
 		 450 aa  455  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.333164 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  55.06 
 
 		 435 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1648  adenylosuccinate lyase  51.18 
 
 		 431 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  54.59 
 
 		 435 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  51.76 
 
 		 430 aa  452  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  51.53 
 
 		 431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  52.58 
 
 		 431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2417  adenylosuccinate lyase  53.41 
 
 		 433 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12659  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  54.25 
 
 		 432 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1721  adenylosuccinate lyase  50.95 
 
 		 431 aa  450  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  50.35 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  54.12 
 
 		 445 aa  451  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2356  adenylosuccinate lyase  53.79 
 
 		 435 aa  451  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2464  adenylosuccinate lyase  52.49 
 
 		 438 aa  449  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.495777  hitchhiker  0.00480262 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  51.06 
 
 		 430 aa  450  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  55.06 
 
 		 435 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  53.18 
 
 		 433 aa  449  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1990  adenylosuccinate lyase  53.79 
 
 		 435 aa  451  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  52.94 
 
 		 438 aa  451  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3410  adenylosuccinate lyase  52.25 
 
 		 431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000391938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  53.88 
 
 		 435 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1804  adenylosuccinate lyase  50.95 
 
 		 431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  50.35 
 
 		 432 aa  448  1.0000000000000001e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1468  adenylosuccinate lyase  51.77 
 
 		 432 aa  444  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3011  adenylosuccinate lyase  52.73 
 
 		 431 aa  444  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  52.24 
 
 		 434 aa  443  1e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0849  adenylosuccinate lyase  53.65 
 
 		 433 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  53.18 
 
 		 434 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0426  adenylosuccinate lyase  52.37 
 
 		 430 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  52.94 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0841  adenylosuccinate lyase  53.65 
 
 		 433 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  52.24 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  52.24 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  50 
 
 		 431 aa  436  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  51.53 
 
 		 435 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  52.71 
 
 		 434 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0716  adenylosuccinate lyase  51.76 
 
 		 437 aa  436  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  52.71 
 
 		 434 aa  438  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  52.24 
 
 		 435 aa  437  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3102  adenylosuccinate lyase  52.37 
 
 		 436 aa  434  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.611529  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6842  adenylosuccinate lyase  54.35 
 
 		 435 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0469  adenylosuccinate lyase  51.6 
 
 		 431 aa  433  1e-120  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.802188  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2209  adenylosuccinate lyase  50.99 
 
 		 431 aa  433  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.895264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1095  adenylosuccinate lyase  52 
 
 		 435 aa  432  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2569  adenylosuccinate lyase  51.06 
 
 		 435 aa  431  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1011  adenylosuccinate lyase  50.82 
 
 		 434 aa  433  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0095  adenylosuccinate lyase  51.66 
 
 		 436 aa  431  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04631  adenylosuccinate lyase  49.3 
 
 		 431 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16551  adenylosuccinate lyase  49.39 
 
 		 431 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>